Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr1 | 110256121 | . | G | A | CCDS811.1:NM_000851.3:c.193Gat>Aat_NP_000842.2:p.65D>N | Homo sapiens glutathione S-transferase mu 5 (GSTM5), mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
1xw6 | 1 | P09488 | 87.61 | 1e-141 |
X-RAY |
2004-12-21 | ASP | A:65 | A:64 | 39.0 | 0.26 | E | -128.6 | 80.2 | 39.0 | 0.26 | 0.0 |
HOH |
2.934 |
OD1 |
O |
||
ASP | B:65 | B:64 | 41.0 | 0.273 | E | -130.3 | 79.0 | 41.0 | 0.273 | 0.0 |
HOH |
3.022 |
OD2 |
O |
|||||||||
ASP | C:65 | C:64 | 40.0 | 0.267 | E | -129.2 | 80.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASP | D:65 | D:64 | 38.0 | 0.253 | E | -128.2 | 78.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1xwk | 1 | P09488 | 87.61 | 1e-141 |
X-RAY |
2004-12-21 | ASP | A:65 | A:64 | 40.0 | 0.267 | E | -118.7 | 86.4 | 40.0 | 0.267 | 0.0 |
HOH |
3.764 |
C |
O |
||
ASP | B:65 | B:64 | 45.0 | 0.3 | E | -119.3 | 88.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASP | C:65 | C:64 | 47.0 | 0.313 | E | -117.5 | 88.0 | 47.0 | 0.313 | 0.0 |
HOH |
4.579 |
OD2 |
O |
|||||||||
1yj6 | 1 | P09488 | 87.61 | 1e-141 |
X-RAY |
2005-02-01 | ASP | A:65 | A:64 | 39.0 | 0.26 | E | -117.3 | 87.0 | 39.0 | 0.26 | 0.0 |
HOH |
6.750 |
OD1 |
O |
||
ASP | B:65 | B:64 | 38.0 | 0.253 | E | -119.5 | 83.2 | 38.0 | 0.253 | 0.0 |
HOH |
4.768 |
C |
O |
|||||||||
ASP | C:65 | C:64 | 37.0 | 0.247 | E | -117.2 | 83.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2f3m | 1 | P09488 | 87.61 | 1e-141 |
X-RAY |
2006-04-25 | ASP | A:65 | A:64 | 35.0 | 0.233 | E | -138.2 | 84.9 | 35.0 | 0.233 | 0.0 | ||||||
ASP | B:65 | B:64 | 34.0 | 0.227 | E | -137.6 | 85.8 | 34.0 | 0.227 | 0.0 | |||||||||||||
ASP | C:65 | C:64 | 37.0 | 0.247 | E | -133.2 | 85.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASP | D:65 | D:64 | 34.0 | 0.227 | E | -134.5 | 83.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASP | E:65 | E:64 | 34.0 | 0.227 | E | -137.1 | 85.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASP | F:65 | F:64 | 34.0 | 0.227 | E | -136.2 | 86.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7beu | 1 | P09488 | 87.61 | 1e-141 |
X-RAY |
2022-01-12 | ASP | A:65 | A:64 | 34.0 | 0.227 | E | -135.7 | 86.1 | 34.0 | 0.227 | 0.0 |
HOH |
3.189 |
O |
O |
||
ASP | B:65 | B:64 | 39.0 | 0.26 | E | -138.2 | 89.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASP | C:65 | C:64 | 35.0 | 0.233 | E | -130.6 | 89.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASP | D:65 | D:64 | 33.0 | 0.22 | E | -131.1 | 94.0 | 33.0 | 0.22 | 0.0 |
HOH |
2.789 |
OD1 |
O |
|||||||||
1gtu | 1 | P09488 | 87.56 | 1e-140 |
X-RAY |
1999-02-02 | ASP | A:64 | A:64 | 34.0 | 0.227 | E | -128.8 | 104.1 | 34.0 | 0.227 | 0.0 | ||||||
