Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr1 100672002 . G A CCDS767.1:NM_001918.3:c.1208tCa>tTa_NP_001909.3:p.403S>L Homo sapiens dihydrolipoamide branched chain transacylase E2 (DBT), mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
2ihw 1 P11181 91.51 3e-176 X-RAY
 2006-12-26 SER A:183 A:342 90.0 0.783 G -54.5 -24.7 90.0 0.783 0.0 ACT
HOH
 9.082
6.309
 OG
OG
 CH3
O
SER B:183 B:342 89.0 0.774 G -52.5 -25.1 89.0 0.774 0.0 ACT
HOH
 8.927
6.311
 OG
CB
 OXT
O
SER C:183 C:342 91.0 0.791 G -56.7 -19.2 91.0 0.791 0.0 ACT
HOH
 9.677
5.246
 OG
N
 O
O
SER D:183 D:342 89.0 0.774 G -62.2 -21.3 89.0 0.774 0.0 ACT
HOH
 9.189
7.852
 OG
CB
 O
O
SER E:183 E:342 89.0 0.774 G -50.2 -32.5 89.0 0.774 0.0 ACT
HOH
 9.099
8.284
 OG
CB
 CH3
O
SER F:183 F:342 92.0 0.8 G -75.0 -19.1 92.0 0.8 0.0 ACT
HOH
 9.007
9.260
 OG
N
 CH3
O
SER G:183 G:342 92.0 0.8 G -65.5 -18.1 92.0 0.8 0.0 ACT
HOH
 9.089
9.516
 OG
C
 OXT
O
SER H:183 H:342 89.0 0.774 G -50.5 -28.4 89.0 0.774 0.0 ACT
HOH
 8.935
6.171
 OG
OG
 O
O
2ii3 1 P11181 91.51 3e-176 X-RAY
 2006-12-26 SER A:183 A:342 93.0 0.809 G -68.5 -20.2 93.0 0.809 0.0 CAO
HOH
 3.101
2.771
 OG
O
 N8P
O
SER B:183 B:342 88.0 0.765 G -67.3 -18.8 88.0 0.765 0.0 ACT
CAO
HOH
 8.752
3.100
3.028
 OG
OG
O
 CH3
O9P
O
SER C:183 C:342 94.0 0.817 G -58.2 -29.0 94.0 0.817 0.0 ACT
CAO
HOH
 9.072
2.764
2.743
 OG
OG
O
 CH3
O9P
O
SER D:183 D:342 90.0 0.783 G -64.4 -22.5 90.0 0.783 0.0 ACT
CAO
ACT
HOH
 8.739
2.985
4.143
2.794
 OG
OG
OG
O
 CH3
O9P
CH3
O
SER E:183 E:342 91.0 0.791 G -61.7 -27.9 91.0 0.791 0.0 CAO
HOH
 2.425
2.774
 OG
O
 N8P
O
SER F:183 F:342 92.0 0.8 G -62.2 -20.3 92.0 0.8 0.0 ACT
CAO
HOH
 8.816
3.415
3.486
 OG
OG
O
 CH3
O9P
O
SER G:183 G:342 89.0 0.774 G -69.7 -21.8 89.0 0.774 0.0 CAO
HOH
 2.549
3.101
 OG
O
 N8P
O
SER H:183 H:342 93.0 0.809 G -73.5 -16.7 93.0 0.809 0.0 ACT
ACT
CAO
HOH
 3.824
8.730
3.094
2.741
 OG
OG
OG
O
 CH3
CH3
OAP
O
2ii4 1 P11181 91.51 3e-176 X-RAY
 2006-12-26 SER A:183 A:342 93.0 0.809 G -73.3 -18.0 93.0 0.809 0.0 COA
HOH
 2.874
2.721
 OG
OG
 N8P
O
SER B:183 B:342 90.0 0.783 G -71.2 -11.5 90.0 0.783 0.0 COA
HOH
 2.867
3.568
 OG
O
 N8P
O
SER C:183 C:342 91.0 0.791 G -66.0 -14.7 91.0 0.791 0.0 COA
HOH
 2.852
3.441
 OG
O
 N8P
O
SER D:183 D:342 89.0 0.774 G -67.5 -10.1 89.0 0.774 0.0 COA
HOH
 2.810
6.156
 OG
CB
 N8P
O
SER E:183 E:342 94.0 0.817 G -68.2 -19.1 94.0 0.817 0.0 COA
HOH
 2.704
5.907
 OG
CB
 N8P
O
SER F:183 F:342 91.0 0.791 G -76.2 -13.3 91.0 0.791 0.0 COA
HOH
 2.777
4.246
 OG
O
 N8P
O
SER G:183 G:342 91.0 0.791 G -62.2 -20.3 91.0 0.791 0.0 COA
HOH
 2.756
5.144
 OG
OG
 N8P
O
SER H:183 H:342 93.0 0.809 G -69.3 -17.8 93.0 0.809 0.0 COA
HOH
 2.720
6.132
 OG
CB
 N8P
O
2ii5 1 P11181 91.51 3e-176 X-RAY
 2006-12-26 SER A:183 A:342 91.0 0.791 G -70.5 -5.4 91.0 0.791 0.0 ACT
CO6
HOH
 9.561
3.828
6.150
 OG
CB
OG
 CH3
N7A
O
SER B:183 B:342 88.0 0.765 G -65.1 -13.5 88.0 0.765 0.0 ACT
CO6
HOH
 9.377
3.843
8.751
 OG
N
N
 OXT
N6A
O
SER C:183 C:342 91.0 0.791 G -65.1 -15.6 91.0 0.791 0.0 ACT
CO6
HOH
 9.754
3.786
4.298
 OG
N
O
 O
N6A
O
SER D:183 D:342 88.0 0.765 G -69.3 -6.7 88.0 0.765 0.0 ACT
CO6
HOH
 9.173
3.966
8.939
 OG
CA
N
 CH3
N7A
O
SER E:183 E:342 93.0 0.809 G -51.9 -21.7 93.0 0.809 0.0 ACT
CO6
HOH
 9.702
3.374
8.934
 OG
OG
N
 CH3
C9P
O
SER F:183 F:342 94.0 0.817 G -70.1 -9.2 94.0 0.817 0.0 ACT
CO6
HOH
 9.247
3.536
9.075
 OG
CB
N
 CH3
O4A
O
SER G:183 G:342 94.0 0.817 G -61.9 -16.8 94.0 0.817 0.0 ACT
CO6
HOH
 9.456
3.732
9.748
 OG
CB
C
 OXT
O2A
O
SER H:183 H:342 93.0 0.809 G -63.9 -21.7 93.0 0.809 0.0 ACT
CO6
HOH
 9.198
3.652
6.434
 OG
CB
OG
 O
O2A
O

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p11182-f1 1 P11182 100.0 0.0 SER A:403 A:403 96.0 0.835 G -73.6 -28.8