Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr1 100672014 . G A CCDS767.1:NM_001918.3:c.1196tCc>tTc_NP_001909.3:p.399S>F Homo sapiens dihydrolipoamide branched chain transacylase E2 (DBT), mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
2ihw 1 P11181 91.51 3e-176 X-RAY
 2006-12-26 SER A:179 A:338 22.0 0.191 E -141.7 122.8 20.0 0.174 0.017 B:P11181:0.017
 ACT
ACT
HOH
 4.869
3.863
3.438
 OG
OG
CA
 CH3
CH3
O
SER B:179 B:338 25.0 0.217 E -142.0 112.2 22.0 0.191 0.026 C:P11181:0.026
 ACT
ACT
HOH
 4.713
4.805
7.259
 OG
OG
O
 CH3
CH3
O
SER C:179 C:338 23.0 0.2 E -147.9 116.1 21.0 0.183 0.017 A:P11181:0.017
 ACT
ACT
HOH
 4.546
5.029
6.292
 OG
OG
OG
 CH3
CH3
O
SER D:179 D:338 28.0 0.243 E -129.5 119.1 27.0 0.235 0.008 E:P11181:0.009
 ACT
ACT
HOH
 4.363
4.439
8.424
 OG
OG
N
 CH3
CH3
O
SER E:179 E:338 25.0 0.217 E -128.4 111.6 23.0 0.2 0.017 F:P11181:0.017
 ACT
ACT
HOH
 4.403
3.627
7.091
 OG
OG
O
 CH3
CH3
O
SER F:179 F:338 23.0 0.2 E -137.7 116.4 22.0 0.191 0.009 D:P11181:0.009
 ACT
ACT
HOH
 4.419
4.002
6.624
 OG
OG
O
 CH3
CH3
O
SER G:179 G:338 24.0 0.209 E -160.7 102.9 22.0 0.191 0.018 G:P11181:0.017
 ACT
ACT
HOH
 4.579
4.549
8.652
 OG
OG
CB
 CH3
CH3
O
SER H:179 H:338 22.0 0.191 E -136.3 118.0 21.0 0.183 0.008 H:P11181:0.009
 ACT
ACT
HOH
 4.755
4.382
3.250
 OG
OG
CA
 CH3
CH3
O
2ii3 1 P11181 91.51 3e-176 X-RAY
 2006-12-26 SER A:179 A:338 25.0 0.217 E -121.1 108.6 22.0 0.191 0.026 B:P11181:0.026
 ACT
CAO
HOH
 4.369
2.682
3.073
 OG
OG
OG
 CH3
N4P
O
SER B:179 B:338 27.0 0.235 E -125.7 110.7 23.0 0.2 0.035 C:P11181:0.035
 ACT
ACT
CAO
HOH
 4.497
4.109
5.988
2.869
 OG
OG
C
OG
 CH3
CH3
O9P
O
SER C:179 C:338 25.0 0.217 E -127.0 108.4 23.0 0.2 0.017 A:P11181:0.017
 ACT
ACT
CAO
HOH
 4.391
3.936
5.924
3.270
 OG
OG
C
OG
 CH3
CH3
CDP
O
SER D:179 D:338 26.0 0.226 E -122.2 112.6 24.0 0.209 0.017 E:P11181:0.017
 ACT
ACT
CAO
ACT
HOH
 4.518
4.048
5.866
3.155
3.101
 OG
OG
C
OG
OG
 CH3
CH3
CDP
OXT
O
SER E:179 E:338 28.0 0.243 E -121.1 105.2 19.0 0.165 0.078 F:P11181:0.078
 ACT
CAO
HOH
 4.568
2.648
3.117
 OG
OG
OG
 CH3
N4P
O
SER F:179 F:338 26.0 0.226 E -125.6 115.2 23.0 0.2 0.026 D:P11181:0.026
 ACT
ACT
CAO
HOH
 4.523
3.939
5.748
3.070
 OG
OG
C
OG
 CH3
CH3
CDP
O
SER G:179 G:338 29.0 0.252 E -125.1 107.6 23.0 0.2 0.052 G:P11181:0.052
 ACT
CAO
HOH
 4.609
2.797
3.335
 CB
OG
OG
 CH3
N4P
O
