Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr1 104116913 . G A CCDS782.1:NM_020978.4:c.776aGc>aAc_NP_066188.1:p.259S>N Homo sapiens amylase, alpha 2B (pancreatic) (AMY2B), mRNA.
pdb_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id
alphafold_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
3old 1 P04746 98.99 0.0 X-RAY
2011-04-13 SER A:244 A:244 4.0 0.035 G -57.7 -39.1 4.0 0.035 0.0 GLC
HOH
9.899
2.895
OG
OG
O2
O
3ole 1 P04746 98.99 0.0 X-RAY
2011-04-13 SER A:244 A:244 5.0 0.043 G -56.7 -36.3 5.0 0.043 0.0 HOH
2.909
OG
O
3olg 1 P04746 98.99 0.0 X-RAY
2011-04-13 SER A:244 A:244 5.0 0.043 G -55.6 -39.9 5.0 0.043 0.0 GLC
HOH
9.968
3.126
OG
OG
O2
O
3oli 1 P04746 98.99 0.0 X-RAY
2011-04-13 SER A:244 A:244 6.0 0.052 G -57.0 -36.0 6.0 0.052 0.0 HOH
3.002
OG
O
6z8l 1 P04746 98.79 0.0 X-RAY
2020-12-02 SER A:244 A:244 9.0 0.078 G -53.1 -39.0 9.0 0.078 0.0 GLC
HOH
9.661
2.266
HB3
HG
HO2
O
1b2y 1 P04746 98.79 0.0 X-RAY
2000-02-16 SER A:244 A:244 6.0 0.052 G -65.6 -27.3 6.0 0.052 0.0 HOH
3.461
N
O
1bsi 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
1999-05-18 SER A:244 A:244 5.0 0.043 G -65.3 -23.3 5.0 0.043 0.0 HOH
3.045
OG
O
1cpu 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
1999-06-14 SER A:244 A:244 7.0 0.061 G -64.5 -26.7 7.0 0.061 0.0 HOH
2.884
OG
O
1hny 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
1996-03-08 SER A:244 A:244 7.0 0.061 G -63.6 -29.7 7.0 0.061 0.0 HOH
3.159
OG
O
1u2y 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2004-09-07 SER A:244 A:244 8.0 0.07 G -64.7 -21.9 8.0 0.07 0.0 HOH
2.695
OG
O
1u30 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2004-09-07 SER A:244 A:244 5.0 0.043 G -68.4 -16.3 5.0 0.043 0.0 HOH
2.987
OG
O
1u33 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2004-09-07 SER A:244 A:244 4.0 0.035 G -61.1 -19.9 4.0 0.035 0.0 HOH
2.755
OG
O
1xcw 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2004-12-07 SER A:244 A:244 6.0 0.052 G -65.1 -24.6 6.0 0.052 0.0 HOH
2.813
OG
O
1xcx 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2004-12-07 SER A:244 A:244 4.0 0.035 G -65.8 -21.9 4.0 0.035 0.0 HOH
2.844
OG
O
1xd0 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2004-12-07 SER A:244 A:244 6.0 0.052 G -62.8 -24.4 6.0 0.052 0.0 HOH
2.838
OG
O
1xd1 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2004-12-07 SER A:244 A:244 5.0 0.043 G -64.3 -19.7 5.0 0.043 0.0 HOH
3.172
OG
O
2qmk 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2008-03-25 SER A:244 A:244 9.0 0.078 G -71.7 -24.9 9.0 0.078 0.0 HOH
2.448
OG
O
2qv4 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2008-03-25 SER A:244 A:244 4.0 0.035 G -64.3 -19.9 4.0 0.035 0.0 HOH
2.912
OG
O
3bai 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2008-03-25 SER A:244 A:244 6.0 0.052 G -64.4 -22.8 6.0 0.052 0.0 HOH
