Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr12 | 69203017 | . | C | A | CCDS8986.2:NM_002392.5:c.44cCt>cAt_NP_002383.2:p.15P>H | Homo sapiens MDM2 proto-oncogene (MDM2), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 5swk | 1 | Q00987 | 99.34 | 3e-105 |
X-RAY |
2017-10-18 | PRO | A:12 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PRO | B:12 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2lzg | 1 | Q00987 | 100.0 | 2e-86 |
NMR |
2012-11-07 | PRO | A:9 | A:9 | 25.0 | 0.172 | -76.8 | 130.1 | 25.0 | 0.172 | 0.0 | |||||||
| 5j7f | 1 | Q00987 | 100.0 | 2e-86 |
X-RAY |
2017-05-17 | PRO | A:9 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PRO | B:9 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| PRO | C:9 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| PRO | D:9 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4hbm | 1 | Q00987 | 100.0 | 5e-82 |
X-RAY |
2012-10-17 | PRO | A:4 | A:9 | 93.0 | 0.641 | S | -62.6 | -35.2 | 93.0 | 0.641 | 0.0 |
HOH |
2.851 |
O |
O |
||
| PRO | B:4 | B:9 | 123.0 | 0.848 | 42.5 | 74.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | C:4 | C:9 | 103.0 | 0.71 | -61.5 | -56.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| PRO | D:4 | D:9 | 96.0 | 0.662 | S | -60.8 | -43.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| PRO | E:4 | E:9 | 98.0 | 0.676 | S | -57.5 | -44.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| PRO | F:4 | F:9 | 93.0 | 0.641 | S | -67.1 | -39.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| PRO | G:4 | G:9 | 86.0 | 0.593 | S | -61.5 | -49.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| PRO | H:4 | H:9 | 92.0 | 0.634 | -78.1 | -38.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5wts | 2 | Q00987 | 100.0 | 9e-82 |
X-RAY |
2017-12-20 | PRO | B:6 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6aaw | 1 | Q00987 | 100.0 | 9e-82 |
X-RAY |
2019-07-24 | PRO | A:6 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6im9 | 2 | Q00987 | 100.0 | 9e-82 |
X-RAY |
2019-03-20 | PRO | B:6 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6kzu | 1 | Q00987 | 100.0 | 9e-82 |
X-RAY |
2019-10-16 | PRO | A:6 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 4umn | 1 | Q00987 | 99.17 | 6e-81 |
X-RAY |
2014-05-28 | PRO | A:4 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PRO | B:4 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5xxk | 1 | Q00987 | 99.17 | 1e-80 |
X-RAY |
2017-12-27 | PRO | A:6 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| PRO | B:6 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2mps | 1 | Q00987 | 100.0 | 8e-73 |
NMR |
2015-06-03 | PRO | A:7 | A:9 | 115.0 | 0.793 | -61.2 | 134.4 | 115.0 | 0.793 | 0.0 | |||||||
| 4ode | 1 | Q00987 | 100.0 | 9e-71 |
X-RAY |
2014-04-02 | PRO | A:4 | A:9 | 79.0 | 0.545 | S | -63.9 | -27.2 | 79.0 | 0.545 | 0.0 |
2U0 SO4 HOH |
8.745 8.268 3.312 |
CD CD CB |
C29 O4 O |
||
| 4odf | 1 | Q00987 | 100.0 | 9e-71 |
X-RAY |
2014-04-02 | PRO | A:4 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 4ogn | 1 | Q00987 | 100.0 | 9e-71 |
X-RAY |
2014-04-02 | PRO | A:4 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 4ogt | 1 | Q00987 | 100.0 | 9e-71 |
X-RAY |
2014-04-02 | PRO | A:4 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 4wt2 | 1 | Q00987 | 100.0 | 9e-71 |
X-RAY |
2014-12-03 | PRO | A:4 | A:9 | 78.0 | 0.538 | E | -71.6 | -22.1 | 78.0 | 0.538 | 0.0 |
3UD SO4 HOH |
8.576 8.323 3.339 |
CD CD CB |
C15 O4 O |
||
| 2ruh | 1 | Q00987 | 98.98 | 2e-64 |
NMR |
2014-10-15 | PRO | A:27 | A:15 | 82.0 | 0.566 | -66.2 | 142.1 | 82.0 | 0.566 | 0.0 | |||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-q00987-f1 | 1 | Q00987 | 100.0 | 0.0 | PRO | A:9 | A:9 | 120.0 | 0.828 | -74.8 | 122.7 | ||