ASP | B:64 | B:64 | 31.0 | 0.207 | E | -116.7 | 102.1 | 31.0 | 0.207 | 0.0 | |||||||||||||
ASP | C:64 | C:64 | 30.0 | 0.2 | E | -119.8 | 95.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASP | D:64 | D:64 | 32.0 | 0.213 | E | -127.5 | 98.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2c4j | 1 | P28161 | 81.19 | 8e-134 |
X-RAY |
2005-10-26 | ASP | A:65 | A:65 | 35.0 | 0.233 | E | -133.7 | 88.7 | 35.0 | 0.233 | 0.0 |
HOH |
2.600 |
OD1 |
O |
||
ASP | B:65 | B:65 | 27.0 | 0.18 | E | -133.5 | 99.0 | 27.0 | 0.18 | 0.0 |
HOH |
2.723 |
OD1 |
O |
|||||||||
ASP | C:65 | C:65 | 38.0 | 0.253 | E | -131.6 | 85.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASP | D:65 | D:65 | 35.0 | 0.233 | E | -131.4 | 90.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2dc5 | 1 | 30354091 | 81.57 | 1e-133 |
X-RAY |
2006-06-28 | ASP | A:72 | A:72 | 30.0 | 0.2 | E | -135.5 | 87.7 | 30.0 | 0.2 | 0.0 |
HOH |
2.765 |
OD1 |
O |
||
ASP | B:72 | B:72 | 35.0 | 0.233 | E | -138.9 | 86.6 | 35.0 | 0.233 | 0.0 |
HOH |
2.796 |
OD1 |
O |
|||||||||
4gtu | 1 | Q03013 | 83.33 | 2e-133 |
X-RAY |
2000-01-14 | ASP | A:64 | A:64 | 30.0 | 0.2 | -74.4 | 78.1 | 30.0 | 0.2 | 0.0 | |||||||
ASP | B:64 | B:64 | 38.0 | 0.253 | -151.2 | 66.0 | 38.0 | 0.253 | 0.0 | ||||||||||||||
ASP | C:64 | C:64 | 35.0 | 0.233 | E | -98.7 | 57.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASP | D:64 | D:64 | 40.0 | 0.267 | E | -117.6 | 82.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASP | E:64 | E:64 | 23.0 | 0.153 | E | -93.5 | 79.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASP | F:64 | F:64 | 30.0 | 0.2 | E | -107.4 | 85.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASP | G:64 | G:64 | 33.0 | 0.22 | E | -85.9 | 69.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASP | H:64 | H:64 | 44.0 | 0.293 | E | -112.2 | 73.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1xw5 | 1 | P28161 | 81.11 | 1e-132 |
X-RAY |
2004-11-30 | ASP | A:64 | A:64 | 41.0 | 0.273 | E | -130.8 | 85.0 | 41.0 | 0.273 | 0.0 |
HOH |
3.096 |
OD1 |
O |
||
ASP | B:64 | B:64 | 41.0 | 0.273 | E | -136.0 | 81.8 | 41.0 | 0.273 | 0.0 |
HOH |
2.680 |
OD1 |
O |
|||||||||
1ykc | 1 | P28161 | 81.11 | 1e-132 |
X-RAY |
2005-01-25 | ASP | A:64 | A:64 | 35.0 | 0.233 | E | -112.2 | 84.5 | 35.0 | 0.233 | 0.0 |
HOH |
2.806 |
OD2 |
O |
||
ASP | B:64 | B:64 | 36.0 | 0.24 | E | -118.2 | 84.3 | 36.0 | 0.24 | 0.0 |
HOH |
2.869 |
OD1 |
O |
|||||||||
2ab6 | 1 | P28161 | 81.11 | 1e-132 |
X-RAY |
2005-08-02 | ASP | A:64 | A:64 | 41.0 | 0.273 | E | -122.6 | 72.4 | 41.0 | 0.273 | 0.0 |
HOH |
7.505 |
C |
O |
||
ASP | B:64 | B:64 | 40.0 | 0.267 | E | -120.8 | 73.1 | 40.0 | 0.267 | 0.0 |
HOH |
3.516 |
CA |
O |
|||||||||
