Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr19 | 44160771 | . | C | A | CCDS33041.1:NM_001005376.2:c.332cGa>cTa_NP_001005376.1:p.111R>L | Homo sapiens plasminogen activator, urokinase receptor (PLAUR), transcript variant 1, mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
1ywh | 1 | Q9UMV0 | 99.68 | 0.0 |
X-RAY |
2005-05-10 | ARG | A:89 | A:89 | 146.0 | NA | 360.0 | -163.9 | 144.0 | NA | NA |
I:Q9UMV0:NA |
FUC NAG HOH |
9.726 8.832 4.181 |
O O CA |
O3 O6 O |
||
ARG | C:89 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | E:89 | E:89 | 141.0 | NA | 360.0 | 90.2 | 106.0 | NA | NA |
M:Q9UMV0:NA |
HOH |
2.486 |
N |
O |
|||||||||
ARG | G:89 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | I:89 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | K:89 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | M:89 | M:89 | 218.0 | 0.969 | -49.0 | -59.9 | 196.0 | 0.871 | 0.098 |
G:Q9UMV0:0.098 |
FUC FUC HOH |
7.994 7.213 7.922 |
NH2 NH1 O |
O3 C6 O |
|||||||||
ARG | O:89 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
4qti | 3 | Q03405 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-02-25 | ARG | C:89 | U:89 | 180.0 | 0.8 | -95.1 | 123.7 | 32.0 | 0.142 | 0.658 |
B:None:0.191 A:None:0.52 |
||||||
3bt1 | 3 | Q03405 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2008-03-25 | ARG | C:91 | U:89 | 212.0 | 0.942 | S | -79.3 | -15.6 | 212.0 | 0.942 | 0.0 | ||||||
3bt2 | 5 | Q03405 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2008-03-25 | ARG | E:91 | U:89 | 129.0 | 0.573 | -130.1 | -72.9 | 103.0 | 0.458 | 0.115 |
B:P04004:0.116 |
||||||
4k24 | 5 | Q03405 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2014-02-26 | ARG | E:91 | U:89 | 173.0 | 0.769 | -58.5 | -73.1 | 165.0 | 0.733 | 0.036 |
B:P04004:0.036 |
||||||
3u73 | 1 | Q03405 | 99.29 | 0.0 |
X-RAY |
2012-04-18 | ARG | A:89 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
3u74 | 1 | Q03405 | 99.29 | 0.0 |
X-RAY |
2012-04-18 | ARG | A:89 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
7e17 | 1 | Q03405 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-12-22 | ARG | A:91 | A:89 | 168.0 | 0.747 | -162.3 | 121.3 | 104.0 | 0.462 | 0.285 |
B:Q03405:0.284 |
||||||
ARG | B:91 | B:89 | 180.0 | 0.8 | -153.7 | 128.9 | 115.0 | 0.511 | 0.289 |
A:Q03405:0.289 |
|||||||||||||
7v63 | 1 | Q03405 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-12-22 | ARG | A:91 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ARG | B:91 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
2fd6 | 4 | Q03405 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2006-02-21 | ARG | D:90 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
2i9b | 2 | Q03405 | 98.56 | 0.0 |
X-RAY |
2007-01-02 | ARG | E:91 | E:89 | 104.0 | 0.462 | -111.3 | 163.0 | 104.0 | 0.462 | 0.0 | |||||||
ARG | F:91 | F:89 | 103.0 | 0.458 | -110.1 | 160.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ARG | G:91 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | H:91 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-q03405-f1 | 1 | Q03405 | 100.0 | 0.0 | ARG | A:111 | A:111 | 251.0 | 1.0 | S | -63.5 | -5.6 |