Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr1 110199018 . A C CCDS806.1:NM_147148.2:c.7Atg>Ctg_NP_671489.1:p.3M>L Homo sapiens glutathione S-transferase mu 4 (GSTM4), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
4gtu 1 Q03013 100.0 5e-165 X-RAY
 2000-01-14 MET A:2 A:2 6.0 0.032 E -88.0 149.7 6.0 0.032 0.0
MET B:2 B:2 15.0 0.081 E -137.9 160.6 15.0 0.081 0.0
MET C:2 C:2 22.0 0.119 E -108.2 152.9 NA NA NA
MET D:2 D:2 18.0 0.097 E -103.0 148.4 NA NA NA
MET E:2 E:2 19.0 0.103 E -75.0 150.3 NA NA NA
MET F:2 F:2 8.0 0.043 E -135.7 160.7 NA NA NA
MET G:2 G:2 19.0 0.103 -78.3 151.9 NA NA NA
MET H:2 H:2 22.0 0.119 E -105.7 147.7 NA NA NA
1xw6 1 P09488 86.7 6e-145 X-RAY
 2004-12-21 MET A:3 A:2 20.0 0.108 E -56.3 139.1 20.0 0.108 0.0 HOH
 3.304
 CE
 O
MET B:3 B:2 21.0 0.114 E -61.0 143.3 21.0 0.114 0.0 HOH
 3.678
 CE
 O
MET C:3 C:2 19.0 0.103 E -82.8 162.3 NA NA NA
MET D:3 D:2 22.0 0.119 E -43.9 142.5 NA NA NA
1xwk 1 P09488 86.7 6e-145 X-RAY
 2004-12-21 MET A:3 A:2 14.0 0.076 E -64.0 158.3 14.0 0.076 0.0 HOH
 4.313
 CA
 O
MET B:3 B:2 15.0 0.081 E -64.7 160.3 NA NA NA
MET C:3 C:2 13.0 0.07 E -65.2 157.2 13.0 0.07 0.0 HOH
 7.095
 SD
 O
1yj6 1 P09488 86.7 6e-145 X-RAY
 2005-02-01 MET A:3 A:2 18.0 0.097 E -62.7 153.9 18.0 0.097 0.0 HOH
 5.751
 N
 O
MET B:3 B:2 20.0 0.108 E -59.4 153.1 20.0 0.108 0.0 HOH
 5.055
 CA
 O
MET C:3 C:2 21.0 0.114 E -59.4 156.0 NA NA NA
2f3m 1 P09488 86.7 6e-145 X-RAY
 2006-04-25 MET A:3 A:2 12.0 0.065 E -77.1 145.0 12.0 0.065 0.0
MET B:3 B:2 12.0 0.065 E -78.4 146.4 12.0 0.065 0.0
MET C:3 C:2 15.0 0.081 E -75.7 146.9 NA NA NA
MET D:3 D:2 12.0 0.065 E -74.5 148.5 NA NA NA
MET E:3 E:2 11.0 0.059 E -78.1 146.1 NA NA NA
MET F:3 F:2 10.0 0.054 E -79.3 145.4 NA NA NA
7beu 1 P09488 86.7 6e-145 X-RAY
 2022-01-12 MET A:3 A:2 14.0 0.076 E -70.6 158.3 14.0 0.076 0.0 HOH
 3.253
 CE
 O
MET B:3 B:2 16.0 0.086 E -60.9 151.9 NA NA NA
MET C:3 C:2 13.0 0.07 E -69.0 160.2 NA NA NA
MET D:3 D:2 17.0 0.092 E -63.5 157.7 17.0 0.092 0.0 HOH
 3.401
 CE
 O
1gtu 1 P09488 87.04 3e-144 X-RAY
 1999-02-02 MET A:2 A:2 17.0 0.092 E -64.9 149.2 17.0 0.092 0.0
MET B:2 B:2 14.0 0.076 E -72.2 147.6 14.0 0.076 0.0
MET C:2 C:2 14.0 0.076 E -67.7 140.1 NA NA NA
MET D:2 D:2 12.0 0.065 E -67.3 139.2 NA NA NA
2c4j 1 P28161 82.57 5e-139 X-RAY
 2005-10-26 MET A:3 A:3 7.0 0.038 E -65.9 156.8 7.0 0.038 0.0 HOH
 3.625
 CE
 O
MET B:3 B:3 14.0 0.076 E -122.0 116.3 14.0 0.076 0.0 HOH
