Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr1 110257624 . C A CCDS811.1:NM_000851.3:c.416tCa>tAa_NP_000842.2:p.139S>* Homo sapiens glutathione S-transferase mu 5 (GSTM5), mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
1xw6 1 P09488 87.61 1e-141 X-RAY
 2004-12-21 SER A:139 A:138 13.0 0.113 H -60.3 -54.9 13.0 0.113 0.0 HOH
 4.213
 OG
 O
SER B:139 B:138 16.0 0.139 H -59.6 -54.5 16.0 0.139 0.0 HOH
 3.231
 OG
 O
SER C:139 C:138 17.0 0.148 H -60.2 -55.3 NA NA NA
SER D:139 D:138 16.0 0.139 H -58.8 -56.2 NA NA NA
1xwk 1 P09488 87.61 1e-141 X-RAY
 2004-12-21 SER A:139 A:138 22.0 0.191 H -64.8 -54.9 22.0 0.191 0.0 HOH
 8.488
 C
 O
SER B:139 B:138 15.0 0.13 H -57.9 -54.9 NA NA NA
SER C:139 C:138 15.0 0.13 H -59.8 -54.5 15.0 0.13 0.0 HOH
 3.864
 OG
 O
1yj6 1 P09488 87.61 1e-141 X-RAY
 2005-02-01 SER A:139 A:138 17.0 0.148 H -59.0 -54.3 17.0 0.148 0.0 HOH
 6.590
 C
 O
SER B:139 B:138 15.0 0.13 H -58.2 -55.5 15.0 0.13 0.0 HOH
 6.522
 C
 O
SER C:139 C:138 20.0 0.174 H -57.1 -56.0 NA NA NA
2f3m 1 P09488 87.61 1e-141 X-RAY
 2006-04-25 SER A:139 A:138 17.0 0.148 H -54.5 -54.6 17.0 0.148 0.0 HOH
 7.586
 N
 O
SER B:139 B:138 17.0 0.148 H -52.5 -56.6 17.0 0.148 0.0
SER C:139 C:138 16.0 0.139 H -50.3 -56.7 NA NA NA
SER D:139 D:138 17.0 0.148 H -49.6 -58.0 NA NA NA
SER E:139 E:138 17.0 0.148 H -51.7 -55.7 NA NA NA
SER F:139 F:138 18.0 0.157 H -51.8 -57.7 NA NA NA
7beu 1 P09488 87.61 1e-141 X-RAY
 2022-01-12 SER A:139 A:138 18.0 0.157 H -65.8 -42.8 18.0 0.157 0.0 HOH
 2.677
 OG
 O
SER B:139 B:138 17.0 0.148 H -62.9 -43.4 NA NA NA
SER C:139 C:138 18.0 0.157 H -61.9 -44.0 NA NA NA
SER D:139 D:138 17.0 0.148 H -63.9 -42.3 17.0 0.148 0.0 HOH
 2.832
 OG
 O
1gtu 1 P09488 87.56 1e-140 X-RAY
 1999-02-02 SER A:138 A:138 18.0 0.157 H -58.4 -57.4 18.0 0.157 0.0
SER B:138 B:138 16.0 0.139 H -62.2 -55.7 16.0 0.139 0.0
SER C:138 C:138 17.0 0.148 H -54.1 -57.5 NA NA NA
SER D:138 D:138 16.0 0.139 H -59.6 -50.9 NA NA NA
2c4j 1 P28161 81.19 8e-134 X-RAY
 2005-10-26 SER A:139 A:139 17.0 0.148 H -61.7 -45.8 17.0 0.148 0.0 HOH
 2.764
 OG
 O
SER B:139 B:139 20.0 0.174 H -59.6 -45.4 20.0 0.174 0.0 HOH
 4.506
 O
 O
SER C:139 C:139 19.0 0.165 H -63.2 -45.5 NA NA NA
SER D:139 D:139 17.0 0.148 H -61.6 -45.1 NA NA NA
2dc5 1 30354091 81.57 1e-133 X-RAY
 2006-06-28 SER A:146 A:146 19.0 0.165 H -63.4 -43.8 19.0 0.165 0.0 HOH
 2.742
 OG
 O
SER B:146 B:146 16.0 0.139 H -59.7 -45.7 16.0 0.139 0.0 HOH
 2.624
 OG
 O
4gtu 1 Q03013 83.33 2e-133 X-RAY
 2000-01-14 SER A:138 A:138 15.0 0.13 H -60.8 -50.0 15.0 0.13 0.0
SER B:138 B:138 14.0 0.122 H -68.3 -40.8 14.0 0.122 0.0
SER C:138 C:138 14.0 0.122 H -67.6 -25.9 NA NA NA
