Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr6 | 42975003 | . | G | A | CCDS4878.1:NM_006245.3:c.592Gaa>Aaa_NP_006236.1:p.198E>K | Homo sapiens protein phosphatase 2 regulatory subunit B'delta (PPP2R5D), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 2npp | 2 | Q13362 | 87.89 | 0.0 |
X-RAY |
2006-12-12 | GLU | B:122 | B:112 | 161.0 | 0.847 | G | -110.6 | 29.5 | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | E:122 | E:112 | 159.0 | 0.837 | G | -108.3 | 25.6 | 61.0 | 0.321 | 0.516 |
F:P67775:0.332 H:NOR00109:0.279 |
||||||||||||
| 2iae | 2 | Q13362 | 88.21 | 0.0 |
X-RAY |
2006-12-26 | GLU | B:93 | B:122 | 80.0 | 0.421 | -44.5 | 125.5 | 77.0 | 0.405 | 0.016 |
C:P67775:0.016 |
||||||
| GLU | E:93 | E:122 | 36.0 | 0.189 | -23.5 | -55.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 3fga | 2 | Q13362 | 88.83 | 0.0 |
X-RAY |
2009-09-22 | GLU | B:89 | B:112 | 155.0 | 0.816 | G | -95.0 | 8.6 | 52.0 | 0.274 | 0.542 |
E:NOR00109:0.3 C:P67775:0.368 |
HOH |
2.308 |
OE1 |
O |
|
| 2nyl | 2 | Q13362 | 90.93 | 0.0 |
X-RAY |
2006-12-12 | GLU | B:85 | B:112 | 146.0 | 0.768 | G | -96.2 | 13.2 | 58.0 | 0.305 | 0.463 |
G:NOR00109:0.274 C:P67775:0.279 |
|||||
| GLU | E:85 | E:112 | 148.0 | 0.779 | G | -94.3 | 12.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2nym | 2 | Q13362 | 90.93 | 0.0 |
X-RAY |
2006-12-12 | GLU | B:85 | B:112 | 148.0 | 0.779 | G | -115.3 | 14.6 | 51.0 | 0.268 | 0.511 |
G:NOR00109:0.289 C:P67775:0.321 |
|||||
| GLU | E:85 | E:112 | 150.0 | 0.789 | G | -112.1 | 8.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5jja | 1 | Q13362 | 88.64 | 0.0 |
X-RAY |
2016-07-13 | GLU | A:94 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | B:94 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6toq | 2 | Q13362 | 88.89 | 0.0 |
X-RAY |
2020-10-21 | GLU | B:112 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 2jak | 1 | Q13362 | 88.89 | 0.0 |
X-RAY |
2006-12-04 | GLU | A:134 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 5k6s | 1 | Q13362 | 89.14 | 0.0 |
X-RAY |
2016-12-07 | GLU | A:97 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 5sw9 | 1 | Q13362 | 89.14 | 0.0 |
X-RAY |
2016-11-30 | GLU | A:97 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 5swf | 1 | Q13362 | 89.14 | 0.0 |
X-RAY |
2016-11-30 | GLU | A:97 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6oyl | 1 | Q13362 | 89.14 | 0.0 |
X-RAY |
2020-03-25 | GLU | A:97 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6vro | 1 | Q13362 | 89.14 | 0.0 |
X-RAY |
2020-03-25 | GLU | A:97 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7ouf | 2 | O75475,Q13362 | 88.89 | 0.0 |
EM |
2021-08-18 | GLU | C:439 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | H:439 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7oug | 2 | O75475,Q13362 | 88.89 | 0.0 |
EM |
2021-08-18 | GLU | C:439 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | H:439 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7ouh | 2 | ? | 88.89 | 0.0 |
EM |
2021-08-18 | GLU | C:439 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | H:439 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7pel | 2 | O75475,Q13362 | 88.89 | 0.0 |
EM |
2021-08-25 | GLU | C:439 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | H:439 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6voy | 2 | Q13362 | 89.21 | 0.0 |
EM |
2020-07-01 | GLU | E:93 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | F:93 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-q14738-f1 | 1 | Q14738 | 100.0 | 0.0 | GLU | A:198 | A:198 | 161.0 | 0.847 | S | -94.6 | -2.8 | |
| af-q13362-f1 | 1 | Q13362 | 81.45 | 0.0 | GLU | A:122 | A:122 | 159.0 | 0.837 | G | -93.5 | -4.4 | |