Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr1 110255280 . C A CCDS811.1:NM_000851.3:c.77tCa>tAa_NP_000842.2:p.26S>* Homo sapiens glutathione S-transferase mu 5 (GSTM5), mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
1xw6 1 P09488 87.61 1e-141 X-RAY
 2004-12-21 SER A:26 A:25 24.0 0.209 -82.8 145.8 24.0 0.209 0.0 HOH
 2.675
 OG
 O
SER B:26 B:25 24.0 0.209 -80.9 145.6 24.0 0.209 0.0 HOH
 2.734
 OG
 O
SER C:26 C:25 25.0 0.217 -81.5 144.6 NA NA NA
SER D:26 D:25 25.0 0.217 -83.7 144.4 NA NA NA
1xwk 1 P09488 87.61 1e-141 X-RAY
 2004-12-21 SER A:26 A:25 22.0 0.191 -63.8 144.8 22.0 0.191 0.0 HOH
 2.707
 O
 O
SER B:26 B:25 21.0 0.183 -69.1 135.8 NA NA NA
SER C:26 C:25 20.0 0.174 -66.2 140.5 20.0 0.174 0.0 HOH
 4.917
 N
 O
1yj6 1 P09488 87.61 1e-141 X-RAY
 2005-02-01 SER A:26 A:25 20.0 0.174 -69.6 152.3 20.0 0.174 0.0 HOH
 6.300
 O
 O
SER B:26 B:25 20.0 0.174 -69.0 149.0 20.0 0.174 0.0 HOH
 4.830
 O
 O
SER C:26 C:25 22.0 0.191 -69.6 146.1 NA NA NA
2f3m 1 P09488 87.61 1e-141 X-RAY
 2006-04-25 SER A:26 A:25 21.0 0.183 -52.8 151.4 21.0 0.183 0.0
SER B:26 B:25 22.0 0.191 -94.4 135.5 22.0 0.191 0.0
SER C:26 C:25 23.0 0.2 -54.1 151.5 NA NA NA
SER D:26 D:25 20.0 0.174 -54.7 148.1 NA NA NA
SER E:26 E:25 22.0 0.191 -54.2 151.8 NA NA NA
SER F:26 F:25 16.0 0.139 -66.2 127.1 NA NA NA
7beu 1 P09488 87.61 1e-141 X-RAY
 2022-01-12 SER A:26 A:25 19.0 0.165 -71.4 145.4 19.0 0.165 0.0 HOH
 2.573
 OG
 O
SER B:26 B:25 20.0 0.174 -72.9 145.6 NA NA NA
SER C:26 C:25 24.0 0.209 -69.8 144.0 NA NA NA
SER D:26 D:25 20.0 0.174 -74.6 142.7 20.0 0.174 0.0 HOH
 2.419
 OG
 O
1gtu 1 P09488 87.56 1e-140 X-RAY
 1999-02-02 SER A:25 A:25 23.0 0.2 -64.9 134.3 23.0 0.2 0.0
SER B:25 B:25 21.0 0.183 -58.9 129.1 21.0 0.183 0.0 HOH
 8.871
 O
 O
SER C:25 C:25 23.0 0.2 -73.2 140.5 NA NA NA
SER D:25 D:25 22.0 0.191 -72.7 138.1 NA NA NA
2c4j 1 P28161 81.19 8e-134 X-RAY
 2005-10-26 SER A:26 A:26 19.0 0.165 -75.2 141.1 19.0 0.165 0.0 HOH
 2.660
 OG
 O
SER B:26 B:26 19.0 0.165 -66.1 146.7 19.0 0.165 0.0 HOH
 2.622
 OG
 O
SER C:26 C:26 18.0 0.157 -73.7 143.9 NA NA NA
SER D:26 D:26 19.0 0.165 -67.2 141.6 NA NA NA
2dc5 1 30354091 81.57 1e-133 X-RAY
 2006-06-28 SER A:33 A:33 22.0 0.191 -73.6 150.7 22.0 0.191 0.0 HOH
 2.661
 OG
 O
SER B:33 B:33 21.0 0.183 -78.4 146.7 21.0 0.183 0.0 HOH
 2.644
 OG
 O
4gtu 1 Q03013 83.33 2e-133 X-RAY
 2000-01-14 SER A:25 A:25 19.0 0.165 -69.2 125.1 19.0 0.165 0.0
SER B:25 B:25 26.0 0.226 -67.6 116.9 26.0 0.226 0.0
SER C:25 C:25 15.0 0.13 -65.2 107.0 NA NA NA
