Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr1 | 110256120 | . | T | A | CCDS811.1:NM_000851.3:c.192atT>atA_NP_000842.2:p.64I>I | Homo sapiens glutathione S-transferase mu 5 (GSTM5), mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
1xw6 | 1 | P09488 | 87.61 | 1e-141 |
X-RAY |
2004-12-21 | ILE | A:64 | A:63 | 30.0 | 0.171 | E | -108.6 | 117.7 | 30.0 | 0.171 | 0.0 |
HOH |
2.868 |
CD1 |
O |
||
ILE | B:64 | B:63 | 29.0 | 0.166 | E | -109.6 | 120.1 | 29.0 | 0.166 | 0.0 |
HOH |
3.330 |
O |
O |
|||||||||
ILE | C:64 | C:63 | 29.0 | 0.166 | E | -110.4 | 118.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | D:64 | D:63 | 30.0 | 0.171 | E | -109.2 | 118.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1xwk | 1 | P09488 | 87.61 | 1e-141 |
X-RAY |
2004-12-21 | ILE | A:64 | A:63 | 25.0 | 0.143 | E | -125.4 | 111.4 | 25.0 | 0.143 | 0.0 |
HOH |
3.284 |
O |
O |
||
ILE | B:64 | B:63 | 26.0 | 0.149 | E | -121.3 | 110.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | C:64 | C:63 | 26.0 | 0.149 | E | -121.1 | 110.9 | 26.0 | 0.149 | 0.0 |
HOH |
3.651 |
CG2 |
O |
|||||||||
1yj6 | 1 | P09488 | 87.61 | 1e-141 |
X-RAY |
2005-02-01 | ILE | A:64 | A:63 | 27.0 | 0.154 | E | -117.6 | 109.3 | 27.0 | 0.154 | 0.0 |
HOH |
7.486 |
O |
O |
||
ILE | B:64 | B:63 | 26.0 | 0.149 | E | -115.9 | 111.8 | 26.0 | 0.149 | 0.0 |
HOH |
3.507 |
CG2 |
O |
|||||||||
ILE | C:64 | C:63 | 26.0 | 0.149 | E | -114.9 | 110.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2f3m | 1 | P09488 | 87.61 | 1e-141 |
X-RAY |
2006-04-25 | ILE | A:64 | A:63 | 25.0 | 0.143 | E | -117.1 | 123.8 | 25.0 | 0.143 | 0.0 |
HOH |
7.949 |
CD1 |
O |
||
ILE | B:64 | B:63 | 26.0 | 0.149 | E | -115.1 | 124.4 | 26.0 | 0.149 | 0.0 | |||||||||||||
ILE | C:64 | C:63 | 27.0 | 0.154 | E | -113.7 | 121.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | D:64 | D:63 | 25.0 | 0.143 | E | -115.4 | 122.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | E:64 | E:63 | 26.0 | 0.149 | E | -116.3 | 122.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | F:64 | F:63 | 26.0 | 0.149 | E | -117.5 | 123.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7beu | 1 | P09488 | 87.61 | 1e-141 |
X-RAY |
2022-01-12 | ILE | A:64 | A:63 | 22.0 | 0.126 | E | -108.6 | 122.8 | 22.0 | 0.126 | 0.0 |
HOH |
3.500 |
O |
O |
||
ILE | B:64 | B:63 | 28.0 | 0.16 | E | -113.0 | 123.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | C:64 | C:63 | 33.0 | 0.189 | E | -116.4 | 120.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | D:64 | D:63 | 27.0 | 0.154 | E | -117.7 | 115.2 | 27.0 | 0.154 | 0.0 |
HOH |
3.623 |
O |
O |
|||||||||
1gtu | 1 | P09488 | 87.56 | 1e-140 |
X-RAY |
1999-02-02 | ILE | A:63 | A:63 | 35.0 | 0.2 | E | -116.3 | 111.5 | 35.0 | 0.2 | 0.0 |
