Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr1 160105680 . G A CCDS1196.1:NM_000702.3:c.2336aGc>aAc_NP_000693.1:p.779S>N Homo sapiens ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2 (ATP1A2), mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
4xe5 1 Q08DA1 86.79 0.0 X-RAY
 2016-03-09 SER A:780 A:780 0.0 0.0 H -74.9 -25.8 0.0 0.0 0.0 MG
OBN
HOH
 3.685
9.392
2.205
 OG
O
OG
 MG
O21
O
3wgu 1 I7HD36 87.32 0.0 X-RAY
 2013-10-09 SER A:775 A:775 0.0 0.0 T -32.9 -34.1 0.0 0.0 0.0 NA
NA
NA
HOH
 6.497
3.234
3.119
5.107
 OG
OG
OG
OG
 NA
NA
NA
O
SER D:775 C:775 0.0 0.0 T -32.0 -37.4 NA NA NA
3wgv 1 I7HD36 87.32 0.0 X-RAY
 2013-10-09 SER A:775 A:775 0.0 0.0 T -38.1 -29.0 0.0 0.0 0.0 NA
NA
NA
HOH
 6.655
3.148
3.540
4.805
 OG
OG
OG
OG
 NA
NA
NA
O
SER D:775 C:775 0.0 0.0 T -54.4 -20.9 NA NA NA
4hqj 1 P05024 86.69 0.0 X-RAY
 2013-10-02 SER A:780 A:775 0.0 0.0 H -69.3 -29.7 0.0 0.0 0.0 NA
NA
NA
 5.990
2.402
3.134
 OG
OG
N
 NA
NA
NA
SER D:780 C:775 1.0 0.009 H -67.6 -30.1 NA NA NA
4hyt 1 P05024 86.69 0.0 X-RAY
 2013-06-26 SER A:780 A:775 0.0 0.0 T -76.6 -15.1 0.0 0.0 0.0 MG
OBN
HOH
 4.122
9.717
2.678
 OG
O
OG
 MG
O21
O
SER D:780 C:775 0.0 0.0 T -76.3 -15.1 NA NA NA
4res 1 P05024 86.69 0.0 X-RAY
 2015-01-28 SER A:780 A:775 0.0 0.0 H -76.8 -14.9 0.0 0.0 0.0 BUF
K
K
 8.876
2.920
7.011
 O
OG
OG
 O24
K
K
SER D:780 C:775 0.0 0.0 H -76.1 -15.6 NA NA NA
4ret 1 P05024 86.69 0.0 X-RAY
 2015-01-28 SER A:780 A:775 0.0 0.0 T -73.3 -16.7 0.0 0.0 0.0 MG
DGX
HOH
 3.950
9.605
2.532
 OG
O
OG
 MG
O21
O
SER D:780 C:775 0.0 0.0 T -73.0 -16.7 NA NA NA
7evx 1 P05024 86.69 0.0 X-RAY
 2021-07-07 SER A:780 A:775 0.0 0.0 T -64.8 -12.0 0.0 0.0 0.0 MG
HOH
 4.607
3.411
 OG
OG
 MG
O
SER D:780 C:775 0.0 0.0 T -64.2 -11.6 NA NA NA
7d91 1 P05024 86.82 0.0 X-RAY
 2021-01-27 SER A:775 A:775 1.0 0.009 T -71.0 -17.1 1.0 0.009 0.0 MG
HOH
 5.145
6.992
 OG
O
 MG
O
7d92 1 P05024 86.82 0.0 X-RAY
 2021-01-27 SER A:775 A:775 0.0 0.0 T -69.6 -12.1 0.0 0.0 0.0 MG
HOH
 5.024
3.362
 OG
OG
 MG
O
7d93 1 P05024 86.82 0.0 X-RAY
 2021-01-27 SER A:775 A:775 0.0 0.0 T -66.9 -7.5 0.0 0.0 0.0 MG
H0C
HOH
 4.782
9.916
3.537
 OG
O
OG
 MG
O8
O
SER C:775 C:775 0.0 0.0 T -66.1 -7.5 NA NA NA
7d94 1 P05024 86.82 0.0 X-RAY
 2021-01-27 SER A:775 A:775 0.0 0.0 T -73.9 -8.1 0.0 0.0 0.0 MG
RB
BUF
HOH
 6.423
2.710
9.345
5.745
 OG
OG
O
OG
 MG
RB
O24
O
SER D:775 C:775 0.0 0.0 T -71.9 -6.9 NA NA NA
7ddf 1 P05024 86.82 0.0 X-RAY
 2021-01-27 SER A:775 A:775 0.0 0.0 T -65.4 -10.4 0.0 0.0 0.0 MG
HOH
 4.895
3.449
