Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr1 | 22416488 | . | C | A | CCDS222.1:NM_044472.2:c.539cCg>cAg_NP_426359.1:p.180P>Q | Homo sapiens cell division cycle 42 (CDC42), transcript variant 2, mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
5hzk | 1 | P60953 | 100.0 | 2e-138 |
X-RAY |
2016-12-21 | PRO | A:182 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
PRO | C:182 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5c2j | 2 | P60766 | 95.29 | 3e-135 |
X-RAY |
2016-06-22 | PRO | B:187 | B:180 | 137.0 | 0.945 | S | -74.0 | -38.2 | 137.0 | 0.945 | 0.0 |
HOH |
5.030 |
CD |
O |
||
2odb | 1 | P60953 | 95.29 | 3e-135 |
X-RAY |
2007-01-30 | PRO | A:181 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
1grn | 1 | P60953 | 95.29 | 3e-135 |
X-RAY |
1999-12-22 | PRO | A:180 | A:180 | 58.0 | 0.4 | -64.8 | 179.7 | 58.0 | 0.4 | 0.0 |
HOH |
5.104 |
CG |
O |
|||
2ngr | 1 | P60953 | 95.29 | 3e-135 |
X-RAY |
1999-01-06 | PRO | A:180 | A:180 | 57.0 | 0.393 | -64.5 | 172.6 | 57.0 | 0.393 | 0.0 |
HOH |
4.864 |
CG |
O |
|||
4itr | 2 | P60953 | 95.29 | 3e-135 |
X-RAY |
2013-02-20 | PRO | C:180 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
PRO | D:180 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
1an0 | 1 | P60953 | 95.79 | 3e-135 |
X-RAY |
1999-01-13 | PRO | A:180 | A:180 | 113.0 | 0.779 | S | -68.6 | -115.3 | 113.0 | 0.779 | 0.0 |
HOH |
8.267 |
N |
O |
||
PRO | B:180 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
2dfk | 2 | P60953 | 95.29 | 4e-135 |
X-RAY |
2006-05-02 | PRO | B:183 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
PRO | D:183 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6siu | 2 | P60953 | 95.29 | 4e-135 |
X-RAY |
2020-03-18 | PRO | C:181 | C:180 | 28.0 | 0.193 | -99.6 | -157.7 | 28.0 | 0.193 | 0.0 |
HOH |
8.658 |
C |
O |
|||
PRO | D:181 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5fi1 | 2 | P60953 | 95.29 | 5e-135 |
X-RAY |
2016-04-20 | PRO | B:183 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
2qrz | 1 | P60953 | 96.81 | 5e-135 |
X-RAY |
2008-03-18 | PRO | A:180 | A:180 | 129.0 | 0.89 | -37.8 | -22.8 | 124.0 | 0.855 | 0.035 |
B:P60953:0.034 |
HOH |
7.971 |
O |
O |
||
PRO | B:180 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
2wm9 | 2 | P60953 | 96.81 | 6e-135 |
X-RAY |
2009-09-22 | PRO | B:182 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
2wmn | 2 | P60953 | 96.81 | 6e-135 |
X-RAY |
2009-09-22 | PRO | B:182 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
2wmo | 2 | P60953 | 96.81 | 6e-135 |
X-RAY |
2009-09-22 | PRO | B:182 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
6tky | 2 | P60953 | 96.81 | 6e-135 |
X-RAY |
2020-01-22 | PRO | B:180 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
PRO | C:180 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6tkz | 2 | P60953 | 96.81 | 6e-135 |
X-RAY |
2020-01-22 | PRO | B:180 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
PRO | C:180 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
1doa | 1 | P60953 | 96.81 | 6e-135 |
X-RAY |
2000-02-09 | PRO | A:183 | A:180 | 110.0 | 0.759 | -43.9 | -60.1 | 110.0 | 0.759 | 0.0 |
HOH |
3.872 |
O |
O |
|||
6aj4 | 2 | P60953 | 96.79 | 4e-134 |
X-RAY |
2019-03-20 | PRO | B:187 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
PRO | D:187 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
PRO | F:187 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
PRO | H:187 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6ajl | 2 | P60953 | 96.79 | 4e-134 |
X-RAY |
2019-03-20 | PRO | B:187 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
PRO | D:187 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
PRO | F:187 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
PRO | H:187 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
1ki1 | 1 | P60953 | 96.79 | 6e-134 |
X-RAY |
2002-05-29 | PRO | A:180 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
PRO | C:180 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
1kz7 | 2 | P60953 | 96.79 | 6e-134 |
X-RAY |
2002-03-20 | PRO | B:180 | B:180 | 122.0 | 0.841 | S | -44.8 | 109.0 | 122.0 | 0.841 | 0.0 |
HOH |
2.779 |
CA |
O |
||
PRO | D:180 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
1kzg | 2 | P60953 | 96.79 | 6e-134 |
X-RAY |
2002-03-20 | PRO | B:180 | B:180 | 112.0 | 0.772 | -38.6 | 79.2 | 112.0 | 0.772 | 0.0 | |||||||
PRO | D:180 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
1a4r | 1 | P60953 | 94.76 | 7e-134 |
X-RAY |
1999-03-02 | PRO | A:180 | A:180 | 121.0 | 0.834 | S | -39.4 | -84.2 | 118.0 | 0.814 | 0.02 |
B:P60953:0.021 |
|||||
PRO | B:180 | B:380 | 137.0 | 0.945 | -65.5 | -37.7 | 132.0 | 0.91 | 0.035 |
A:P60953:0.034 |
|||||||||||||
3vhl | 2 | P60953 | 96.26 | 2e-133 |
X-RAY |
2012-06-20 | PRO | B:187 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
1nf3 | 1 | P60953 | 94.24 | 3e-133 |
X-RAY |
2003-03-04 | PRO | A:184 | A:180 | 141.0 | 0.972 | S | -63.5 | 8.1 | 141.0 | 0.972 | 0.0 |
HOH |
3.183 |
CD |
O |
||
PRO | B:184 | B:180 | 134.0 | 0.924 | S | -55.7 | -45.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4did | 1 | P60953 | 99.45 | 3e-133 |
X-RAY |
2012-02-29 | PRO | A:190 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
1e0a | 1 | P60953 | 97.31 | 8e-132 |
NMR |
2000-04-18 | PRO | A:180 | A:180 | 104.0 | 0.717 | -55.7 | 135.8 | 104.0 | 0.717 | 0.0 |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p60953-f1 | 1 | P60953 | 95.29 | 1e-135 | PRO | A:180 | A:180 | 86.0 | 0.593 | -59.0 | 132.8 |