HOH |
8.991 |
CG1 |
O |
||
ILE | B:63 | B:63 | 28.0 | 0.16 | E | -121.6 | 104.6 | 28.0 | 0.16 | 0.0 |
HOH |
9.380 |
CG1 |
O |
|||||||||
ILE | C:63 | C:63 | 30.0 | 0.171 | E | -118.3 | 105.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | D:63 | D:63 | 30.0 | 0.171 | E | -114.8 | 115.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2c4j | 1 | P28161 | 81.19 | 8e-134 |
X-RAY |
2005-10-26 | ILE | A:64 | A:64 | 33.0 | 0.189 | E | -107.3 | 119.9 | 33.0 | 0.189 | 0.0 |
HOH |
3.667 |
O |
O |
||
ILE | B:64 | B:64 | 29.0 | 0.166 | E | -104.1 | 126.2 | 29.0 | 0.166 | 0.0 |
HOH |
3.119 |
CG2 |
O |
|||||||||
ILE | C:64 | C:64 | 29.0 | 0.166 | E | -105.4 | 121.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | D:64 | D:64 | 28.0 | 0.16 | E | -105.7 | 121.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2dc5 | 1 | 30354091 | 81.57 | 1e-133 |
X-RAY |
2006-06-28 | ILE | A:71 | A:71 | 25.0 | 0.143 | E | -113.0 | 120.2 | 25.0 | 0.143 | 0.0 |
HOH |
3.622 |
O |
O |
||
ILE | B:71 | B:71 | 28.0 | 0.16 | E | -112.1 | 121.4 | 28.0 | 0.16 | 0.0 |
HOH |
3.510 |
CG2 |
O |
|||||||||
4gtu | 1 | Q03013 | 83.33 | 2e-133 |
X-RAY |
2000-01-14 | ILE | A:63 | A:63 | 20.0 | 0.114 | E | -122.8 | 82.0 | 20.0 | 0.114 | 0.0 | ||||||
ILE | B:63 | B:63 | 19.0 | 0.109 | E | -125.7 | 131.7 | 19.0 | 0.109 | 0.0 | |||||||||||||
ILE | C:63 | C:63 | 28.0 | 0.16 | E | -98.9 | 99.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | D:63 | D:63 | 36.0 | 0.206 | E | -122.3 | 119.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | E:63 | E:63 | 28.0 | 0.16 | E | -84.5 | 91.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | F:63 | F:63 | 30.0 | 0.171 | E | -105.5 | 98.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | G:63 | G:63 | 24.0 | 0.137 | E | -107.1 | 94.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | H:63 | H:63 | 19.0 | 0.109 | E | -104.2 | 113.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1xw5 | 1 | P28161 | 81.11 | 1e-132 |
X-RAY |
2004-11-30 | ILE | A:63 | A:63 | 31.0 | 0.177 | E | -111.5 | 118.0 | 31.0 | 0.177 | 0.0 |
HOH |
3.061 |
CD1 |
O |
||
ILE | B:63 | B:63 | 31.0 | 0.177 | E | -112.4 | 122.0 | 31.0 | 0.177 | 0.0 |
HOH |
3.475 |
CD1 |
O |
|||||||||
1ykc | 1 | P28161 | 81.11 | 1e-132 |
X-RAY |
2005-01-25 | ILE | A:63 | A:63 | 31.0 | 0.177 | E | -113.0 | 99.0 | 31.0 | 0.177 | 0.0 |
HOH |
3.110 |
O |
O |
||
ILE | B:63 | B:63 | 33.0 | 0.189 | E | -110.9 | 102.4 | 33.0 | 0.189 | 0.0 |
HOH |
3.347 |
O |
O |
|||||||||
2ab6 | 1 | P28161 | 81.11 | 1e-132 |
X-RAY |
2005-08-02 | ILE | A:63 | A:63 | 28.0 | 0.16 | E | -106.6 | 115.8 | 28.0 | 0.16 | 0.0 |
HOH |
6.667 |
O |
O |
||
ILE | B:63 | B:63 | 31.0 | 0.177 | E | -105.3 | 115.3 | 31.0 | 0.177 | 0.0 |
HOH |
3.330 |
O |
O |
|||||||||