SER H:179 H:338 30.0 0.261 E -124.5 109.7 24.0 0.209 0.052 H:P11181:0.052
 ACT
ACT
ACT
CAO
HOH
 3.133
4.473
3.896
5.875
3.019
 OG
OG
OG
C
OG
 O
CH3
CH3
OAP
O
2ii4 1 P11181 91.51 3e-176 X-RAY
 2006-12-26 SER A:179 A:338 27.0 0.235 E -119.8 102.6 25.0 0.217 0.018 B:P11181:0.017
 COA
HOH
 2.738
3.157
 OG
OG
 N4P
O
SER B:179 B:338 29.0 0.252 E -126.9 98.7 25.0 0.217 0.035 C:P11181:0.035
 COA
HOH
 2.779
2.806
 OG
OG
 N4P
O
SER C:179 C:338 27.0 0.235 E -120.4 100.2 23.0 0.2 0.035 A:P11181:0.035
 COA
HOH
 2.842
2.953
 OG
OG
 N4P
O
SER D:179 D:338 29.0 0.252 E -116.9 102.5 23.0 0.2 0.052 E:P11181:0.052
 COA
HOH
 2.674
3.014
 OG
OG
 N4P
O
SER E:179 E:338 28.0 0.243 E -121.8 93.1 23.0 0.2 0.043 F:P11181:0.043
 COA
HOH
 2.725
2.729
 OG
OG
 N4P
O
SER F:179 F:338 26.0 0.226 E -123.6 102.9 21.0 0.183 0.043 D:P11181:0.043
 COA
HOH
 2.773
3.151
 OG
OG
 N4P
O
SER G:179 G:338 28.0 0.243 E -121.6 95.2 25.0 0.217 0.026 G:P11181:0.026
 COA
HOH
 2.939
2.988
 OG
OG
 N4P
O
SER H:179 H:338 27.0 0.235 E -121.0 100.5 23.0 0.2 0.035 H:P11181:0.035
 COA
HOH
 2.958
3.022
 OG
OG
 N4P
O
2ii5 1 P11181 91.51 3e-176 X-RAY
 2006-12-26 SER A:179 A:338 23.0 0.2 E -137.1 115.9 20.0 0.174 0.026 B:P11181:0.026
 ACT
ACT
CO6
HOH
 4.545
3.821
7.571
3.545
 OG
OG
O
CA
 CH3
CH3
N6A
O
SER B:179 B:338 26.0 0.226 E -131.4 112.3 24.0 0.209 0.017 C:P11181:0.017
 ACT
ACT
CO6
HOH
 4.758
4.767
7.570
2.786
 OG
OG
O
OG
 CH3
CH3
N6A
O
SER C:179 C:338 21.0 0.183 E -134.9 111.6 20.0 0.174 0.009 A:P11181:0.009
 ACT
ACT
CO6
HOH
 4.723
4.787
7.504
6.959
 OG
OG
O
O
 CH3
CH3
N6A
O
SER D:179 D:338 27.0 0.235 E -122.4 112.4 24.0 0.209 0.026 E:P11181:0.026
 ACT
ACT
CO6
HOH
 4.321
4.300
8.136
8.306
 OG
OG
O
N
 CH3
CH3
N6A
O
SER E:179 E:338 22.0 0.191 E -128.1 108.7 20.0 0.174 0.017 F:P11181:0.017
 ACT
ACT
CO6
HOH
 4.437
3.578
5.484
7.010
 OG
OG
C
O
 CH3
CH3
CDP
O
SER F:179 F:338 24.0 0.209 E -136.0 114.7 22.0 0.191 0.018 D:P11181:0.017
 ACT
ACT
CO6
HOH
 4.774
4.557
8.251
6.710
 OG
OG
O
O
 CH3
CH3
N6A
O
SER G:179 G:338 24.0 0.209 E -133.9 108.6 22.0 0.191 0.018 G:P11181:0.017
 ACT
ACT
CO6
HOH
 4.719
4.330
7.574
3.048
 CB
OG
O
OG
 CH3
CH3
N6A
O
SER H:179 H:338 22.0 0.191 E -137.6 113.7 20.0 0.174 0.017 H:P11181:0.017
 ACT
ACT
CO6
HOH
 4.736
4.702
7.713
3.484
 OG
OG
C
CA
 CH3
CH3
O6A
O

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p11182-f1 1 P11182 100.0 0.0 SER A:399 A:399 25.0 0.217 E -120.3 120.3