Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr6 | 106756282 | . | T | A | CCDS5055.1:NM_004849.2:c.193Att>Ttt_NP_004840.1:p.65I>F | Homo sapiens autophagy related 5 (ATG5), mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 5npv | 1 | Q9H1Y0 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-10-11 | ILE | A:72 | A:65 | 105.0 | 0.6 | -102.9 | 149.9 | 105.0 | 0.6 | 0.0 | |||||||
| ILE | C:72 | C:65 | 197.0 | 1.0 | 360.0 | -74.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5npw | 1 | Q9H1Y0 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-10-11 | ILE | A:72 | A:65 | 53.0 | NA | -81.0 | 137.9 | 53.0 | NA | NA | |||||||
| ILE | C:72 | C:65 | 50.0 | NA | -76.4 | 131.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | E:72 | E:65 | 45.0 | NA | -92.3 | 140.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | G:72 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4tq0 | 1 | Q9H1Y0 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-03-11 | ILE | A:79 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ILE | C:79 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | E:79 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4tq1 | 1 | Q9H1Y0 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-03-11 | ILE | A:79 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 4gdk | 2 | Q9H1Y0 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2012-12-05 | ILE | B:65 | B:65 | 39.0 | 0.223 | -85.3 | 137.9 | 39.0 | 0.223 | 0.0 |
HOH |
6.045 |
N |
O |
|||
| ILE | E:65 | E:65 | 40.0 | 0.229 | -83.0 | 151.3 | 40.0 | 0.229 | 0.0 | ||||||||||||||
| 4gdl | 2 | Q9H1Y0 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2012-12-05 | ILE | B:65 | B:65 | 34.0 | 0.194 | -95.8 | 141.4 | 34.0 | 0.194 | 0.0 | |||||||
| 4naw | 2 | Q9H1Y0 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2013-11-06 | ILE | B:65 | B:65 | 61.0 | 0.349 | -73.6 | 130.7 | 61.0 | 0.349 | 0.0 |
HOH |
2.723 |
O |
O |
|||
| ILE | F:65 | F:65 | 38.0 | 0.217 | -87.1 | 121.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | J:65 | J:65 | 51.0 | 0.291 | -93.1 | 129.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | N:65 | N:65 | 51.0 | 0.291 | -82.0 | 131.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5d7g | 1 | Q9H1Y0 | 99.64 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-03 | ILE | A:70 | A:65 | 83.0 | NA | 47.4 | 42.8 | 83.0 | NA | NA | |||||||
| ILE | C:70 | C:65 | 67.0 | 0.383 | -73.1 | 136.7 | 67.0 | 0.383 | 0.0 | ||||||||||||||
| ILE | E:70 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | G:70 | G:65 | 55.0 | 0.314 | -60.8 | 133.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-q9h1y0-f1 | 1 | Q9H1Y0 | 100.0 | 0.0 | ILE | A:65 | A:65 | 45.0 | 0.257 | -81.7 | 107.0 | ||