2.877
OG
O
3baj 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2008-03-25 SER A:244 A:244 6.0 0.052 G -67.1 -23.7 6.0 0.052 0.0 HOH
2.731
OG
O
3baw 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2008-03-25 SER A:244 A:244 6.0 0.052 G -62.3 -24.5 6.0 0.052 0.0 AZI
HOH
8.586
2.956
CB
OG
N3
O
3ij7 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2009-10-27 SER A:244 A:244 5.0 0.043 G -62.6 -24.5 5.0 0.043 0.0 HOH
2.962
OG
O
3ij8 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2009-10-27 SER A:244 A:244 7.0 0.061 G -60.6 -29.9 7.0 0.061 0.0 B0D
HOH
8.686
2.720
O
OG
O6
O
3ij9 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2009-10-27 SER A:244 A:244 5.0 0.043 G -60.8 -24.9 5.0 0.043 0.0 B0D
HOH
8.667
2.886
O
OG
O6
O
4gqq 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2012-10-24 SER A:244 A:244 1.0 0.009 G -63.1 -26.1 1.0 0.009 0.0 0XR
HOH
3.709
2.696
N
OG
C5
O
4gqr 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2012-10-24 SER A:244 A:244 5.0 0.043 G -63.8 -18.7 5.0 0.043 0.0 HOH
2.741
OG
O
4w93 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2015-07-15 SER A:244 A:244 4.0 0.035 G -49.1 -39.3 4.0 0.035 0.0 3L9
HOH
8.746
2.848
OG
OG
O2A
O
4x9y 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2014-12-31 SER A:244 A:244 5.0 0.043 G -66.3 -19.9 5.0 0.043 0.0 HOH
2.718
HG
O
5e0f 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2016-09-07 SER A:244 A:244 7.0 0.061 G -63.9 -22.9 7.0 0.061 0.0 HOH
2.632
HG
O
5emy 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2016-07-06 SER A:244 A:244 6.0 0.052 G -65.6 -21.8 6.0 0.052 0.0 HOH
1.915
HG
O
5kez 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2017-03-29 SER A:244 A:244 6.0 0.052 G -64.2 -26.1 6.0 0.052 0.0 HOH
5.209
CB
O
5u3a 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2017-12-06 SER A:244 A:244 4.0 0.035 G -64.8 -21.9 4.0 0.035 0.0 HOH
4.695
H
O
5va9 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2018-03-28 SER A:244 A:244 6.0 0.052 G -62.6 -21.9 6.0 0.052 0.0 HOH
4.966
CB
O
SER B:244 B:244 4.0 0.035 G -62.4 -20.4 NA NA NA
6obx 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2020-02-12 SER A:244 A:244 4.0 0.035 G -64.4 -22.5 4.0 0.035 0.0 HOH
3.197
H
O
6ocn 1 P04746 98.59 0.0 X-RAY
2020-02-12 SER A:244 A:244 5.0 0.043 G -64.4 -22.1 5.0 0.043 0.0 HOH
3.194
H
O
1xgz 1 P04746 98.39 0.0 X-RAY
2005-05-24 SER A:244 A:244 6.0 0.052 G -65.6 -18.3 6.0 0.052 0.0 HOH
2.810
OG
O
1xh0 1 P04746 98.39 0.0 X-RAY
2005-05-24 SER A:244 A:244 4.0 0.035 G -64.2 -22.2 4.0 0.035 0.0 HOH
2.756
OG
O
1xh1 1 P04746 98.39 0.0 X-RAY
2005-05-24 SER A:244 A:244 5.0 0.043 G -66.8 -20.0 5.0 0.043 0.0 HOH
2.910
OG
O
1xh2 1 P04746 98.39 0.0 X-RAY
