Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr1 | 11740637 | . | C | A | CCDS134.1:NM_001127325.1:c.22Gac>Tac_NP_001120797.1:p.8D>Y | Homo sapiens MAD2 mitotic arrest deficient-like 2 (yeast) (MAD2L2), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 6bi7 | 1 | Q9UI95 | 100.0 | 3e-156 |
X-RAY |
2018-08-01 | ASP | A:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ASP | C:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ASP | E:24 | E:8 | 173.0 | 1.0 | 360.0 | -55.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ASP | G:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6kto | 1 | Q9UI95 | 100.0 | 3e-156 |
X-RAY |
2020-04-29 | ASP | A:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ASP | B:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6wwa | 1 | Q9UI95 | 100.0 | 9e-156 |
X-RAY |
2021-03-03 | ASP | A:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ASP | B:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ASP | C:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ASP | D:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7l9p | 2 | Q9UI95 | 100.0 | 9e-156 |
EM |
2021-03-03 | ASP | G:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ASP | H:8 | I:8 | 152.0 | 1.0 | -72.6 | 161.4 | 0.0 | 0.0 | 1.0 |
C:Q15645:0.313 D:Q15645:0.687 B:Q15645:0.007 E:Q15645:0.247 |
|||||||||||||
| ASP | I:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ASP | J:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6nif | 1 | Q9UI95,F5H018,O60673 | 99.52 | 9e-156 |
X-RAY |
2019-09-11 | ASP | A:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6m7a | 1 | Q9UI95 | 99.53 | 1e-155 |
X-RAY |
2021-01-27 | ASP | A:8 | A:8 | 208.0 | 1.0 | 360.0 | -27.8 | 134.0 | 0.893 | 0.107 |
D:Q6ZNX1:0.493 |
HOH |
2.372 |
OD1 |
O |
||
| ASP | C:8 | B:8 | 203.0 | 1.0 | 360.0 | -144.2 | 175.0 | 1.0 | 0.0 |
B:Q6ZNX1:0.187 |
HOH |
2.876 |
OD1 |
O |
|||||||||
| 6m7b | 1 | Q9UI95 | 99.53 | 1e-155 |
X-RAY |
2021-01-27 | ASP | A:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ASP | B:8 | B:8 | 189.0 | 1.0 | 360.0 | -31.6 | 130.0 | 0.867 | 0.133 |
D:Q6ZNX1:0.393 |
HOH |
2.930 |
OD2 |
O |
|||||||||
| 4gk0 | 1 | Q9UI95 | 99.53 | 2e-155 |
X-RAY |
2013-03-13 | ASP | A:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ASP | B:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4gk5 | 1 | Q9UI95 | 99.53 | 2e-155 |
X-RAY |
2013-03-13 | ASP | A:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ASP | B:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6ve5 | 1 | Q9UI95 | 99.53 | 2e-155 |
X-RAY |
2021-01-13 | ASP | A:12 | A:8 | 123.0 | 0.82 | -133.5 | 166.0 | 123.0 | 0.82 | 0.0 |
HOH |
2.813 |
C |
O |
|||
| 3abd | 1 | Q9UI95 | 99.53 | 3e-155 |
X-RAY |
2010-02-16 | ASP | A:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ASP | C:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3abe | 1 | Q9UI95 | 99.53 | 3e-155 |
X-RAY |
2010-02-16 | ASP | A:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3vu7 | 2 | Q9UI95 | 99.53 | 3e-155 |
X-RAY |
2012-08-08 | ASP | B:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 5xpt | 1 | Q9UI95 | 99.53 | 3e-155 |
X-RAY |
2017-09-20 | ASP | A:24 | A:8 | 131.0 | 0.873 | -118.8 | 15.1 | 131.0 | 0.873 | 0.0 |
HOH |
2.444 |
O |
O |
|||
| 5xpu | 1 | Q9UI95 | 99.53 | 3e-155 |
X-RAY |
2017-09-20 | ASP | A:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6bc8 | 1 | Q9UI95 | 99.53 | 3e-155 |
X-RAY |
2018-08-01 | ASP | A:24 | A:8 | 85.0 | 0.567 | G | -68.0 | -24.3 | 85.0 | 0.567 | 0.0 |
HOH |
5.722 |
N |
O |
||
| 6ws0 | 2 | Q9UI95 | 99.53 | 3e-155 |
X-RAY |
2020-12-23 | ASP | B:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6ws5 | 2 | Q9UI95 | 99.53 | 3e-155 |
X-RAY |
2020-12-23 | ASP | B:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6ww9 | 1 | Q9UI95 | 99.52 | 7e-155 |
X-RAY |
2021-03-03 | ASP | A:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ASP | C:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6bcd | 1 | Q9UI95 | 98.58 | 2e-153 |
X-RAY |
2018-08-01 | ASP | A:24 | A:8 | 84.0 | 0.56 | G | -67.0 | -22.6 | 84.0 | 0.56 | 0.0 |
HOH |
3.565 |
OD1 |
O |
||
| 4fjo | 3 | Q9D752 | 98.1 | 3e-152 |
X-RAY |
2012-08-08 | ASP | C:8 | C:8 | 90.0 | 0.6 | T | -94.6 | -31.2 | NA | NA | NA | ||||||
| 6k07 | 1 | Q9UI95 | 99.51 | 2e-150 |
X-RAY |
2019-12-11 | ASP | A:16 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 4ext | 3 | Q9UI95 | 100.0 | 7e-150 |
X-RAY |
2013-05-08 | ASP | C:3 | C:8 | 156.0 | 1.0 | -107.0 | -23.0 | 156.0 | 1.0 | 0.0 |
HOH |
2.657 |
OD2 |
O |
|||
| 6k08 | 1 | Q9UI95 | 99.02 | 3e-149 |
X-RAY |
2019-12-11 | ASP | A:16 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 5o8k | 1 | Q9D752 | 96.21 | 5e-149 |
X-RAY |
2018-06-27 | ASP | A:8 | A:8 | 145.0 | 0.967 | 360.0 | 66.0 | 145.0 | 0.967 | 0.0 |
HOH |
9.790 |
C |
O |
|||
| 6ekj | 1 | Q9D752 | 96.21 | 5e-149 |
X-RAY |
2018-10-10 | ASP | A:8 | A:8 | 75.0 | 0.5 | G | -78.0 | -16.2 | 75.0 | 0.5 | 0.0 |
HOH |
5.136 |
N |
O |
||
| 6ekl | 1 | Q9D752 | 96.21 | 5e-149 |
X-RAY |
2018-10-10 | ASP | A:8 | A:8 | 77.0 | 0.513 | G | -75.0 | -15.7 | 77.0 | 0.513 | 0.0 |
HOH |
5.029 |
N |
O |
||
| 6ekm | 1 | Q9D752 | 96.21 | 5e-149 |
X-RAY |
2018-10-10 | ASP | A:8 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-q9ui95-f1 | 1 | Q9UI95 | 100.0 | 6e-157 | ASP | A:8 | A:8 | 103.0 | 0.687 | S | -97.0 | -12.7 | |