Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr1 22416488 . C A CCDS222.1:NM_044472.2:c.539cCg>cAg_NP_426359.1:p.180P>Q Homo sapiens cell division cycle 42 (CDC42), transcript variant 2, mRNA.
pdb_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id
alphafold_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
5hzk 1 P60953 100.0 2e-138 X-RAY
2016-12-21 PRO A:182 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO C:182 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5c2j 2 P60766 95.29 3e-135 X-RAY
2016-06-22 PRO B:187 B:180 137.0 0.945 S -74.0 -38.2 137.0 0.945 0.0 HOH
5.030
CD
O
2odb 1 P60953 95.29 3e-135 X-RAY
2007-01-30 PRO A:181 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1grn 1 P60953 95.29 3e-135 X-RAY
1999-12-22 PRO A:180 A:180 58.0 0.4 -64.8 179.7 58.0 0.4 0.0 HOH
5.104
CG
O
2ngr 1 P60953 95.29 3e-135 X-RAY
1999-01-06 PRO A:180 A:180 57.0 0.393 -64.5 172.6 57.0 0.393 0.0 HOH
4.864
CG
O
4itr 2 P60953 95.29 3e-135 X-RAY
2013-02-20 PRO C:180 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO D:180 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1an0 1 P60953 95.79 3e-135 X-RAY
1999-01-13 PRO A:180 A:180 113.0 0.779 S -68.6 -115.3 113.0 0.779 0.0 HOH
8.267
N
O
PRO B:180 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2dfk 2 P60953 95.29 4e-135 X-RAY
2006-05-02 PRO B:183 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO D:183 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6siu 2 P60953 95.29 4e-135 X-RAY
2020-03-18 PRO C:181 C:180 28.0 0.193 -99.6 -157.7 28.0 0.193 0.0 HOH
8.658
C
O
PRO D:181 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5fi1 2 P60953 95.29 5e-135 X-RAY
2016-04-20 PRO B:183 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2qrz 1 P60953 96.81 5e-135 X-RAY
2008-03-18 PRO A:180 A:180 129.0 0.89 -37.8 -22.8 124.0 0.855 0.035 B:P60953:0.034
HOH
7.971
O
O
PRO B:180 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2wm9 2 P60953 96.81 6e-135 X-RAY
2009-09-22 PRO B:182 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2wmn 2 P60953 96.81 6e-135 X-RAY
2009-09-22 PRO B:182 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2wmo 2 P60953 96.81 6e-135 X-RAY
2009-09-22 PRO B:182 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6tky 2 P60953 96.81 6e-135 X-RAY
2020-01-22 PRO B:180 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO C:180 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6tkz 2 P60953 96.81 6e-135 X-RAY
2020-01-22 PRO B:180 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO C:180 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1doa 1 P60953 96.81 6e-135 X-RAY
2000-02-09 PRO A:183 A:180 110.0 0.759 -43.9 -60.1 110.0 0.759 0.0 HOH
3.872
O
O
6aj4 2 P60953 96.79 4e-134 X-RAY
2019-03-20 PRO B:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO D:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO H:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6ajl 2 P60953 96.79 4e-134 X-RAY
2019-03-20 PRO B:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO D:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO F:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO H:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1ki1 1 P60953 96.79 6e-134 X-RAY
2002-05-29 PRO A:180 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO C:180 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1kz7 2 P60953 96.79 6e-134 X-RAY
2002-03-20 PRO B:180 B:180 122.0 0.841 S -44.8 109.0 122.0 0.841 0.0 HOH
2.779
CA
O
PRO D:180 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1kzg 2 P60953 96.79 6e-134 X-RAY
2002-03-20 PRO B:180 B:180 112.0 0.772 -38.6 79.2 112.0 0.772 0.0
PRO D:180 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1a4r 1 P60953 94.76 7e-134 X-RAY
1999-03-02 PRO A:180 A:180 121.0 0.834 S -39.4 -84.2 118.0 0.814 0.02 B:P60953:0.021
PRO B:180 B:380 137.0 0.945 -65.5 -37.7 132.0 0.91 0.035 A:P60953:0.034
3vhl 2 P60953 96.26 2e-133 X-RAY
2012-06-20 PRO B:187 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1nf3 1 P60953 94.24 3e-133 X-RAY
2003-03-04 PRO A:184 A:180 141.0 0.972 S -63.5 8.1 141.0 0.972 0.0 HOH
3.183
CD
O
PRO B:184 B:180 134.0 0.924 S -55.7 -45.5 NA NA NA
4did 1 P60953 99.45 3e-133 X-RAY
2012-02-29 PRO A:190 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
1e0a 1 P60953 97.31 8e-132 NMR
2000-04-18 PRO A:180 A:180 104.0 0.717 -55.7 135.8 104.0 0.717 0.0

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p60953-f1 1 P60953 95.29 1e-135 PRO A:180 A:180 86.0 0.593 -59.0 132.8