Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr9 | 123768334 | . | T | A | CCDS6826.1:NM_001735.2:c.2425Ata>Tta_NP_001726.2:p.809I>L | Homo sapiens complement C5 (C5), transcript variant 1, mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
3prx | 1 | P01031 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2011-01-19 | ILE | A:809 | A:809 | 27.0 | 0.154 | -82.0 | 154.9 | 27.0 | 0.154 | 0.0 | |||||||
ILE | C:809 | C:809 | 28.0 | 0.16 | -83.3 | 155.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
3pvm | 1 | P01031 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2011-01-19 | ILE | A:809 | A:809 | 33.0 | 0.189 | -74.9 | 162.7 | 33.0 | 0.189 | 0.0 | |||||||
ILE | C:809 | C:809 | 32.0 | 0.183 | -74.8 | 161.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
5i5k | 1 | P01031 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-03-16 | ILE | A:809 | B:809 | 34.0 | 0.194 | E | -112.3 | 145.4 | 34.0 | 0.194 | 0.0 | ||||||
ILE | D:809 | A:809 | 31.0 | 0.177 | E | -109.9 | 148.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7ad6 | 1 | P01031 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-10 | ILE | A:809 | A:809 | 118.0 | 0.674 | E | -118.5 | 142.5 | 21.0 | 0.12 | 0.554 |
B:P01031:0.554 |
|||||
ILE | B:809 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
7ad7 | 1 | P01031 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-10 | ILE | A:809 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ILE | B:809 | A:809 | 119.0 | 0.68 | E | -120.6 | 138.7 | 48.0 | 0.274 | 0.406 |
A:P01031:0.406 |
HOH |
2.797 |
N |
O |
||||||||
3cu7 | 1 | P01031 | 99.94 | 0.0 |
X-RAY |
2008-06-10 | ILE | A:809 | A:809 | 18.0 | 0.103 | E | -104.4 | 151.3 | 18.0 | 0.103 | 0.0 | ||||||
ILE | B:809 | B:809 | 17.0 | 0.097 | E | -104.5 | 151.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3kls | 1 | P01031 | 99.94 | 0.0 |
X-RAY |
2009-11-24 | ILE | A:809 | A:809 | 19.0 | 0.109 | E | -98.7 | 130.2 | 19.0 | 0.109 | 0.0 | ||||||
ILE | C:809 | B:809 | 20.0 | 0.114 | E | -97.2 | 129.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3km9 | 1 | P01031 | 99.94 | 0.0 |
X-RAY |
2009-12-01 | ILE | A:809 | A:809 | 19.0 | 0.109 | E | -123.0 | 136.3 | 19.0 | 0.109 | 0.0 | ||||||
ILE | C:809 | B:809 | 20.0 | 0.114 | E | -120.3 | 127.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4e0s | 1 | P01031 | 99.94 | 0.0 |
X-RAY |
2012-04-18 | ILE | A:809 | A:809 | 23.0 | 0.131 | E | -90.0 | 156.9 | 23.0 | 0.131 | 0.0 | ||||||
7nyc | 6 | P01031 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-10-06 | ILE | G:791 | A:791 | 12.0 | 0.069 | E | -83.1 | 156.9 | 12.0 | 0.069 | 0.0 | ||||||
7nyd | 7 | P01031 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-10-06 | ILE | H:791 | A:791 | 11.0 | 0.063 | E | -83.7 | 145.2 | 11.0 | 0.063 | 0.0 | ||||||
6i2x | 2 | P01031 | 100.0 | 0.0 |
ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY |
2019-06-26 | ILE | B:132 | A:809 | 116.0 | 0.663 | E | -115.0 | 138.8 | 16.0 | 0.091 | 0.572 |
A:P01031:0.571 |
|||||
6rqj | 1 | P01031 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2020-01-08 | ILE | A:132 | A:809 | 111.0 | 0.634 | E | -85.8 | 149.5 | 9.0 | 0.051 | 0.583 |
D:P01031:0.583 |
|||||
5hcc | 2 | P01031 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-03-30 | ILE | B:131 | A:809 | 116.0 | 0.663 | E | -116.9 | 142.1 | 22.0 | 0.126 | 0.537 |
A:P01031:0.537 |
EDO HOH |
9.353 9.381 |
CD1 N |
C2 O |
|
5hcd | 2 | P01031 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-03-30 | ILE | B:131 | A:809 | 119.0 | 0.68 | E | -116.7 | 141.8 | 19.0 | 0.109 | 0.571 |
A:P01031:0.571 |
|||||
5hce | 2 | P01031 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-03-30 | ILE | B:131 | A:809 | 116.0 | 0.663 | E | -114.8 | 145.1 | 19.0 | 0.109 | 0.554 |
A:P01031:0.554 |
|||||
4a5w | 1 | P01031 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2012-03-14 | ILE | A:713 | A:809 | 13.0 | 0.074 | E | -87.6 | 137.6 | 13.0 | 0.074 | 0.0 | ||||||
6h03 | 1 | P01031 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2018-12-19 | ILE | A:713 | A:809 | 14.0 | 0.08 | E | -92.3 | 144.1 | 14.0 | 0.08 | 0.0 | ||||||
6h04 | 2 | P01031 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2018-12-19 | ILE | S:713 | A:809 | 16.0 | 0.091 | E | -91.0 | 144.1 | 16.0 | 0.091 | 0.0 |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p01031-f1 | 1 | P01031 | 100.0 | 0.0 | ILE | A:809 | A:809 | 14.0 | 0.08 | E | -86.6 | 146.3 |