2005-05-24 SER A:244 A:244 7.0 0.061 G -68.2 -14.7 7.0 0.061 0.0 HOH
3.032
OG
O
3bak 1 P04746 98.39 0.0 X-RAY
2008-03-25 SER A:244 A:244 8.0 0.07 G -65.2 -22.8 8.0 0.07 0.0 HOH
2.815
OG
O
3bax 1 P04746 98.39 0.0 X-RAY
2008-03-25 SER A:244 A:244 6.0 0.052 G -64.3 -24.6 6.0 0.052 0.0 AZI
HOH
8.694
2.939
CB
OG
N3
O
3bay 1 P04746 98.39 0.0 X-RAY
2008-03-25 SER A:244 A:244 8.0 0.07 G -68.2 -22.8 8.0 0.07 0.0 HOH
2.554
OG
O
1kgw 1 P04746 98.39 0.0 X-RAY
2002-01-16 SER A:244 A:244 10.0 0.087 G -64.5 -26.2 10.0 0.087 0.0 HOH
3.486
OG
O
2cpu 1 P04746 98.39 0.0 X-RAY
2001-06-30 SER A:244 A:244 4.0 0.035 G -68.9 -18.4 4.0 0.035 0.0 HOH
3.112
OG
O
3cpu 1 P04746 98.39 0.0 X-RAY
2001-06-30 SER A:244 A:244 2.0 0.017 G -53.8 -41.1 2.0 0.017 0.0 HOH
3.153
OG
O
5td4 1 P04746 98.39 0.0 X-RAY
2016-11-02 SER A:244 A:244 5.0 0.043 G -62.9 -24.7 5.0 0.043 0.0 HOH
3.950
OG
O
1kgx 1 P04746 98.39 0.0 X-RAY
2002-01-16 SER A:244 A:244 8.0 0.07 G -66.3 -17.6 8.0 0.07 0.0 HOH
3.039
OG
O
1kbb 1 P04746 98.39 0.0 X-RAY
2002-04-10 SER A:244 A:244 8.0 0.07 G -60.4 -25.7 8.0 0.07 0.0 HOH
3.189
OG
O
1kgu 1 P04746 98.39 0.0 X-RAY
2002-01-16 SER A:244 A:244 3.0 0.026 G -55.8 -40.1 3.0 0.026 0.0 HOH
3.098
OG
O
1kb3 1 P04746 98.39 0.0 X-RAY
2002-05-01 SER A:244 A:244 9.0 0.078 G -69.1 -19.8 9.0 0.078 0.0 HOH
2.905
OG
O
1kbk 1 P04746 98.39 0.0 X-RAY
2002-04-10 SER A:244 A:244 7.0 0.061 G -66.3 -20.7 7.0 0.061 0.0 HOH
2.963
OG
O
1c8q 1 P04745 97.58 0.0 X-RAY
2001-06-13 SER A:244 A:244 6.0 0.052 G -56.8 -35.0 6.0 0.052 0.0 HOH
3.568
N
O
1mfv 1 P04745 97.58 0.0 X-RAY
2002-11-20 SER A:244 A:244 9.0 0.078 G -58.4 -36.5 9.0 0.078 0.0 HOH
3.136
OG
O
1smd 1 P04745 97.58 0.0 X-RAY
1996-07-11 SER A:244 A:244 7.0 0.061 G -59.0 -34.5 7.0 0.061 0.0 HOH
3.902
OG
O
1xv8 1 P04745 97.58 0.0 X-RAY
2005-10-11 SER A:244 A:244 4.0 0.035 G -44.6 -49.6 4.0 0.035 0.0 HOH
3.570
N
O
SER B:244 B:244 4.0 0.035 G -44.6 -49.6 4.0 0.035 0.0 HOH
3.570
N
O
1q4n 1 P04745 97.38 0.0 X-RAY
2004-03-16 SER A:244 X:244 7.0 0.061 G -52.6 -38.7 7.0 0.061 0.0 HOH
2.700
OG
O
1z32 1 P04745 97.38 0.0 X-RAY
2005-05-31 SER A:244 X:244 6.0 0.052 G -52.5 -40.6 6.0 0.052 0.0 HOH
2.878
OG
O
1jxj 1 P04745 97.38 0.0 X-RAY
2001-09-14 SER A:244 A:244 7.0 0.061 G -50.9 -44.0 7.0 0.061 0.0 HOH
2.735
OG
O
1nm9 1 P04745 97.38 0.0 X-RAY
2004-01-20 SER A:244 A:244 7.0 0.061 G -50.5 -42.0 7.0 0.061 0.0 GLC
HOH
9.859
2.818
OG
OG
O2
O
3blk 1 P04745 97.38 0.0 X-RAY
2008-11-25 SER A:244 A:244 10.0 0.087 G -54.3 -34.0 10.0 0.087 0.0 HOH
3.613
OG
O
3blp 1 P04745 97.38 0.0 X-RAY
2008-11-18 SER A:244 X:244 11.0 0.096 G -52.9 -38.8 11.0 0.096 0.0 HOH
2.962
OG
O
1jxk 1 P04745 96.57 0.0 X-RAY
2001-09-14 SER A:244 A:244 5.0 0.043 G -56.3 -38.6 5.0 0.043 0.0 HOH
2.859
OG
O
1mfu 1 P04745 96.57 0.0 X-RAY