 OG
OG
 MG
O
SER D:775 C:775 0.0 0.0 T -66.2 -9.2 NA NA NA
7ddh 1 P05024 86.82 0.0 X-RAY
 2021-01-27 SER A:775 A:775 0.0 0.0 T -66.1 -10.0 0.0 0.0 0.0 MG
DGX
HOH
 4.890
9.605
3.727
 OG
O
OG
 MG
O21
O
SER D:775 C:775 0.0 0.0 T -65.7 -9.1 NA NA NA
7ddi 1 P05024 86.82 0.0 X-RAY
 2021-01-27 SER A:775 A:775 0.0 0.0 T -66.4 -10.3 0.0 0.0 0.0 MG
F9R
HOH
 5.024
9.648
3.690
 OG
O
OG
 MG
O21
O
SER D:775 C:775 0.0 0.0 T -65.0 -11.0 NA NA NA
7ddj 1 P05024 86.82 0.0 X-RAY
 2021-01-27 SER A:775 A:775 0.0 0.0 T -67.4 -6.1 0.0 0.0 0.0 MG
OBN
HOH
 4.941
9.639
3.727
 OG
O
OG
 MG
O21
O
SER D:775 C:775 0.0 0.0 T -66.6 -6.2 NA NA NA
7ddk 1 P05024 86.82 0.0 X-RAY
 2021-01-27 SER A:775 A:775 0.0 0.0 T -65.8 -10.3 0.0 0.0 0.0 MG
E4R
HOH
 5.055
9.591
3.680
 OG
O
OG
 MG
O23
O
SER D:775 C:775 0.0 0.0 T -65.6 -8.9 NA NA NA
7ddl 1 P05024 86.82 0.0 X-RAY
 2021-01-27 SER A:775 A:775 0.0 0.0 T -72.1 0.6 0.0 0.0 0.0 MG
BUF
HOH
 4.853
8.903
3.628
 OG
O
OG
 MG
O24
O
SER D:775 C:775 0.0 0.0 T -70.8 0.7 NA NA NA
3b8e 1 P05024 87.56 0.0 X-RAY
 2007-12-18 SER A:757 A:775 1.0 0.009 T -68.1 4.4 1.0 0.009 0.0 RB
RB
 3.242
5.917
 OG
O
 RB
RB
SER D:757 C:775 3.0 0.026 S -89.6 -4.5 NA NA NA
3kdp 1 P05024 87.56 0.0 X-RAY
 2010-02-16 SER A:757 A:775 0.0 0.0 T -77.2 -2.8 0.0 0.0 0.0 RB
RB
 2.913
6.402
 OG
O
 RB
RB
SER D:757 C:775 0.0 0.0 T -75.7 -2.1 NA NA NA
3n23 1 P05024 87.8 0.0 X-RAY
 2011-01-19 SER A:751 A:775 0.0 0.0 T -60.1 -20.1 0.0 0.0 0.0
SER D:751 C:775 0.0 0.0 T -59.5 -19.9 NA NA NA
2zxe 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2009-05-19 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -74.9 -1.3 0.0 0.0 0.0 K
K
HOH
 2.718
5.715
3.238
 OG
O
OG
 K
K
O
3a3y 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2009-09-08 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -67.8 -13.7 0.0 0.0 0.0 K
K
HOH
 3.291
5.981
3.347
 OG
O
OG
 K
K
O
5avq 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -74.9 -1.3 0.0 0.0 0.0 K
TL
K
TL
HOH
 2.718
2.718
5.717
5.717
3.238
 OG
OG
O
O
OG
 K
TL
K
TL
O
5avr 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -74.9 -1.2 0.0 0.0 0.0 K
TL
K
TL
HOH
 2.718
2.718
5.715
5.715
3.239
 OG
OG
O
O
OG
 K
TL
K
TL
O
5avs 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -74.9 -1.3 0.0 0.0 0.0 K
TL
TL
HOH
 2.718
2.718
5.716
3.238
 OG
OG
O
OG
 K
TL
TL
O
5avt 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -74.9 -1.4 0.0 0.0 0.0 K
TL
TL
HOH
 2.717
2.717
5.715
3.239
 OG
OG
O
OG
 K
TL
TL
O
