Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr3 10183713 . C A CCDS2597.1:NM_000551.3:c.182cCc>cAc_NP_000542.1:p.61P>H Homo sapiens von Hippel-Lindau tumor suppressor (VHL), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id
alphafold_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
4wqo 1 P40337 100.0 4e-156 X-RAY
2015-03-04 PRO A:81 A:61 53.0 0.366 -72.2 158.4 53.0 0.366 0.0
7q2j 3 P40337 94.25 1e-118 X-RAY
2021-11-24 PRO C:45 C:61 62.0 0.428 -54.1 154.0 62.0 0.428 0.0
4b9k 3 P40337 95.32 3e-118 X-RAY
2012-10-24 PRO C:19 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:19 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:19 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:19 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1lqb 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2002-07-03 PRO C:10 C:61 114.0 0.786 360.0 125.9 114.0 0.786 0.0 HOH
3.939
C
O
3ztd 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2012-07-25 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4b95 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2012-10-24 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4bks 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2013-11-27 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4bkt 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2013-11-27 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9c 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9d 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9e 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9f 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9g 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9h 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9i 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9j 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9k 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4w9l 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2014-09-10 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5lli 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2016-11-09 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nvv 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nvw 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nvx 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nvy 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nvz 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nw0 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nw1 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5nw2 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-09-20 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5t35 4 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2017-03-08 PRO D:10 D:61 121.0 0.834 360.0 -175.4 121.0 0.834 0.0
PRO H:10 H:61 113.0 0.779 360.0 -176.1 NA NA NA
6bvb 1 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-08-01 PRO A:10 V:61 59.0 0.407 -57.4 149.6 59.0 0.407 0.0 HOH
2.725
HA
O
6gfy 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-07-11 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gfz 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-07-11 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gmn 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-08-08 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gmn 5 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-08-08 PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gmq 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-08-22 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gmx 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2018-08-08 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6hax 2 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2019-06-12 PRO B:10 B:61 62.0 0.428 -69.2 173.2 62.0 0.428 0.0 HOH
3.401
CB
O
PRO F:10 F:61 103.0 0.71 360.0 138.0 NA NA NA
6hay 2 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2019-06-12 PRO B:10 B:61 51.0 0.352 S -68.4 164.0 51.0 0.352 0.0 HOH
3.246
CB
O
PRO F:10 F:61 56.0 0.386 S -66.5 163.9 NA NA NA
6sis 4 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2019-12-04 PRO D:10 D:61 124.0 0.855 360.0 159.9 124.0 0.855 0.0
PRO H:10 H:61 125.0 0.862 360.0 160.1 NA NA NA
7jto 4 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2021-10-06 PRO D:10 L:61 72.0 0.497 -60.8 127.8 72.0 0.497 0.0 HOH
2.163
O
O
7jtp 3 P40337 99.38 4e-117 X-RAY
2021-10-06 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3zrc 3 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2012-03-07 PRO C:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3zrf 3 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2012-03-07 PRO C:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3ztc 3 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2012-07-25 PRO C:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3zun 3 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2012-07-25 PRO C:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4ajy 4 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2012-11-14 PRO D:11 V:61 63.0 0.434 -66.6 164.8 63.0 0.434 0.0 HOH
2.777
O
O
4awj 3 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2012-11-14 PRO C:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:11 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gmr 4 P40337 98.77 4e-117 X-RAY
2018-08-08 PRO D:11 V:61 57.0 0.393 -60.5 150.1 57.0 0.393 0.0 HOH
3.629
CA
O
1lm8 3 P40337 100.0 6e-117 X-RAY
2002-06-12 PRO C:8 V:61 106.0 0.731 -72.6 -14.9 106.0 0.731 0.0 HOH
3.047
CD
O
1vcb 3 P40337 100.0 6e-117 X-RAY
1999-04-21 PRO C:8 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:8 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:8 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:8 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5n4w 2 P40337 100.0 6e-117 X-RAY
2017-06-07 PRO B:8 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6gfx 3 P40337 100.0 6e-117 X-RAY
2018-07-11 PRO C:8 C:61 114.0 0.786 360.0 159.6 114.0 0.786 0.0 HOH
2.803
O
O
6i7q 4 P40337 100.0 6e-117 X-RAY
2019-11-27 PRO D:8 V:61 36.0 0.248 -61.6 135.3 36.0 0.248 0.0 HOH
2.669
HA
O
6i7r 4 P40337 100.0 6e-117 X-RAY
2019-11-27 PRO D:8 V:61 63.0 0.434 -65.4 148.9 63.0 0.434 0.0 HOH
3.227
HB3
O
6r7f 9 P40337 100.0 6e-117 EM
2019-08-28 PRO I:8 V:61 70.0 0.483 -71.9 156.4 70.0 0.483 0.0
7khh 3 P40337 100.0 6e-116 X-RAY
2021-02-24 PRO C:23 C:61 105.0 0.724 360.0 140.1 105.0 0.724 0.0 HOH
4.573
CB
O
7cjb 1 P40337 100.0 8e-116 X-RAY
2021-07-14 PRO A:11 A:61 67.0 0.462 -56.6 140.7 67.0 0.462 0.0
PRO E:11 E:61 62.0 0.428 -58.4 143.2 NA NA NA
PRO I:11 I:61 117.0 0.807 360.0 140.5 NA NA NA
PRO M:11 M:61 102.0 0.703 360.0 140.4 NA NA NA
6zhc 1 P40337 100.0 4e-113 X-RAY
2020-08-05 PRO A:3 AAA:61 50.0 0.345 -53.0 142.2 50.0 0.345 0.0 QL8
EDO
IOD
IOD
HOH
9.828
6.187
9.071
7.226
3.473
CD
CG
CD
CD
CG
C44
O1
I
I
O
7pi4 1 P40337 100.0 4e-113 X-RAY
2021-09-29 PRO A:3 AAA:61 64.0 0.441 -57.6 133.3 64.0 0.441 0.0 HOH
4.479
CB
O
6fmi 3 P40337 99.34 1e-109 X-RAY
2018-04-11 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6fmj 3 P40337 99.34 1e-109 X-RAY
2018-04-11 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6fmk 3 P40337 99.34 1e-109 X-RAY
2018-04-11 PRO C:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO I:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO L:10 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6hr2 2 P40337 100.0 3e-108 X-RAY
2019-06-12 PRO B:1 B:61 116.0 0.8 360.0 149.5 116.0 0.8 0.0 HOH
2.578
HA
O
PRO F:1 F:61 114.0 0.786 360.0 148.2 NA NA NA
6r6h 12 P40337 100.0 3e-107 EM
2019-08-28 PRO L:2 V:61 78.0 0.538 -68.9 -172.3 77.0 0.531 0.007 F:Q7L5N1:0.007

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p40337-f1 1 P40337 100.0 2e-156 PRO A:61 A:61 61.0 0.421 -59.3 143.1