SER D:138 D:138 17.0 0.148 H -63.5 -42.2 NA NA NA
SER E:138 E:138 24.0 0.209 H -62.6 -31.0 NA NA NA
SER F:138 F:138 18.0 0.157 H -56.5 -49.5 NA NA NA
SER G:138 G:138 19.0 0.165 H -59.1 -41.7 NA NA NA
SER H:138 H:138 24.0 0.209 H -69.3 -30.9 NA NA NA
1xw5 1 P28161 81.11 1e-132 X-RAY
 2004-11-30 SER A:138 A:138 18.0 0.157 H -60.9 -47.3 18.0 0.157 0.0 HOH
 2.822
 OG
 O
SER B:138 B:138 20.0 0.174 H -62.8 -46.2 20.0 0.174 0.0 HOH
 3.286
 OG
 O
1ykc 1 P28161 81.11 1e-132 X-RAY
 2005-01-25 SER A:138 A:138 16.0 0.139 H -65.8 -45.7 16.0 0.139 0.0 HOH
 4.320
 O
 O
SER B:138 B:138 17.0 0.148 H -61.5 -58.3 17.0 0.148 0.0 HOH
 2.741
 OG
 O
2ab6 1 P28161 81.11 1e-132 X-RAY
 2005-08-02 SER A:138 A:138 19.0 0.165 H -68.8 -45.9 19.0 0.165 0.0 HOH
 3.975
 OG
 O
SER B:138 B:138 18.0 0.157 H -66.0 -50.9 18.0 0.157 0.0 HOH
 3.549
 OG
 O
SER C:138 C:138 19.0 0.165 H -68.9 -47.2 NA NA NA
SER D:138 D:138 21.0 0.183 H -64.4 -48.7 NA NA NA
2gtu 1 P28161 81.11 1e-132 X-RAY
 1999-03-02 SER A:138 A:138 14.0 0.122 H -61.8 -54.2 14.0 0.122 0.0 HOH
 8.323
 O
 O
SER B:138 B:138 20.0 0.174 H -63.9 -49.4 20.0 0.174 0.0 HOH
 8.213
 O
 O
3gtu 1 P28161 81.11 1e-132 X-RAY
 1999-07-29 SER A:138 A:138 20.0 0.174 H -62.0 -49.5 20.0 0.174 0.0 HOH
 7.931
 N
 O
SER C:138 C:138 19.0 0.165 H -66.4 -50.0 NA NA NA
3gur 1 P28161 81.11 1e-132 X-RAY
 2009-10-27 SER A:138 A:138 19.0 0.165 H -61.2 -45.2 19.0 0.165 0.0 HOH
 4.138
 OG
 O
SER B:138 B:138 16.0 0.139 H -63.8 -49.3 16.0 0.139 0.0 HOH
 4.553
 O
 O
SER C:138 C:138 19.0 0.165 H -61.1 -54.1 NA NA NA
SER D:138 D:138 18.0 0.157 H -59.1 -51.5 NA NA NA
5hwl 1 P28161 81.11 1e-132 X-RAY
 2017-11-08 SER A:138 A:138 20.0 0.174 H -59.2 -46.6 20.0 0.174 0.0 HOH
 4.115
 OG
 O
SER B:138 B:138 16.0 0.139 H -59.5 -46.1 16.0 0.139 0.0 HOH
 2.823
 OG
 O
1hna 1 P28161 80.65 2e-131 X-RAY
 1994-01-31 SER A:138 A:138 21.0 0.183 H -62.7 -47.2 21.0 0.183 0.0 HOH
 4.164
 OG
 O
1hnb 1 P28161 80.65 2e-131 X-RAY
 1994-01-31 SER A:138 A:138 12.0 0.104 H -63.0 -23.3 12.0 0.104 0.0
SER B:138 B:138 17.0 0.148 H -56.1 -29.6 17.0 0.148 0.0
1hnc 1 P28161 80.65 2e-131 X-RAY
 1994-01-31 SER A:138 A:138 12.0 0.104 H -59.4 -60.2 12.0 0.104 0.0
SER B:138 B:138 12.0 0.104 H -61.9 -49.2 12.0 0.104 0.0
SER C:138 C:138 8.0 0.07 H -63.4 -49.0 NA NA NA
SER D:138 D:138 16.0 0.139 H -60.0 -49.9 NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p46439-f1 1 P46439 100.0 5e-163 SER A:139 A:139 19.0 0.165 H -61.6 -46.8
af-p09488-f1 1 P09488 87.61 6e-142 SER A:139 A:139 19.0 0.165 H -60.6 -48.0
af-q03013-f1 1 Q03013 83.03 1e-134 SER A:139 A:139 19.0 0.165 H -59.9 -46.3
af-p28161-f1 1 P28161 81.19 6e-134 SER A:139 A:139 20.0 0.174 H -59.7 -45.5