Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr1 | 22417990 | . | C | A | CCDS221.1:NM_001039802.1:c.556Cgc>Agc_NP_001034891.1:p.186R>S | Homo sapiens cell division cycle 42 (CDC42), transcript variant 1, mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
2odb | 1 | P60953 | 100.0 | 1e-141 |
X-RAY |
2007-01-30 | ARG | A:187 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
5c2j | 2 | P60766 | 100.0 | 1e-141 |
X-RAY |
2016-06-22 | ARG | B:193 | B:186 | 10.0 | 0.044 | G | -106.5 | -14.7 | 10.0 | 0.044 | 0.0 |
HOH |
2.817 |
NE |
O |
||
2dfk | 2 | P60953 | 100.0 | 1e-141 |
X-RAY |
2006-05-02 | ARG | B:189 | B:186 | 93.0 | 0.413 | S | -84.6 | -11.3 | 93.0 | 0.413 | 0.0 |
HOH |
3.125 |
CB |
O |
||
ARG | D:189 | D:186 | 107.0 | 0.476 | -86.8 | -15.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
1grn | 1 | P60953 | 100.0 | 2e-141 |
X-RAY |
1999-12-22 | ARG | A:186 | A:186 | 78.0 | 0.347 | -125.8 | -29.9 | 78.0 | 0.347 | 0.0 |
HOH |
3.643 |
CB |
O |
|||
2ngr | 1 | P60953 | 100.0 | 2e-141 |
X-RAY |
1999-01-06 | ARG | A:186 | A:186 | 66.0 | 0.293 | -125.0 | -32.1 | 66.0 | 0.293 | 0.0 |
HOH |
3.042 |
N |
O |
|||
4itr | 2 | P60953 | 100.0 | 2e-141 |
X-RAY |
2013-02-20 | ARG | C:186 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ARG | D:186 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6siu | 2 | P60953 | 100.0 | 3e-141 |
X-RAY |
2020-03-18 | ARG | C:187 | C:186 | 45.0 | NA | T | 69.3 | -34.6 | 45.0 | NA | NA |
HOH |
5.110 |
C |
O |
||
ARG | D:187 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5fi1 | 2 | P60953 | 100.0 | 3e-141 |
X-RAY |
2016-04-20 | ARG | B:189 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
1an0 | 1 | P60953 | 100.0 | 1e-140 |
X-RAY |
1999-01-13 | ARG | A:186 | A:186 | 60.0 | 0.267 | -47.6 | 2.8 | 60.0 | 0.267 | 0.0 |
HOH |
6.342 |
C |
O |
|||
ARG | B:186 | B:186 | 49.0 | 0.218 | -71.3 | 17.9 | 49.0 | 0.218 | 0.0 |
HOH |
7.418 |
O |
O |
||||||||||
1a4r | 1 | P60953 | 99.48 | 4e-140 |
X-RAY |
1999-03-02 | ARG | A:186 | A:186 | 72.0 | 0.32 | -101.9 | -0.2 | 44.0 | 0.196 | 0.124 |
B:P60953:0.124 |
HOH |
2.519 |
NH1 |
O |
||
ARG | B:186 | B:386 | 62.0 | 0.276 | -112.7 | 15.0 | 38.0 | 0.169 | 0.107 |
A:P60953:0.107 |
|||||||||||||
2qrz | 1 | P60953 | 100.0 | 4e-140 |
X-RAY |
2008-03-18 | ARG | A:186 | A:186 | 69.0 | 0.307 | -95.1 | 11.6 | 48.0 | 0.213 | 0.094 |
B:P60953:0.093 |
HOH |
3.194 |
NH2 |
O |
||
ARG | B:186 | B:186 | 56.0 | 0.249 | -98.7 | 16.0 | 45.0 | 0.2 | 0.049 |
A:P60953:0.049 |
HOH |
3.221 |
NH1 |
O |
|||||||||
2wm9 | 2 | P60953 | 100.0 | 1e-139 |
X-RAY |
2009-09-22 | ARG | B:188 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
2wmn | 2 | P60953 | 100.0 | 1e-139 |
X-RAY |
2009-09-22 | ARG | B:188 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
2wmo | 2 | P60953 | 100.0 | 1e-139 |
X-RAY |
2009-09-22 | ARG | B:188 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
1nf3 | 1 | P60953 | 98.95 | 1e-139 |
X-RAY |
2003-03-04 | ARG | A:190 | A:186 | 11.0 | 0.049 | T | -95.7 | -21.4 | 11.0 | 0.049 | 0.0 |
HOH |
3.157 |
NH2 |
O |
||
ARG | B:190 | B:186 | 11.0 | 0.049 | H | -88.6 | -19.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1doa | 1 | P60953 | 100.0 | 1e-139 |
X-RAY |
2000-02-09 | ARG | A:189 | A:186 | 228.0 | 1.0 | -81.7 | -19.8 | 34.0 | 0.151 | 0.849 |
B:P19803:0.862 |
GER HOH |
2.932 3.750 |
O NH2 |
C1 O |
||
6tky | 2 | P60953 | 100.0 | 2e-139 |
X-RAY |
2020-01-22 | ARG | B:186 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ARG | C:186 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6tkz | 2 | P60953 | 100.0 | 2e-139 |
X-RAY |
2020-01-22 | ARG | B:186 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ARG | C:186 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6aj4 | 2 | P60953 | 100.0 | 1e-138 |
X-RAY |
2019-03-20 | ARG | B:193 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ARG | D:193 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | F:193 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | H:193 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
6ajl | 2 | P60953 | 100.0 | 1e-138 |
X-RAY |
2019-03-20 | ARG | B:193 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ARG | D:193 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | F:193 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | H:193 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
1ki1 | 1 | P60953 | 100.0 | 1e-138 |
X-RAY |
2002-05-29 | ARG | A:186 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ARG | C:186 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
1kz7 | 2 | P60953 | 100.0 | 1e-138 |
X-RAY |
2002-03-20 | ARG | B:186 | B:186 | 69.0 | 0.307 | -66.4 | 164.1 | 69.0 | 0.307 | 0.0 |
HOH |
2.614 |
N |
O |
|||
ARG | D:186 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
1kzg | 2 | P60953 | 100.0 | 1e-138 |
X-RAY |
2002-03-20 | ARG | B:186 | B:186 | 78.0 | 0.347 | -101.5 | 145.8 | 78.0 | 0.347 | 0.0 |
HOH |
6.916 |
CB |
O |
|||
ARG | D:186 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
3vhl | 2 | P60953 | 99.47 | 6e-138 |
X-RAY |
2012-06-20 | ARG | B:193 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
5hzk | 1 | P60953 | 96.79 | 3e-134 |
X-RAY |
2016-12-21 | ARG | A:188 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ARG | C:188 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p60953-f1 | 1 | P60953 | 100.0 | 8e-142 | ARG | A:186 | A:186 | 240.0 | 1.0 | -62.6 | 109.6 |