Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr3 | 10191593 | . | A | C | CCDS2597.1:NM_000551.3:c.586Aaa>Caa_NP_000542.1:p.196K>Q | Homo sapiens von Hippel-Lindau tumor suppressor (VHL), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 4wqo | 1 | P40337 | 100.0 | 4e-156 |
X-RAY |
2015-03-04 | LYS | A:216 | A:196 | 89.0 | 0.445 | H | -65.4 | -33.9 | 89.0 | 0.445 | 0.0 | ||||||
| 7q2j | 3 | P40337 | 94.25 | 1e-118 |
X-RAY |
2021-11-24 | LYS | C:180 | C:196 | 68.0 | NA | H | -61.7 | 5.7 | 68.0 | NA | NA |
HOH |
4.512 |
CB |
O |
||
| 4b9k | 3 | P40337 | 95.32 | 3e-118 |
X-RAY |
2012-10-24 | LYS | C:154 | C:196 | 40.0 | NA | H | -67.2 | -32.0 | 40.0 | NA | NA |
HOH |
3.357 |
CB |
O |
||
| LYS | F:154 | F:196 | 40.0 | NA | H | -66.7 | -43.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:154 | I:196 | 47.0 | NA | H | -65.8 | -36.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:154 | L:196 | 47.0 | NA | H | -65.2 | -33.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1lqb | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2002-07-03 | LYS | C:145 | C:196 | 52.0 | 0.26 | H | -59.6 | -37.7 | 52.0 | 0.26 | 0.0 |
HOH |
6.843 |
N |
O |
||
| 3ztd | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2012-07-25 | LYS | C:145 | C:196 | 47.0 | NA | H | -43.2 | -51.5 | 47.0 | NA | NA | ||||||
| LYS | F:145 | F:196 | 133.0 | 0.665 | H | -48.7 | -54.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 31.0 | NA | H | -56.8 | -43.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 116.0 | 0.58 | H | -48.4 | -60.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4b95 | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2012-10-24 | LYS | C:145 | C:196 | 50.0 | NA | H | -60.9 | -40.4 | 50.0 | NA | NA |
HOH |
7.027 |
N |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 55.0 | NA | H | -63.9 | -37.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 54.0 | NA | H | -61.9 | -37.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 43.0 | NA | H | -63.5 | -37.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4bks | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2013-11-27 | LYS | C:145 | C:196 | 59.0 | NA | H | -64.5 | -42.4 | 59.0 | NA | NA |
HOH |
5.181 |
CB |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 52.0 | NA | H | -68.0 | -40.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 44.0 | NA | H | -65.0 | -38.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 114.0 | 0.57 | H | -63.6 | -41.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4bkt | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2013-11-27 | LYS | C:145 | C:196 | 67.0 | NA | H | -63.6 | -41.7 | 67.0 | NA | NA |
HOH |
4.706 |
O |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 114.0 | 0.57 | H | -63.3 | -40.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 127.0 | 0.635 | H | -63.3 | -39.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 117.0 | 0.585 | H | -62.6 | -41.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4w9c | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2014-09-10 | LYS | C:145 | C:196 | 77.0 | 0.385 | H | -60.1 | -41.2 | 77.0 | 0.385 | 0.0 |
HOH |
5.418 |
NZ |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 45.0 | NA | H | -56.6 | -47.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 119.0 | 0.595 | H | -56.7 | -43.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 55.0 | NA | H | -60.2 | -40.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4w9d | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2014-09-10 | LYS | C:145 | C:196 | 73.0 | 0.365 | H | -59.0 | -36.5 | 73.0 | 0.365 | 0.0 |
HOH |
5.416 |