5avu 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -74.8 -1.3 0.0 0.0 0.0 K
TL
TL
HOH
 2.718
2.718
5.714
3.239
 OG
OG
O
OG
 K
TL
TL
O
5avv 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -74.9 -1.3 0.0 0.0 0.0 TL
TL
HOH
 2.718
5.716
3.238
 OG
O
OG
 TL
TL
O
5avw 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -75.0 -1.2 0.0 0.0 0.0 TL
TL
HOH
 2.718
5.715
3.239
 OG
O
OG
 TL
TL
O
5avx 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -75.0 -1.3 0.0 0.0 0.0 TL
TL
HOH
 2.718
5.715
3.237
 OG
O
OG
 TL
TL
O
5avy 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -75.0 -1.2 0.0 0.0 0.0 TL
TL
HOH
 2.718
5.715
3.238
 OG
O
OG
 TL
TL
O
5avz 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -74.9 -1.3 0.0 0.0 0.0 TL
TL
HOH
 2.718
5.716
3.239
 OG
O
OG
 TL
TL
O
5aw0 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -74.9 -1.2 0.0 0.0 0.0 TL
TL
HOH
 2.718
5.717
3.238
 OG
O
OG
 TL
TL
O
5aw1 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -74.9 -1.3 0.0 0.0 0.0 K
TL
TL
HOH
 2.718
2.718
5.714
3.238
 OG
OG
O
OG
 K
TL
TL
O
5aw2 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -74.9 -1.3 0.0 0.0 0.0 TL
TL
HOH
 2.718
5.716
3.238
 OG
O
OG
 TL
TL
O
5aw3 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -74.9 -1.3 0.0 0.0 0.0 TL
TL
HOH
 2.719
5.716
3.239
 OG
O
OG
 TL
TL
O
5aw4 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -74.9 -1.3 0.0 0.0 0.0 K
RB
K
RB
HOH
 2.720
2.720
5.715
5.715
3.239
 OG
OG
O
O
OG
 K
RB
K
RB
O
5aw5 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -74.9 -1.2 0.0 0.0 0.0 K
RB
K
RB
HOH
 2.719
2.719
5.715
5.715
3.240
 OG
OG
O
O
OG
 K
RB
K
RB
O
5aw6 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -74.9 -1.3 0.0 0.0 0.0 K
RB
K
RB
HOH
 2.718
2.718
5.716
5.716
3.238
 OG
OG
O
O
OG
 K
RB
K
RB
O
5aw7 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -75.0 -1.2 0.0 0.0 0.0 K
RB
RB
HOH
 2.718
2.718
5.716
3.239
 OG
OG
O
OG
 K
RB
RB
O
5aw8 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -74.9 -1.3 0.0 0.0 0.0 RB
RB
HOH
 2.719
5.717
3.240
 OG
O
OG
 RB
RB
O
5aw9 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 SER A:787 A:782 0.0 0.0 T -69.8 0.2 0.0 0.0 0.0 K
K
HOH
 2.826
5.621
3.296
 OG
O
OG
 K
K
O

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p50993-f1 1 P50993 100.0 0.0 SER A:779 A:779 0.0 0.0 H -71.2 -20.4
af-p13637-f1 1 P13637 88.37 0.0 SER A:772 A:772 0.0 0.0 H -71.6 -19.4
af-p05023-f1 1 P05023 86.71 0.0 SER A:782 A:782 0.0 0.0 H -71.6 -20.8
af-q13733-f1 1 Q13733 80.48 0.0 SER A:788 A:788 0.0 0.0 H -71.9 -18.9