Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr1 | 16475248 | . | T | A | CCDS169.1:NM_004431.3:c.448Atc>Ttc_NP_004422.2:p.150I>F | Homo sapiens EPH receptor A2 (EPHA2), mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
3fl7 | 1 | Q8N3Z2 | 99.42 | 0.0 |
X-RAY |
2009-01-27 | ILE | A:155 | A:150 | 48.0 | 0.274 | -120.9 | 139.8 | 48.0 | 0.274 | 0.0 |
HOH |
5.869 |
CD1 |
O |
|||
2x10 | 1 | P29317 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2010-03-16 | ILE | A:152 | A:150 | 68.0 | 0.389 | -93.2 | 135.8 | 68.0 | 0.389 | 0.0 | |||||||
2x11 | 1 | P29317 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2010-03-16 | ILE | A:152 | A:150 | 41.0 | 0.234 | -89.6 | 138.4 | 41.0 | 0.234 | 0.0 | |||||||
3mx0 | 1 | P29317 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2010-06-30 | ILE | A:124 | A:150 | 50.0 | 0.286 | E | -84.5 | 132.8 | 50.0 | 0.286 | 0.0 | ||||||
ILE | C:124 | C:150 | 45.0 | 0.257 | -131.7 | 141.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
3mbw | 1 | P29317 | 99.03 | 0.0 |
X-RAY |
2010-06-09 | ILE | A:154 | A:150 | 45.0 | 0.257 | E | -96.6 | 132.9 | 45.0 | 0.257 | 0.0 |
HOH |
4.235 |
C |
O |
||
3czu | 1 | P29317 | 98.37 | 2e-127 |
X-RAY |
2008-08-12 | ILE | A:155 | A:150 | 43.0 | 0.246 | -90.4 | 138.7 | 43.0 | 0.246 | 0.0 |
HOH |
3.188 |
N |
O |
|||
3c8x | 1 | P29317 | 98.37 | 2e-127 |
X-RAY |
2008-03-25 | ILE | A:154 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
3skj | 3 | P29317 | 98.37 | 2e-127 |
X-RAY |
2011-08-31 | ILE | E:154 | E:126 | 50.0 | 0.286 | -74.5 | 161.1 | 50.0 | 0.286 | 0.0 |
HOH |
7.061 |
C |
O |
|||
ILE | F:154 | F:126 | 44.0 | 0.251 | -106.9 | 149.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
7czf | 1 | P29317 | 98.36 | 4e-127 |
X-RAY |
2020-10-21 | ILE | A:123 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ILE | D:123 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
7b7n | 1 | P29317 | 99.45 | 7e-127 |
X-RAY |
2020-12-30 | ILE | A:128 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
6rw2 | 1 | P29317 | 96.7 | 6e-124 |
X-RAY |
2020-04-08 | ILE | A:142 | A:150 | 54.0 | 0.309 | E | -88.6 | 132.5 | 54.0 | 0.309 | 0.0 |
GOL HOH |
8.470 3.996 |
CD1 C |
O2 O |
||
7cze | 3 | P29317 | 100.0 | 1e-123 |
X-RAY |
2020-10-21 | ILE | I:125 | I:150 | 72.0 | 0.411 | -67.0 | -39.0 | 72.0 | 0.411 | 0.0 | |||||||
ILE | J:125 | J:150 | 74.0 | 0.423 | -66.9 | -39.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ILE | K:125 | K:150 | 72.0 | 0.411 | -66.9 | -36.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ILE | L:125 | L:150 | 73.0 | 0.417 | -66.8 | -36.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
3hei | 1 | P29317 | 100.0 | 7e-123 |
X-RAY |
2009-06-30 | ILE | A:123 | A:123 | 35.0 | 0.2 | -91.8 | 147.1 | 35.0 | 0.2 | 0.0 |
HOH |
2.628 |
O |
O |
|||