NZ |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 40.0 | NA | H | -60.7 | -44.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 117.0 | 0.585 | H | -65.3 | -38.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 60.0 | NA | H | -62.3 | -32.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4w9e | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2014-09-10 | LYS | C:145 | C:196 | 76.0 | 0.38 | H | -55.3 | -50.5 | 76.0 | 0.38 | 0.0 |
HOH |
5.405 |
NZ |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 42.0 | NA | H | -56.9 | -48.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 114.0 | 0.57 | H | -55.7 | -44.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 59.0 | NA | H | -58.3 | -34.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4w9f | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2014-09-10 | LYS | C:145 | C:196 | 46.0 | NA | H | -58.3 | -39.9 | 46.0 | NA | NA |
HOH |
5.338 |
O |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 46.0 | NA | H | -58.2 | -48.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 73.0 | NA | H | -63.7 | -38.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 42.0 | NA | H | -58.9 | -39.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4w9g | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2014-09-10 | LYS | C:145 | C:196 | 83.0 | 0.415 | H | -65.7 | -45.3 | 83.0 | 0.415 | 0.0 |
HOH |
5.868 |
NZ |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 42.0 | NA | H | -61.6 | -48.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 117.0 | 0.585 | H | -61.0 | -40.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 56.0 | NA | H | -60.5 | -38.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4w9h | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2014-09-10 | LYS | C:145 | C:196 | 80.0 | 0.4 | H | -56.5 | -46.2 | 80.0 | 0.4 | 0.0 |
HOH |
3.123 |
NZ |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 42.0 | NA | H | -60.4 | -43.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 114.0 | 0.57 | H | -62.6 | -46.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 56.0 | NA | H | -61.7 | -33.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4w9i | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2014-09-10 | LYS | C:145 | C:196 | 80.0 | 0.4 | H | -64.3 | -43.3 | 80.0 | 0.4 | 0.0 |
HOH |
5.460 |
NZ |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 42.0 | NA | H | -60.8 | -49.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 117.0 | 0.585 | H | -62.2 | -47.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 55.0 | NA | H | -72.2 | -38.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4w9j | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2014-09-10 | LYS | C:145 | C:196 | 73.0 | 0.365 | H | -67.5 | -41.8 | 73.0 | 0.365 | 0.0 |
HOH |
2.869 |
NZ |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 40.0 | NA | H | -66.3 | -36.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 119.0 | 0.595 | H | -64.7 | -39.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 55.0 | NA | H | -63.7 | -36.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4w9k | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2014-09-10 | LYS | C:145 | C:196 | 66.0 | 0.33 | H | -59.3 | -47.1 | 66.0 | 0.33 | 0.0 |
HOH |
2.884 |
NZ |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 36.0 | NA | H | -57.5 | -48.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 115.0 | 0.575 | H | -62.6 | -40.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 50.0 | NA | H | -59.0 | -39.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4w9l | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2014-09-10 | LYS | C:145 | C:196 | 76.0 | 0.38 | H | -67.8 | -37.9 | 76.0 | 0.38 | 0.0 |
HOH |
5.435 |
