Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr1 100680396 . A C CCDS767.1:NM_001918.3:c.916Tcc>Gcc_NP_001909.3:p.306S>A Homo sapiens dihydrolipoamide branched chain transacylase E2 (DBT), mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
2ihw 1 P11181 91.51 3e-176 X-RAY
 2006-12-26 SER A:86 A:245 46.0 0.4 -86.0 -170.9 46.0 0.4 0.0 HOH
 2.988
 OG
 O
SER B:86 B:245 47.0 0.409 -111.3 -158.2 47.0 0.409 0.0 HOH
 3.130
 OG
 O
SER C:86 C:245 51.0 0.443 -101.9 -158.7 51.0 0.443 0.0 HOH
 3.069
 CB
 O
SER D:86 D:245 49.0 0.426 -100.6 -165.9 49.0 0.426 0.0 HOH
 3.030
 OG
 O
SER E:86 E:245 49.0 0.426 -95.1 -160.7 49.0 0.426 0.0 HOH
 2.877
 OG
 O
SER F:86 F:245 46.0 0.4 -84.7 -165.3 46.0 0.4 0.0
SER G:86 G:245 52.0 0.452 -77.0 -165.9 52.0 0.452 0.0 HOH
 2.788
 N
 O
SER H:86 H:245 51.0 0.443 -84.6 178.0 51.0 0.443 0.0 HOH
 2.830
 N
 O
2ii3 1 P11181 91.51 3e-176 X-RAY
 2006-12-26 SER A:86 A:245 39.0 0.339 -94.1 -161.3 39.0 0.339 0.0 CAO
HOH
 2.759
3.049
 OG
N
 O5A
O
SER B:86 B:245 39.0 0.339 -101.9 -162.5 39.0 0.339 0.0 CAO
HOH
 2.648
3.046
 OG
N
 O5A
O
SER C:86 C:245 43.0 0.374 -89.4 -161.5 43.0 0.374 0.0 CAO
HOH
 2.619
3.048
 OG
N
 O5A
O
SER D:86 D:245 45.0 0.391 -89.6 -161.7 45.0 0.391 0.0 CAO
HOH
 2.615
2.875
 OG
N
 O5A
O
SER E:86 E:245 43.0 0.374 -100.5 -160.5 43.0 0.374 0.0 CAO
HOH
 2.815
3.085
 OG
N
 O5A
O
SER F:86 F:245 40.0 0.348 -99.0 -161.7 40.0 0.348 0.0 CAO
HOH
 2.523
3.589
 OG
OG
 O5A
O
SER G:86 G:245 37.0 0.322 -92.7 -164.2 37.0 0.322 0.0 CAO
HOH
 2.611
2.795
 OG
N
 O5A
O
SER H:86 H:245 39.0 0.339 -91.7 -168.7 39.0 0.339 0.0 CAO
HOH
 2.575
2.946
 OG
N
 O5A
O
2ii4 1 P11181 91.51 3e-176 X-RAY
 2006-12-26 SER A:86 A:245 41.0 0.357 -92.9 -159.2 41.0 0.357 0.0 COA
HOH
 2.699
2.891
 OG
N
 O5A
O
SER B:86 B:245 41.0 0.357 -91.6 -161.3 41.0 0.357 0.0 COA
HOH
 2.467
2.714
 OG
N
 O5A
O
SER C:86 C:245 39.0 0.339 -95.3 -158.5 39.0 0.339 0.0 COA
HOH
 2.622
2.880
 OG
N
 O5A
O
SER D:86 D:245 40.0 0.348 -91.6 -168.8 40.0 0.348 0.0 COA
HOH
 2.592
2.880
 OG
N
 O5A
O
SER E:86 E:245 40.0 0.348 -98.7 -158.3 40.0 0.348 0.0 COA
HOH
 2.633
3.165
 OG
N
 O5A
O
SER F:86 F:245 39.0 0.339 -96.8 -169.4 39.0 0.339 0.0 COA
HOH
 2.628
2.956
 OG
N
 O5A
O
SER G:86 G:245 39.0 0.339 -88.5 -163.5 39.0 0.339 0.0 COA
HOH
 2.574
2.900
 OG
N
 O5A
O
SER H:86 H:245 39.0 0.339 -89.1 -161.1 39.0 0.339 0.0 COA
HOH
 2.501
2.948
 OG
N
 O5A
O
2ii5 1 P11181 91.51 3e-176 X-RAY
 2006-12-26 SER A:86 A:245 45.0 0.391 -89.0 -171.4 45.0 0.391 0.0 CO6
HOH
 3.083
3.665
 OG
OG
 O5A
O
SER B:86 B:245 47.0 0.409 -97.6 -166.4 47.0 0.409 0.0 CO6
HOH
 2.477
2.799
 OG
N
 O5A
O
SER C:86 C:245 48.0 0.417 -108.0 -158.7 48.0 0.417 0.0 CO6
HOH
 2.519
3.222
 OG
OG
 O5A
O
SER D:86 D:245 49.0 0.426 -94.7 -165.8 49.0 0.426 0.0 CO6
HOH
 3.632
7.442
 CB
C
 O2A
O
SER E:86 E:245 46.0 0.4 -101.1 -169.8 46.0 0.4 0.0 CO6
HOH
 3.119
2.757
 OG
N
 O5A
O
SER F:86 F:245 46.0 0.4 -94.1 -167.1 46.0 0.4 0.0 CO6
 3.477
 OG
 O5A
SER G:86 G:245 44.0 0.383 -85.6 -164.4 44.0 0.383 0.0 CO6
HOH
 2.981
2.600
 OG
N
 O5A
O
SER H:86 H:245 49.0 0.426 -93.3 -172.8 49.0 0.426 0.0 CO6
HOH
 3.057
2.782
 OG
N
 O5A
O

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p11182-f1 1 P11182 100.0 0.0 SER A:306 A:306 45.0 0.391 -102.5 -174.7