ILE | C:123 | C:123 | 37.0 | 0.211 | -87.1 | 148.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ILE | E:123 | E:123 | 40.0 | 0.229 | -89.5 | 146.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ILE | G:123 | G:123 | 41.0 | 0.234 | -93.7 | 141.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ILE | I:123 | I:123 | 40.0 | 0.229 | -82.0 | 144.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ILE | K:123 | K:123 | 39.0 | 0.223 | -82.1 | 141.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ILE | M:123 | M:123 | 39.0 | 0.223 | -91.9 | 141.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ILE | O:123 | O:123 | 46.0 | 0.263 | -84.1 | 147.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
3hpn | 1 | P29317 | 100.0 | 7e-123 |
X-RAY |
2009-06-30 | ILE | A:123 | A:123 | 37.0 | 0.211 | -78.9 | 152.5 | 37.0 | 0.211 | 0.0 |
HOH |
2.696 |
N |
O |
|||
ILE | B:123 | B:123 | 38.0 | 0.217 | -76.6 | 147.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ILE | C:123 | C:123 | 40.0 | 0.229 | -76.2 | 146.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ILE | D:123 | D:123 | 40.0 | 0.229 | -79.1 | 151.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ILE | E:123 | E:123 | 38.0 | 0.217 | -77.1 | 144.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ILE | F:123 | F:123 | 39.0 | 0.223 | -77.3 | 151.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
6b9l | 1 | P29317 | 100.0 | 9e-123 |
X-RAY |
2018-10-17 | ILE | A:145 | A:150 | 48.0 | 0.274 | E | -95.5 | 149.5 | 48.0 | 0.274 | 0.0 | ||||||
ILE | B:145 | B:150 | 53.0 | 0.303 | E | -90.8 | 138.8 | 53.0 | 0.303 | 0.0 | |||||||||||||
ILE | C:145 | C:150 | 48.0 | 0.274 | E | -93.5 | 149.2 | 48.0 | 0.274 | 0.0 | |||||||||||||
ILE | D:145 | D:150 | 52.0 | 0.297 | -98.4 | 141.7 | 52.0 | 0.297 | 0.0 | ||||||||||||||
6njz | 1 | P29317 | 98.32 | 3e-122 |
X-RAY |
2019-05-01 | ILE | A:130 | A:150 | 55.0 | 0.314 | -91.0 | 152.0 | 55.0 | 0.314 | 0.0 |
HOH |
3.122 |
O |
O |
|||
ILE | B:130 | B:150 | 54.0 | 0.309 | -87.3 | 152.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
6nk0 | 1 | P29317 | 98.32 | 3e-122 |
X-RAY |
2019-05-01 | ILE | A:130 | A:150 | 52.0 | 0.297 | -85.9 | 154.7 | 52.0 | 0.297 | 0.0 |
HOH |
2.199 |
H |
O |
|||
ILE | B:130 | B:150 | 54.0 | 0.309 | -87.0 | 151.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
6nk1 | 1 | P29317 | 98.32 | 3e-122 |
X-RAY |
2019-05-01 | ILE | A:130 | A:150 | 49.0 | 0.28 | -86.6 | 155.2 | 49.0 | 0.28 | 0.0 |
HOH |
2.041 |
H |
O |
|||
ILE | B:130 | B:150 | 47.0 | 0.269 | -90.6 | 152.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
6nk2 | 1 | P29317 | 98.32 | 3e-122 |
X-RAY |
2019-05-01 | ILE | A:130 | A:150 | 51.0 | 0.291 | -89.0 | 152.6 | 51.0 | 0.291 | 0.0 |
HOH |
3.052 |
HA |
O |
|||
ILE | B:130 | B:150 | 52.0 | 0.297 | -88.7 | 151.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
6nkp | 1 | P29317 | 98.32 | 3e-122 |
X-RAY |
2019-05-01 | ILE | A:130 | A:150 | 50.0 | 0.286 | -83.3 | 151.4 | 50.0 | 0.286 | 0.0 |
HOH |
2.913 |
O |
O |
|||
ILE | B:130 | B:150 | 40.0 | 0.229 | -85.4 | 141.5 | NA | NA | NA |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p29317-f1 | 1 | P29317 | 100.0 | 0.0 | ILE | A:150 | A:150 | 53.0 | 0.303 | -92.6 | 135.7 |