NZ |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 46.0 | NA | H | -65.3 | -37.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 118.0 | 0.59 | H | -62.9 | -39.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 57.0 | NA | H | -66.4 | -36.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5lli | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2016-11-09 | LYS | C:145 | C:196 | 73.0 | 0.365 | H | -57.0 | -46.0 | 73.0 | 0.365 | 0.0 |
HOH |
2.761 |
NZ |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 39.0 | NA | H | -58.1 | -49.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 114.0 | 0.57 | H | -65.4 | -43.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 61.0 | NA | H | -68.4 | -36.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5nvv | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2017-09-20 | LYS | C:145 | C:196 | 71.0 | 0.355 | H | -54.8 | -43.2 | 71.0 | 0.355 | 0.0 |
HOH |
2.895 |
O |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 39.0 | NA | H | -56.0 | -45.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 115.0 | 0.575 | H | -60.7 | -45.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 56.0 | NA | H | -61.2 | -35.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5nvw | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2017-09-20 | LYS | C:145 | C:196 | 70.0 | 0.35 | H | -49.8 | -47.3 | 70.0 | 0.35 | 0.0 |
HOH |
2.957 |
NZ |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 38.0 | NA | H | -54.9 | -46.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 114.0 | 0.57 | H | -57.5 | -48.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 54.0 | NA | H | -60.6 | -34.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5nvx | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2017-09-20 | LYS | C:145 | C:196 | 71.0 | 0.355 | H | -55.4 | -45.3 | 71.0 | 0.355 | 0.0 |
HOH |
2.903 |
NZ |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 39.0 | NA | H | -56.7 | -44.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 114.0 | 0.57 | H | -62.0 | -45.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 58.0 | NA | H | -64.7 | -38.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5nvy | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2017-09-20 | LYS | C:145 | C:196 | 70.0 | 0.35 | H | -55.5 | -49.9 | 70.0 | 0.35 | 0.0 |
HOH |
3.024 |
O |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 116.0 | 0.58 | H | -61.1 | -41.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 109.0 | 0.545 | H | -66.7 | -32.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 115.0 | 0.575 | H | -55.9 | -36.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5nvz | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2017-09-20 | LYS | C:145 | C:196 | 77.0 | 0.385 | H | -51.2 | -49.9 | 77.0 | 0.385 | 0.0 |
HOH |
6.796 |
NZ |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 43.0 | NA | H | -47.0 | -46.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 111.0 | 0.555 | H | -64.0 | -49.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 58.0 | NA | H | -55.6 | -38.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5nw0 | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2017-09-20 | LYS | C:145 | C:196 | 73.0 | 0.365 | H | -53.8 | -49.6 | 73.0 | 0.365 | 0.0 |
HOH |
2.743 |
NZ |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 73.0 | 0.365 | H | -53.8 | -47.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 114.0 | 0.57 | H | -61.5 | -45.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 57.0 | NA | H | -63.5 | -36.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5nw1 | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2017-09-20 | LYS | C:145 | C:196 | 77.0 | 0.385 | H | -55.2 | -40.9 | 77.0 | 0.385 | 0.0 |
HOH |
2.783 |
O |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 42.0 | NA | H | -55.0 | -46.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 114.0 | 0.57 | H | -61.0 | -45.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 55.0 | NA | H | -64.5 | -37.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5nw2 | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2017-09-20 | LYS | C:145 | C:196 | 72.0 | 0.36 | H | -52.7 | -44.4 | 72.0 | 0.36 | 0.0 |
