Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr1 10042404 . C A CCDS108.1:NM_022787.3:c.485tCc>tAc_NP_073624.2:p.162S>Y Homo sapiens nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 1 (NMNAT1), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
1kqn 1 Q9HAN9 100.0 0.0 X-RAY
 2003-01-07 SER A:162 A:162 24.0 0.209 H -66.7 -19.8 24.0 0.209 0.0 NAD
XE
HOH
 5.043
6.992
3.042
 OG
C
OG
 C5N
XE
O
SER B:162 B:162 26.0 0.226 H -70.4 -7.8 26.0 0.226 0.0 NAD
XE
HOH
 5.096
7.134
2.749
 OG
C
OG
 C5N
XE
O
SER C:162 C:162 26.0 0.226 G -63.0 -16.4 26.0 0.226 0.0 NAD
XE
HOH
 5.014
7.195
3.058
 OG
C
OG
 C5N
XE
O
SER D:162 D:162 27.0 0.235 G -69.6 -5.0 27.0 0.235 0.0 NAD
HOH
 5.160
6.515
 OG
O
 C5N
O
SER E:162 E:162 23.0 0.2 G -65.5 -15.8 23.0 0.2 0.0 NAD
HOH
 5.064
2.954
 OG
OG
 C5N
O
SER F:162 F:162 24.0 0.209 G -70.1 -12.2 24.0 0.209 0.0 NAD
HOH
 5.143
4.279
 OG
O
 C5N
O
1kqo 1 Q9HAN9 100.0 0.0 X-RAY
 2003-01-07 SER A:162 A:162 26.0 0.226 H -67.2 -12.8 26.0 0.226 0.0 DND
HOH
 5.301
3.405
 OG
CA
 C5N
O
SER B:162 B:162 26.0 0.226 H -66.6 -15.0 26.0 0.226 0.0 DND
HOH
 5.288
7.249
 OG
OG
 C5N
O
SER C:162 C:162 24.0 0.209 G -63.9 -17.0 24.0 0.209 0.0 DND
HOH
 5.131
4.310
 OG
O
 C5N
O
SER D:162 D:162 25.0 0.217 G -64.7 -7.5 25.0 0.217 0.0 DND
HOH
 5.223
4.858
 OG
OG
 C5N
O
SER E:162 E:162 26.0 0.226 G -75.6 -4.1 26.0 0.226 0.0 DND
HOH
 5.186
3.002
 OG
OG
 C5N
O
SER F:162 F:162 25.0 0.217 G -72.9 -11.3 25.0 0.217 0.0 DND
HOH
 5.059
2.952
 OG
OG
 C5N
O
1kr2 1 Q9HAN9 100.0 0.0 X-RAY
 2003-01-08 SER A:162 A:162 24.0 0.209 G -69.7 -9.8 24.0 0.209 0.0 TAD
HOH
 5.524
3.737
 OG
N
 S1N
O
SER B:162 B:162 25.0 0.217 G -64.4 -9.1 25.0 0.217 0.0 TAD
HOH
 5.362
4.045
 OG
O
 S1N
O
SER C:162 C:162 25.0 0.217 G -64.4 -13.1 25.0 0.217 0.0 TAD
HOH
 5.286
2.994
 OG
OG
 S1N
O
SER D:162 D:162 24.0 0.209 G -66.8 -9.9 24.0 0.209 0.0 TAD
HOH
 5.491
3.991
 OG
O
 S1N
O
SER E:162 E:162 22.0 0.191 G -67.1 -15.5 22.0 0.191 0.0 TAD
HOH
 5.327
3.543
 OG
N
 S1N
O
SER F:162 F:162 24.0 0.209 G -62.8 -12.4 24.0 0.209 0.0 TAD
HOH
 5.536
4.360
 OG
O
 S1N
O
1kku 1 Q9HAN9 99.64 0.0 X-RAY
 2002-06-10 SER A:162 A:162 30.0 0.261 H -62.0 -30.1 30.0 0.261 0.0 HOH
 8.131
 OG
 O
1gzu 1 Q9HAN9 100.0 0.0 X-RAY
 2002-07-05 SER A:173 A:162 26.0 0.226 H -69.4 -12.8 26.0 0.226 0.0 NMN
 5.742
 OG
 C6
SER B:173 B:162 25.0 0.217 H -75.4 -7.7 25.0 0.217 0.0 NMN
 5.478
 OG
 C5
SER C:173 C:162 29.0 0.252 H -63.2 -15.9 29.0 0.252 0.0 NMN
 5.520
 OG
 C5

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-q9han9-f1 1 Q9HAN9 100.0 0.0 SER A:162 A:162 22.0 0.191 G -64.6 -16.5