SER D:25 D:25 25.0 0.217 -85.9 131.9 NA NA NA
SER E:25 E:25 12.0 0.104 -76.0 122.4 NA NA NA
SER F:25 F:25 28.0 0.243 -80.4 135.1 NA NA NA
SER G:25 G:25 17.0 0.148 -83.9 135.6 NA NA NA
SER H:25 H:25 14.0 0.122 -24.0 114.1 NA NA NA
1xw5 1 P28161 81.11 1e-132 X-RAY
 2004-11-30 SER A:25 A:25 24.0 0.209 -75.5 152.5 24.0 0.209 0.0 HOH
 2.637
 OG
 O
SER B:25 B:25 19.0 0.165 -78.6 146.5 19.0 0.165 0.0 HOH
 2.643
 OG
 O
1ykc 1 P28161 81.11 1e-132 X-RAY
 2005-01-25 SER A:25 A:25 19.0 0.165 -65.7 139.5 19.0 0.165 0.0 HOH
 2.964
 OG
 O
SER B:25 B:25 20.0 0.174 -71.7 138.3 20.0 0.174 0.0 HOH
 2.659
 OG
 O
2ab6 1 P28161 81.11 1e-132 X-RAY
 2005-08-02 SER A:25 A:25 18.0 0.157 -79.7 140.4 18.0 0.157 0.0 HOH
 6.180
 O
 O
SER B:25 B:25 17.0 0.148 -79.6 138.9 17.0 0.148 0.0 HOH
 9.543
 OG
 O
SER C:25 C:25 17.0 0.148 -79.5 137.6 NA NA NA
SER D:25 D:25 17.0 0.148 -79.2 137.2 NA NA NA
2gtu 1 P28161 81.11 1e-132 X-RAY
 1999-03-02 SER A:25 A:25 16.0 0.139 -63.1 140.8 16.0 0.139 0.0 HOH
 2.831
 O
 O
SER B:25 B:25 19.0 0.165 -67.5 143.4 19.0 0.165 0.0 HOH
 3.033
 OG
 O
3gtu 1 P28161 81.11 1e-132 X-RAY
 1999-07-29 SER A:25 A:25 13.0 0.113 -80.4 130.1 13.0 0.113 0.0
SER C:25 C:25 14.0 0.122 -72.0 124.2 NA NA NA
3gur 1 P28161 81.11 1e-132 X-RAY
 2009-10-27 SER A:25 A:25 19.0 0.165 -68.2 142.5 19.0 0.165 0.0 HOH
 2.757
 OG
 O
SER B:25 B:25 22.0 0.191 -77.7 144.4 22.0 0.191 0.0 HOH
 7.970
 C
 O
SER C:25 C:25 22.0 0.191 -77.9 140.8 NA NA NA
SER D:25 D:25 21.0 0.183 -70.9 142.0 NA NA NA
5hwl 1 P28161 81.11 1e-132 X-RAY
 2017-11-08 SER A:25 A:25 21.0 0.183 -73.7 142.6 21.0 0.183 0.0 HOH
 2.614
 OG
 O
SER B:25 B:25 23.0 0.2 -76.2 148.6 23.0 0.2 0.0 HOH
 2.399
 O
 O
1hna 1 P28161 80.65 2e-131 X-RAY
 1994-01-31 SER A:25 A:25 21.0 0.183 -80.8 140.0 21.0 0.183 0.0 HOH
 2.709
 OG
 O
1hnb 1 P28161 80.65 2e-131 X-RAY
 1994-01-31 SER A:25 A:25 18.0 0.157 -66.5 126.4 18.0 0.157 0.0
SER B:25 B:25 13.0 0.113 -77.8 132.5 13.0 0.113 0.0
1hnc 1 P28161 80.65 2e-131 X-RAY
 1994-01-31 SER A:25 A:25 14.0 0.122 -53.2 124.7 14.0 0.122 0.0
SER B:25 B:25 20.0 0.174 -91.4 123.4 20.0 0.174 0.0
SER C:25 C:25 19.0 0.165 -84.4 127.2 NA NA NA
SER D:25 D:25 7.0 0.061 -66.8 111.4 NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p46439-f1 1 P46439 100.0 5e-163 SER A:26 A:26 20.0 0.174 -66.6 139.0
af-p09488-f1 1 P09488 87.61 6e-142 SER A:26 A:26 20.0 0.174 -67.2 138.0
af-q03013-f1 1 Q03013 83.03 1e-134 SER A:26 A:26 20.0 0.174 -68.3 137.5
af-p28161-f1 1 P28161 81.19 6e-134 SER A:26 A:26 21.0 0.183 -67.4 138.3