HOH |
2.868 |
O |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 38.0 | NA | H | -54.1 | -45.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 114.0 | 0.57 | H | -59.3 | -44.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 54.0 | NA | H | -60.1 | -37.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5t35 | 4 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2017-03-08 | LYS | D:145 | D:196 | 76.0 | 0.38 | H | -53.3 | -41.0 | 76.0 | 0.38 | 0.0 |
HOH |
4.896 |
N |
O |
||
| LYS | H:145 | H:196 | 78.0 | 0.39 | H | -52.3 | -41.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6bvb | 1 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2018-08-01 | LYS | A:145 | V:196 | 120.0 | 0.6 | H | -65.7 | -32.9 | 120.0 | 0.6 | 0.0 |
HOH |
4.130 |
HB2 |
O |
||
| 6gfy | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2018-07-11 | LYS | C:145 | C:196 | 95.0 | 0.475 | H | -59.4 | -45.4 | 95.0 | 0.475 | 0.0 |
HOH |
7.566 |
NZ |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 41.0 | NA | H | -46.7 | -52.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 111.0 | 0.555 | H | -64.1 | -45.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 60.0 | NA | H | -57.6 | -36.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6gfz | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2018-07-11 | LYS | C:145 | C:196 | 78.0 | 0.39 | H | -56.1 | -43.4 | 78.0 | 0.39 | 0.0 |
HOH |
3.166 |
O |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 39.0 | NA | H | -58.6 | -48.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 115.0 | 0.575 | H | -62.9 | -44.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 55.0 | NA | H | -59.6 | -40.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6gmn | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2018-08-08 | LYS | C:145 | C:196 | 39.0 | NA | H | -64.8 | -45.3 | 39.0 | NA | NA |
HOH |
4.970 |
CB |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 35.0 | NA | H | -57.8 | -46.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 116.0 | 0.58 | H | -62.0 | -46.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6gmn | 5 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2018-08-08 | LYS | I:145 | I:196 | 41.0 | NA | H | -61.9 | -45.7 | NA | NA | NA | ||||||
| 6gmq | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2018-08-22 | LYS | C:145 | C:196 | 42.0 | NA | H | -63.7 | -53.2 | 42.0 | NA | NA |
HOH |
5.413 |
N |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 42.0 | NA | H | -60.8 | -51.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 97.0 | 0.485 | H | -61.7 | -50.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 112.0 | 0.56 | H | -63.9 | -50.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6gmx | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2018-08-08 | LYS | C:145 | C:196 | 46.0 | NA | H | -58.6 | -51.1 | 46.0 | NA | NA |
HOH |
7.327 |
CB |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 50.0 | NA | H | -52.7 | -53.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 42.0 | NA | H | -58.1 | -46.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 45.0 | NA | H | -61.5 | -49.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6hax | 2 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2019-06-12 | LYS | B:145 | B:196 | 52.0 | NA | H | -61.1 | -43.8 | 52.0 | NA | NA |
HOH |
4.877 |
O |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 50.0 | NA | H | -61.7 | -43.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6hay | 2 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2019-06-12 | LYS | B:145 | B:196 | 45.0 | NA | H | -69.9 | -36.3 | 45.0 | NA | NA |