 2.994
 N
 O
MET C:3 C:3 12.0 0.065 E -72.3 155.6 NA NA NA
MET D:3 D:3 7.0 0.038 E -73.2 158.7 NA NA NA
1xw5 1 P28161 83.33 6e-139 X-RAY
 2004-11-30 MET A:2 A:2 16.0 0.086 E -72.7 137.8 16.0 0.086 0.0 HOH
 3.265
 CE
 O
MET B:2 B:2 17.0 0.092 E -70.7 138.4 17.0 0.092 0.0 HOH
 3.081
 CE
 O
1ykc 1 P28161 83.33 6e-139 X-RAY
 2005-01-25 MET A:2 A:2 16.0 0.086 E -73.9 150.6 16.0 0.086 0.0 HOH
 3.625
 CE
 O
MET B:2 B:2 16.0 0.086 E -74.9 138.8 16.0 0.086 0.0 HOH
 3.343
 CE
 O
2ab6 1 P28161 83.33 6e-139 X-RAY
 2005-08-02 MET A:2 A:2 17.0 0.092 E -55.7 149.6 17.0 0.092 0.0 HOH
 5.209
 N
 O
MET B:2 B:2 17.0 0.092 E -57.6 151.4 17.0 0.092 0.0 HOH
 4.043
 CA
 O
MET C:2 C:2 17.0 0.092 E -54.8 149.6 NA NA NA
MET D:2 D:2 16.0 0.086 E -56.3 152.8 NA NA NA
2gtu 1 P28161 83.33 6e-139 X-RAY
 1999-03-02 MET A:2 A:2 11.0 0.059 E -70.8 161.7 11.0 0.059 0.0 HOH
 3.435
 CE
 O
MET B:2 B:2 11.0 0.059 E -73.0 163.3 11.0 0.059 0.0 HOH
 3.878
 CE
 O
3gtu 1 P28161 83.33 6e-139 X-RAY
 1999-07-29 MET A:2 A:2 15.0 0.081 E -64.4 154.0 15.0 0.081 0.0
MET C:2 C:2 15.0 0.081 E -61.5 155.6 NA NA NA
3gur 1 P28161 83.33 6e-139 X-RAY
 2009-10-27 MET A:2 A:2 17.0 0.092 E -68.1 156.0 17.0 0.092 0.0 HOH
 3.570
 CE
 O
MET B:2 B:2 16.0 0.086 E -83.6 161.5 16.0 0.086 0.0 HOH
 3.502
 N
 O
MET C:2 C:2 18.0 0.097 E -84.0 155.7 NA NA NA
MET D:2 D:2 11.0 0.059 E -67.8 157.3 NA NA NA
5hwl 1 P28161 83.33 6e-139 X-RAY
 2017-11-08 MET A:2 A:2 18.0 0.097 E -85.7 147.2 18.0 0.097 0.0 HOH
 3.694
 C
 O
MET B:2 B:2 52.0 0.281 360.0 127.9 52.0 0.281 0.0 HOH
 7.494
 O
 O
1hna 1 P28161 82.87 9e-138 X-RAY
 1994-01-31 MET A:2 A:2 10.0 0.054 E -86.0 158.7 10.0 0.054 0.0 HOH
 4.065
 CG
 O
1hnb 1 P28161 82.87 9e-138 X-RAY
 1994-01-31 MET A:2 A:2 14.0 0.076 E -118.6 174.7 14.0 0.076 0.0
MET B:2 B:2 28.0 0.151 E -69.2 169.2 28.0 0.151 0.0
1hnc 1 P28161 82.87 9e-138 X-RAY
 1994-01-31 MET A:2 A:2 25.0 0.135 E -76.1 156.8 25.0 0.135 0.0
MET B:2 B:2 18.0 0.097 E -77.8 164.1 18.0 0.097 0.0
MET C:2 C:2 8.0 0.043 E -70.0 166.5 NA NA NA
MET D:2 D:2 11.0 0.059 E -83.6 168.0 NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-q03013-f1 1 Q03013 100.0 3e-166 MET A:3 A:3 15.0 0.081 E -70.7 156.7
af-p09488-f1 1 P09488 86.7 3e-145 MET A:3 A:3 16.0 0.086 E -63.3 153.0
af-p28161-f1 1 P28161 83.03 6e-140 MET A:3 A:3 8.0 0.043 E -62.7 151.1
af-p46439-f1 1 P46439 83.03 1e-134 MET A:3 A:3 15.0 0.081 E -63.5 152.4