Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr1 | 110210740 | . | G | A | CCDS808.1:NM_000848.3:c.3atG>atA_NP_000839.1:p.1M>I | Homo sapiens glutathione S-transferase mu 2 (GSTM2), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 2c4j | 1 | P28161 | 99.54 | 3e-164 |
X-RAY |
2005-10-26 | MET | A:1 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| MET | B:1 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| MET | C:1 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| MET | D:1 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1xw6 | 1 | P09488 | 84.4 | 8e-141 |
X-RAY |
2004-12-21 | MET | A:1 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| MET | B:1 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| MET | C:1 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| MET | D:1 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1xwk | 1 | P09488 | 84.4 | 8e-141 |
X-RAY |
2004-12-21 | MET | A:1 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| MET | B:1 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| MET | C:1 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1yj6 | 1 | P09488 | 84.4 | 8e-141 |
X-RAY |
2005-02-01 | MET | A:1 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| MET | B:1 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| MET | C:1 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2f3m | 1 | P09488 | 84.4 | 8e-141 |
X-RAY |
2006-04-25 | MET | A:1 | A:0 | 199.0 | 1.0 | 360.0 | 130.6 | 199.0 | 1.0 | 0.0 | |||||||
| MET | B:1 | B:0 | 196.0 | 1.0 | 360.0 | 118.6 | 196.0 | 1.0 | 0.0 | ||||||||||||||
| MET | C:1 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| MET | D:1 | D:0 | 221.0 | 1.0 | 360.0 | 124.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| MET | E:1 | E:0 | 205.0 | 1.0 | 360.0 | 112.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| MET | F:1 | F:0 | 179.0 | 0.968 | 360.0 | 130.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 7beu | 1 | P09488 | 84.4 | 8e-141 |
X-RAY |
2022-01-12 | MET | A:1 | A:0 | 224.0 | 1.0 | 360.0 | 114.1 | 224.0 | 1.0 | 0.0 |
HOH |
3.229 |
N |
O |
|||
| MET | B:1 | B:0 | 212.0 | 1.0 | 360.0 | 61.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| MET | C:1 | C:0 | 177.0 | 0.957 | 360.0 | 123.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| MET | D:1 | D:0 | 212.0 | 1.0 | 360.0 | -42.8 | 212.0 | 1.0 | 0.0 |
HOH |
1.845 |
O |
O |
||||||||||
| 2dc5 | 1 | 30354091 | 83.41 | 1e-140 |
X-RAY |
2006-06-28 | MSE | A:8 | A:8 | 177.0 | 0.957 | 360.0 | 171.3 | 177.0 | 0.957 | 0.0 |
HOH |
2.954 |
CA |
O |
|||
| MSE | B:8 | B:8 | 218.0 | 1.0 | 360.0 | 116.3 | 218.0 | 1.0 | 0.0 |
HOH |
2.725 |
O |
O |
||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p28161-f1 | 1 | P28161 | 100.0 | 3e-165 | MET | A:1 | A:1 | 209.0 | 1.0 | 360.0 | 143.4 | ||
| af-p09488-f1 | 1 | P09488 | 84.4 | 3e-141 | MET | A:1 | A:1 | 209.0 | 1.0 | 360.0 | 143.3 | ||
| af-q03013-f1 | 1 | Q03013 | 83.03 | 6e-140 | MET | A:1 | A:1 | 209.0 | 1.0 | 360.0 | 140.9 | ||
| af-p46439-f1 | 1 | P46439 | 81.19 | 6e-134 | MET | A:1 | A:1 | 209.0 | 1.0 | 360.0 | 146.0 | ||