HOH |
3.666 |
O |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 81.0 | 0.405 | H | -65.4 | -49.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6sis | 4 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2019-12-04 | LYS | D:145 | D:196 | 80.0 | 0.4 | H | -69.0 | -39.7 | 80.0 | 0.4 | 0.0 | ||||||
| LYS | H:145 | H:196 | 77.0 | 0.385 | H | -69.0 | -39.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7jto | 4 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2021-10-06 | LYS | D:145 | L:196 | 78.0 | 0.39 | H | -60.8 | -45.6 | 78.0 | 0.39 | 0.0 |
HOH |
3.196 |
NZ |
O |
||
| 7jtp | 3 | P40337 | 99.38 | 4e-117 |
X-RAY |
2021-10-06 | LYS | C:145 | L:196 | 82.0 | 0.41 | H | -56.5 | -40.1 | 82.0 | 0.41 | 0.0 |
HOH |
3.640 |
CE |
O |
||
| 3zrc | 3 | P40337 | 98.77 | 4e-117 |
X-RAY |
2012-03-07 | LYS | C:146 | C:196 | 53.0 | NA | H | -52.6 | -71.5 | 53.0 | NA | NA | ||||||
| LYS | F:146 | F:196 | 99.0 | 0.495 | H | -47.7 | -66.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:146 | I:196 | 48.0 | NA | H | -68.5 | -36.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:146 | L:196 | 109.0 | 0.545 | H | -55.3 | -65.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3zrf | 3 | P40337 | 98.77 | 4e-117 |
X-RAY |
2012-03-07 | LYS | C:146 | C:196 | 43.0 | NA | H | -54.0 | -68.7 | 43.0 | NA | NA |
HOH |
6.748 |
CB |
O |
||
| LYS | F:146 | F:196 | 124.0 | 0.62 | H | -47.0 | -56.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:146 | I:196 | 106.0 | 0.53 | H | -28.3 | -62.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:146 | L:196 | 95.0 | 0.475 | H | -36.0 | -57.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3ztc | 3 | P40337 | 98.77 | 4e-117 |
X-RAY |
2012-07-25 | LYS | C:146 | C:196 | 47.0 | NA | H | -47.9 | -60.2 | 47.0 | NA | NA | ||||||
| LYS | F:146 | F:196 | 120.0 | 0.6 | H | -47.0 | -54.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:146 | I:196 | 123.0 | 0.615 | H | -55.7 | -49.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:146 | L:196 | 112.0 | 0.56 | H | -59.9 | -50.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3zun | 3 | P40337 | 98.77 | 4e-117 |
X-RAY |
2012-07-25 | LYS | C:146 | C:196 | 48.0 | NA | H | -61.6 | -47.2 | 48.0 | NA | NA |
HOH |
8.632 |
N |
O |
||
| LYS | F:146 | F:196 | 53.0 | NA | H | -45.0 | -48.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:146 | I:196 | 97.0 | 0.485 | H | -64.8 | -47.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:146 | L:196 | 43.0 | NA | H | -61.5 | -53.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4ajy | 4 | P40337 | 98.77 | 4e-117 |
X-RAY |
2012-11-14 | LYS | D:146 | V:196 | 122.0 | 0.61 | H | -61.3 | -40.2 | 122.0 | 0.61 | 0.0 |
HOH |
4.629 |
CD |
O |
||
| 4awj | 3 | P40337 | 98.77 | 4e-117 |
X-RAY |
2012-11-14 | LYS | C:146 | C:196 | 59.0 | NA | H | -63.5 | -49.9 | 59.0 | NA | NA |
HOH |
5.877 |
N |
O |
||
| LYS | F:146 | F:196 | 36.0 | NA | H | -64.8 | -37.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:146 | I:196 | 120.0 | 0.6 | H | -63.9 | -38.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:146 | L:196 | 115.0 | 0.575 | H | -60.6 | -44.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6gmr | 4 | P40337 | 98.77 | 4e-117 |
X-RAY |
2018-08-08 | LYS | D:146 | V:196 | 124.0 | 0.62 | H | -65.5 | -35.1 | 124.0 | 0.62 | 0.0 |
F4K HOH |
7.581 2.653 |
C O |
C13 O |
||
| 1lm8 | 3 | P40337 | 100.0 | 6e-117 |
X-RAY |
2002-06-12 | LYS | C:143 | V:196 | 107.0 | 0.535 | H | -66.8 | -32.4 | 107.0 | 0.535 | 0.0 |
HOH |
3.105 |
NZ |
O |
||
| 1vcb | 3 | P40337 | 100.0 | 6e-117 |
X-RAY |
1999-04-21 | LYS | C:143 | C:196 | 86.0 | 0.43 | H | -64.5 | -44.6 | 86.0 | 0.43 | 0.0 |
HOH |
3.427 |
CG |
O |
||