ILE | C:63 | C:63 | 27.0 | 0.154 | E | -106.4 | 120.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | D:63 | D:63 | 28.0 | 0.16 | E | -109.8 | 112.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2gtu | 1 | P28161 | 81.11 | 1e-132 |
X-RAY |
1999-03-02 | ILE | A:63 | A:63 | 32.0 | 0.183 | E | -113.6 | 121.7 | 32.0 | 0.183 | 0.0 |
HOH |
7.226 |
CD1 |
O |
||
ILE | B:63 | B:63 | 31.0 | 0.177 | E | -125.5 | 115.6 | 31.0 | 0.177 | 0.0 |
HOH |
7.429 |
CD1 |
O |
|||||||||
3gtu | 1 | P28161 | 81.11 | 1e-132 |
X-RAY |
1999-07-29 | ILE | A:63 | A:63 | 37.0 | 0.211 | E | -111.2 | 115.3 | 37.0 | 0.211 | 0.0 |
HOH |
9.078 |
CG1 |
O |
||
ILE | C:63 | C:63 | 34.0 | 0.194 | E | -110.5 | 113.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3gur | 1 | P28161 | 81.11 | 1e-132 |
X-RAY |
2009-10-27 | ILE | A:63 | A:63 | 37.0 | 0.211 | E | -105.4 | 106.3 | 37.0 | 0.211 | 0.0 |
HOH |
7.893 |
O |
O |
||
ILE | B:63 | B:63 | 34.0 | 0.194 | E | -104.0 | 130.8 | 34.0 | 0.194 | 0.0 |
HOH |
6.659 |
O |
O |
|||||||||
ILE | C:63 | C:63 | 30.0 | 0.171 | E | -95.9 | 111.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | D:63 | D:63 | 27.0 | 0.154 | E | -111.7 | 113.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
5hwl | 1 | P28161 | 81.11 | 1e-132 |
X-RAY |
2017-11-08 | ILE | A:63 | A:63 | 33.0 | 0.189 | E | -107.2 | 117.5 | 33.0 | 0.189 | 0.0 |
HOH |
3.256 |
CD1 |
O |
||
ILE | B:63 | B:63 | 34.0 | 0.194 | E | -110.4 | 117.6 | 34.0 | 0.194 | 0.0 |
HOH |
5.382 |
CG1 |
O |
|||||||||
1hna | 1 | P28161 | 80.65 | 2e-131 |
X-RAY |
1994-01-31 | ILE | A:63 | A:63 | 33.0 | 0.189 | E | -111.8 | 120.9 | 33.0 | 0.189 | 0.0 |
HOH |
3.467 |
CG2 |
O |
||
1hnb | 1 | P28161 | 80.65 | 2e-131 |
X-RAY |
1994-01-31 | ILE | A:63 | A:63 | 35.0 | 0.2 | E | -112.0 | 141.4 | 35.0 | 0.2 | 0.0 | ||||||
ILE | B:63 | B:63 | 26.0 | 0.149 | E | -99.5 | 92.4 | 26.0 | 0.149 | 0.0 | |||||||||||||
1hnc | 1 | P28161 | 80.65 | 2e-131 |
X-RAY |
1994-01-31 | ILE | A:63 | A:63 | 38.0 | 0.217 | E | -122.2 | 100.0 | 38.0 | 0.217 | 0.0 | ||||||
ILE | B:63 | B:63 | 28.0 | 0.16 | E | -124.6 | 106.2 | 28.0 | 0.16 | 0.0 | |||||||||||||
ILE | C:63 | C:63 | 32.0 | 0.183 | E | -91.0 | 107.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ILE | D:63 | D:63 | 23.0 | 0.131 | E | -123.7 | 122.7 | NA | NA | NA |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p46439-f1 | 1 | P46439 | 100.0 | 5e-163 | ILE | A:64 | A:64 | 35.0 | 0.2 | E | -112.4 | 119.9 | |
af-p09488-f1 | 1 | P09488 | 87.61 | 6e-142 | ILE | A:64 | A:64 | 29.0 | 0.166 | E | -112.0 | 122.5 | |
af-q03013-f1 | 1 | Q03013 | 83.03 | 1e-134 | ILE | A:64 | A:64 | 37.0 | 0.211 | E | -111.9 | 122.9 | |
af-p28161-f1 | 1 | P28161 | 81.19 | 6e-134 | ILE | A:64 | A:64 | 38.0 | 0.217 | E | -112.9 | 118.3 |