2002-11-20 SER A:244 A:244 5.0 0.043 G -51.4 -44.5 5.0 0.043 0.0 HOH
2.803
OG
O
3dhp 1 P04745 96.37 0.0 X-RAY
2008-07-01 SER A:244 A:244 5.0 0.043 G -53.0 -37.7 5.0 0.043 0.0 HOH
5.551
N
O
1kxq 1 P00690 87.1 0.0 X-RAY
2002-06-19 SER A:244 A:244 9.0 0.078 G -59.6 -27.4 9.0 0.078 0.0 HOH
2.785
OG
O
SER B:244 B:244 9.0 0.078 G -59.8 -32.0 NA NA NA
SER C:244 C:244 8.0 0.07 G -58.7 -30.6 NA NA NA
SER D:244 D:244 8.0 0.07 G -60.7 -30.3 NA NA NA
1kxt 1 P00690 87.1 0.0 X-RAY
2002-06-19 SER A:244 A:244 8.0 0.07 G -60.5 -31.3 8.0 0.07 0.0 HOH
3.023
OG
O
SER C:244 C:244 11.0 0.096 G -71.5 -26.8 NA NA NA
SER E:244 E:244 8.0 0.07 G -57.0 -27.1 NA NA NA
1kxv 1 P00690 87.1 0.0 X-RAY
2002-06-19 SER A:244 A:244 11.0 0.096 G -61.6 -31.6 9.0 0.078 0.018 C:None:0.017
HOH
2.986
OG
O
SER B:244 B:244 6.0 0.052 G -56.9 -35.7 NA NA NA
1dhk 1 P00690 87.1 0.0 X-RAY
1997-12-24 SER A:244 A:244 12.0 0.104 G -58.9 -33.8 12.0 0.104 0.0 HOH
1.993
HG
H2
1ppi 1 P00690 87.1 0.0 X-RAY
1995-05-24 SER A:244 A:244 6.0 0.052 G -60.5 -40.2 6.0 0.052 0.0 HOH
2.715
OG
O
3l2l 1 P00690 86.9 0.0 X-RAY
2010-04-14 SER A:244 A:244 10.0 0.087 G -59.8 -29.2 10.0 0.087 0.0 HOH
3.524
HG
O
3l2m 1 P00690 86.9 0.0 X-RAY
2010-04-14 SER A:244 A:244 9.0 0.078 G -64.1 -23.2 9.0 0.078 0.0 HOH
3.699
HG
O
1ua3 1 P00690 86.9 0.0 X-RAY
2003-10-14 SER A:244 A:244 5.0 0.043 G -47.0 -41.8 5.0 0.043 0.0 HOH
2.796
OG
O
1vah 1 P00690 86.9 0.0 X-RAY
2005-04-26 SER A:244 A:244 7.0 0.061 G -58.4 -37.5 7.0 0.061 0.0 HOH
2.806
OG
O
1jfh 1 P00690 86.9 0.0 X-RAY
1998-12-02 SER A:244 A:244 7.0 0.061 G -57.2 -34.8 7.0 0.061 0.0 HOH
2.877
OG
O
1ose 1 P00690 86.69 0.0 X-RAY
1997-04-01 SER A:244 A:244 8.0 0.07 G -61.8 -27.0 8.0 0.07 0.0 HOH
2.820
OG
O
1hx0 1 P00690 86.69 0.0 X-RAY
2001-08-08 SER A:244 A:244 6.0 0.052 G -48.8 -38.6 6.0 0.052 0.0 HOH
2.890
OG
O
1wo2 1 P00690 86.69 0.0 X-RAY
2005-03-15 SER A:244 A:244 8.0 0.07 G -61.0 -29.9 8.0 0.07 0.0 HOH
2.889
OG
O
1bvn 1 P00690 86.69 0.0 X-RAY
1998-09-23 SER A:244 P:244 9.0 0.078 G -61.1 -25.0 9.0 0.078 0.0 HOH
3.141
OG
O
1pif 1 P00690 86.49 0.0 X-RAY
1996-12-07 SER A:244 A:244 7.0 0.061 G -57.3 -39.8 7.0 0.061 0.0 HOH
2.860
OG
O
1pig 1 P00690 86.49 0.0 X-RAY
1996-12-07 SER A:244 A:244 7.0 0.061 G -56.3 -36.6 7.0 0.061 0.0 GLC
HOH
9.979
2.821
OG
OG
O2
O
4x0n 1 P00690 86.49 0.0 X-RAY
2015-11-25 SER A:244 A:244 8.0 0.07 G -59.4 -32.1 8.0 0.07 0.0 HOH
2.768
OG
O

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p19961-f1 1 P19961 100.0 0.0 SER A:259 A:259 9.0 0.078 G -53.3 -31.1
af-p04746-f1 1 P04746 98.83 0.0 SER A:259 A:259 2.0 0.017 G -57.7 -29.6
af-p0dte7-f1 1 P0DTE7 97.46 0.0 SER A:259 A:259 9.0 0.078 G -54.1 -31.2
af-p0dte8-f1 1 P0DTE8 97.46 0.0 SER A:259 A:259 10.0 0.087 G -54.5 -31.1
af-p0dub6-f1 1 P0DUB6 97.46 0.0 SER A:259 A:259 9.0 0.078 G -54.5 -30.9