| LYS | F:143 | F:196 | 83.0 | 0.415 | H | -64.8 | -42.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:143 | I:196 | 80.0 | 0.4 | H | -62.4 | -43.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:143 | L:196 | 83.0 | 0.415 | H | -64.7 | -44.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5n4w | 2 | P40337 | 100.0 | 6e-117 |
X-RAY |
2017-06-07 | LYS | B:143 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6gfx | 3 | P40337 | 100.0 | 6e-117 |
X-RAY |
2018-07-11 | LYS | C:143 | C:196 | 114.0 | 0.57 | H | -65.3 | -41.3 | 114.0 | 0.57 | 0.0 |
HOH |
3.589 |
CD |
O |
||
| 6i7q | 4 | P40337 | 100.0 | 6e-117 |
X-RAY |
2019-11-27 | LYS | D:143 | V:196 | 77.0 | 0.385 | H | -57.4 | -49.6 | 77.0 | 0.385 | 0.0 |
HOH |
2.376 |
HZ3 |
O |
||
| 6i7r | 4 | P40337 | 100.0 | 6e-117 |
X-RAY |
2019-11-27 | LYS | D:143 | V:196 | 126.0 | 0.63 | H | -61.3 | -43.8 | 126.0 | 0.63 | 0.0 |
HOH |
3.712 |
HB3 |
O |
||
| 6r7f | 9 | P40337 | 100.0 | 6e-117 |
EM |
2019-08-28 | LYS | I:143 | V:196 | 94.0 | 0.47 | H | -62.7 | -40.1 | 72.0 | 0.36 | 0.11 |
L:Q13617:0.11 |
|||||
| 7khh | 3 | P40337 | 100.0 | 6e-116 |
X-RAY |
2021-02-24 | LYS | C:158 | C:196 | 95.0 | 0.475 | H | -61.4 | -43.9 | 95.0 | 0.475 | 0.0 |
HOH |
2.954 |
NZ |
O |
||
| 7cjb | 1 | P40337 | 100.0 | 8e-116 |
X-RAY |
2021-07-14 | LYS | A:146 | A:196 | 72.0 | 0.36 | H | -65.8 | -33.1 | 72.0 | 0.36 | 0.0 | ||||||
| LYS | E:146 | E:196 | 77.0 | 0.385 | H | -66.3 | -32.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:146 | I:196 | 107.0 | 0.535 | H | -65.4 | -33.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | M:146 | M:196 | 109.0 | 0.545 | H | -65.5 | -33.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6zhc | 1 | P40337 | 100.0 | 4e-113 |
X-RAY |
2020-08-05 | LYS | A:138 | AAA:196 | 71.0 | 0.355 | H | -59.9 | -45.1 | 71.0 | 0.355 | 0.0 |
EDO GOL IOD IOD HOH |
6.419 6.474 7.645 9.781 2.650 |
N CD N NZ NZ |
C2 O3 I I O |
||
| 7pi4 | 1 | P40337 | 100.0 | 4e-113 |
X-RAY |
2021-09-29 | LYS | A:138 | AAA:196 | 66.0 | 0.33 | H | -54.2 | -43.6 | 66.0 | 0.33 | 0.0 |
HOH |
3.054 |
CD |
O |
||
| 6fmi | 3 | P40337 | 99.34 | 1e-109 |
X-RAY |
2018-04-11 | LYS | C:145 | C:196 | 82.0 | 0.41 | H | -61.0 | -47.6 | 82.0 | 0.41 | 0.0 |
HOH |
7.847 |
O |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 40.0 | 0.2 | H | -54.3 | -51.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6fmj | 3 | P40337 | 99.34 | 1e-109 |
X-RAY |
2018-04-11 | LYS | C:145 | C:196 | 72.0 | 0.36 | H | -67.1 | -45.3 | 72.0 | 0.36 | 0.0 |
HOH |
2.697 |
NZ |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 44.0 | NA | H | -63.2 | -46.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 114.0 | 0.57 | H | -67.0 | -42.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 54.0 | NA | H | -62.2 | -38.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6fmk | 3 | P40337 | 99.34 | 1e-109 |
X-RAY |
2018-04-11 | LYS | C:145 | C:196 | 73.0 | 0.365 | H | -65.5 | -48.8 | 73.0 | 0.365 | 0.0 |
HOH |
2.997 |
NZ |
O |
||
| LYS | F:145 | F:196 | 110.0 | 0.55 | H | -63.1 | -42.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | I:145 | I:196 | 120.0 | 0.6 | H | -67.3 | -43.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | L:145 | L:196 | 109.0 | 0.545 | H | -69.7 | -38.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6hr2 | 2 | P40337 | 100.0 | 3e-108 |
X-RAY |
2019-06-12 | LYS | B:136 | B:196 | 104.0 | 0.52 | H | -69.5 | -37.0 | 104.0 | 0.52 | 0.0 |
HOH |
4.773 |
H |
O |
||
| LYS | F:136 | F:196 | 106.0 | 0.53 | H | -69.4 | -37.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6r6h | 12 | P40337 | 100.0 | 3e-107 |
EM |
2019-08-28 | LYS | L:137 | V:196 | 87.0 | 0.435 | H | -62.0 | -56.6 | 87.0 | 0.435 | 0.0 | ||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p40337-f1 | 1 | P40337 | 100.0 | 2e-156 | LYS | A:196 | A:196 | 85.0 | 0.425 | H | -61.1 | -42.0 | |