ASP | C:64 | C:64 | 39.0 | 0.26 | E | -126.0 | 74.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASP | D:64 | D:64 | 40.0 | 0.267 | E | -119.6 | 76.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2gtu | 1 | P28161 | 81.11 | 1e-132 |
X-RAY |
1999-03-02 | ASP | A:64 | A:64 | 36.0 | 0.24 | E | -130.1 | 82.9 | 36.0 | 0.24 | 0.0 |
HOH |
5.502 |
OD2 |
O |
||
ASP | B:64 | B:64 | 37.0 | 0.247 | E | -125.0 | 83.3 | 37.0 | 0.247 | 0.0 |
HOH |
5.570 |
OD2 |
O |
|||||||||
3gtu | 1 | P28161 | 81.11 | 1e-132 |
X-RAY |
1999-07-29 | ASP | A:64 | A:64 | 38.0 | 0.253 | E | -123.5 | 93.1 | 38.0 | 0.253 | 0.0 | ||||||
ASP | C:64 | C:64 | 39.0 | 0.26 | E | -123.6 | 95.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3gur | 1 | P28161 | 81.11 | 1e-132 |
X-RAY |
2009-10-27 | ASP | A:64 | A:64 | 38.0 | 0.253 | E | -118.5 | 88.3 | 38.0 | 0.253 | 0.0 |
HOH |
6.013 |
OD2 |
O |
||
ASP | B:64 | B:64 | 28.0 | 0.187 | E | -145.1 | 89.0 | 28.0 | 0.187 | 0.0 |
HOH |
2.955 |
OD1 |
O |
|||||||||
ASP | C:64 | C:64 | 35.0 | 0.233 | E | -127.7 | 84.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASP | D:64 | D:64 | 31.0 | 0.207 | E | -127.0 | 76.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
5hwl | 1 | P28161 | 81.11 | 1e-132 |
X-RAY |
2017-11-08 | ASP | A:64 | A:64 | 42.0 | 0.28 | E | -136.5 | 90.3 | 42.0 | 0.28 | 0.0 |
HOH |
5.339 |
N |
O |
||
ASP | B:64 | B:64 | 35.0 | 0.233 | E | -135.8 | 94.0 | 35.0 | 0.233 | 0.0 |
HOH |
7.414 |
OD2 |
O |
|||||||||
1hna | 1 | P28161 | 80.65 | 2e-131 |
X-RAY |
1994-01-31 | ASP | A:64 | A:64 | 36.0 | 0.24 | E | -132.1 | 84.7 | 36.0 | 0.24 | 0.0 |
HOH |
2.757 |
OD1 |
O |
||
1hnb | 1 | P28161 | 80.65 | 2e-131 |
X-RAY |
1994-01-31 | ASP | A:64 | A:64 | 39.0 | 0.26 | -157.1 | 98.1 | 39.0 | 0.26 | 0.0 | |||||||
ASP | B:64 | B:64 | 34.0 | 0.227 | E | -96.7 | 89.3 | 34.0 | 0.227 | 0.0 | |||||||||||||
1hnc | 1 | P28161 | 80.65 | 2e-131 |
X-RAY |
1994-01-31 | ASP | A:64 | A:64 | 36.0 | 0.24 | E | -96.7 | 79.8 | 36.0 | 0.24 | 0.0 | ||||||
ASP | B:64 | B:64 | 48.0 | 0.32 | E | -118.3 | 105.0 | 48.0 | 0.32 | 0.0 | |||||||||||||
ASP | C:64 | C:64 | 26.0 | 0.173 | E | -122.3 | 93.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASP | D:64 | D:64 | 37.0 | 0.247 | E | -130.5 | 86.3 | NA | NA | NA |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p46439-f1 | 1 | P46439 | 100.0 | 5e-163 | ASP | A:65 | A:65 | 29.0 | 0.193 | E | -131.0 | 93.7 | |
af-p09488-f1 | 1 | P09488 | 87.61 | 6e-142 | ASP | A:65 | A:65 | 28.0 | 0.187 | E | -134.9 | 92.9 | |
af-q03013-f1 | 1 | Q03013 | 83.03 | 1e-134 | ASP | A:65 | A:65 | 23.0 | 0.153 | E | -135.3 | 92.1 | |
af-p28161-f1 | 1 | P28161 | 81.19 | 6e-134 | ASP | A:65 | A:65 | 26.0 | 0.173 | E | -126.3 | 97.4 |