Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr1 160106082 . A C CCDS1196.1:NM_000702.3:c.2485Atg>Ctg_NP_000693.1:p.829M>L Homo sapiens ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2 (ATP1A2), mRNA.
pdb_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 
alphafold_id: 
label_asym_id: 
label_seq_id: 
label_comp_id: 
auth_asym_id: 
auth_seq_id: 

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
4xe5 1 Q08DA1 86.79 0.0 X-RAY
 2016-03-09 MET A:830 A:830 25.0 0.135 T -85.0 -5.3 25.0 0.135 0.0
3wgu 1 I7HD36 87.32 0.0 X-RAY
 2013-10-09 MET A:825 A:825 29.0 0.157 G -88.9 20.0 29.0 0.157 0.0 HOH
 5.590
 CG
 O
MET D:825 C:825 32.0 0.173 S -88.8 21.3 NA NA NA
3wgv 1 I7HD36 87.32 0.0 X-RAY
 2013-10-09 MET A:825 A:825 27.0 0.146 G -89.2 24.3 27.0 0.146 0.0 HOH
 5.251
 CG
 O
MET D:825 C:825 33.0 0.178 S -89.0 21.9 NA NA NA
4hqj 1 P05024 86.69 0.0 X-RAY
 2013-10-02 MET A:830 A:825 16.0 0.086 S -118.5 105.8 16.0 0.086 0.0
MET D:830 C:825 27.0 0.146 T -72.7 -19.1 NA NA NA
4hyt 1 P05024 86.69 0.0 X-RAY
 2013-06-26 MET A:830 A:825 31.0 0.168 T -66.5 -8.9 31.0 0.168 0.0
MET D:830 C:825 28.0 0.151 T -66.7 -8.4 NA NA NA
4res 1 P05024 86.69 0.0 X-RAY
 2015-01-28 MET A:830 A:825 28.0 0.151 T -87.0 0.8 28.0 0.151 0.0
MET D:830 C:825 26.0 0.141 T -86.9 0.0 NA NA NA
4ret 1 P05024 86.69 0.0 X-RAY
 2015-01-28 MET A:830 A:825 33.0 0.178 T -68.5 -7.2 33.0 0.178 0.0
MET D:830 C:825 27.0 0.146 T -68.6 -7.1 NA NA NA
7evx 1 P05024 86.69 0.0 X-RAY
 2021-07-07 MET A:830 A:825 24.0 0.13 G -79.0 7.8 24.0 0.13 0.0
MET D:830 C:825 28.0 0.151 G -78.8 6.7 NA NA NA
7d91 1 P05024 86.82 0.0 X-RAY
 2021-01-27 MET A:825 A:825 29.0 0.157 G -77.0 10.4 29.0 0.157 0.0
7d92 1 P05024 86.82 0.0 X-RAY
 2021-01-27 MET A:825 A:825 30.0 0.162 G -76.2 9.7 30.0 0.162 0.0
7d93 1 P05024 86.82 0.0 X-RAY
 2021-01-27 MET A:825 A:825 23.0 0.124 T -73.9 4.6 23.0 0.124 0.0
MET C:825 C:825 33.0 0.178 T -74.8 5.7 NA NA NA
7d94 1 P05024 86.82 0.0 X-RAY
 2021-01-27 MET A:825 A:825 18.0 0.097 T -73.5 5.1 18.0 0.097 0.0
MET D:825 C:825 30.0 0.162 T -75.1 6.6 NA NA NA
7ddf 1 P05024 86.82 0.0 X-RAY
 2021-01-27 MET A:825 A:825 28.0 0.151 T -73.6 4.7 28.0 0.151 0.0
MET D:825 C:825 31.0 0.168 G -74.7 5.8 NA NA NA
7ddh 1 P05024 86.82 0.0 X-RAY
 2021-01-27 MET A:825 A:825 28.0 0.151 T -77.3 10.1 28.0 0.151 0.0
MET D:825 C:825 32.0 0.173 T -78.4 10.4 NA NA NA
7ddi 1 P05024 86.82 0.0 X-RAY
 2021-01-27 MET A:825 A:825 31.0 0.168 G -76.0 11.1 31.0 0.168 0.0
MET D:825 C:825 34.0 0.184 G -76.1 11.3 NA NA NA
7ddj 1 P05024 86.82 0.0 X-RAY
 2021-01-27 MET A:825 A:825 22.0 0.119 T -73.2 4.8 22.0 0.119 0.0
MET D:825 C:825 31.0 0.168 T -74.5 5.7 NA NA NA
7ddk 1 P05024 86.82 0.0 X-RAY
 2021-01-27 MET A:825 A:825 25.0 0.135 G -78.9 0.9 25.0 0.135 0.0
MET D:825 C:825 32.0 0.173 T -80.5 2.0 NA NA NA
7ddl 1 P05024 86.82 0.0 X-RAY
 2021-01-27 MET A:825 A:825 20.0 0.108 T -75.3 5.7 20.0 0.108 0.0
MET D:825 C:825 28.0 0.151 T -76.6 7.1 NA NA NA
3b8e 1 P05024 87.56 0.0 X-RAY
 2007-12-18 MET A:807 A:825 30.0 0.162 G -59.9 24.5 30.0 0.162 0.0
MET D:807 C:825 32.0 0.173 S -70.5 34.1 NA NA NA
3kdp 1 P05024 87.56 0.0 X-RAY
 2010-02-16 MET A:807 A:825 20.0 0.108 G -69.8 41.0 20.0 0.108 0.0
MET D:807 C:825 19.0 0.103 G -71.3 40.8 NA NA NA
3n23 1 P05024 87.8 0.0 X-RAY
 2011-01-19 MET A:801 A:825 31.0 0.168 T -56.5 -18.2 31.0 0.168 0.0
MET D:801 C:825 31.0 0.168 T -56.3 -18.7 NA NA NA
2zxe 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2009-05-19 MET A:837 A:832 25.0 0.135 G -75.0 -6.1 25.0 0.135 0.0 HOH
 7.092
 CE
 O
3a3y 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2009-09-08 MET A:837 A:832 25.0 0.135 T -75.5 -22.4 25.0 0.135 0.0 HOH
 7.278
 CE
 O
5avq 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 MET A:837 A:832 25.0 0.135 G -75.0 -6.1 25.0 0.135 0.0
5avr 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 MET A:837 A:832 25.0 0.135 G -75.1 -6.1 25.0 0.135 0.0
5avs 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 MET A:837 A:832 25.0 0.135 G -75.0 -6.0 25.0 0.135 0.0
5avt 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 MET A:837 A:832 25.0 0.135 G -75.0 -6.1 25.0 0.135 0.0
5avu 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 MET A:837 A:832 25.0 0.135 G -75.0 -6.1 25.0 0.135 0.0
5avv 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 MET A:837 A:832 26.0 0.141 G -75.0 -6.1 26.0 0.141 0.0
5avw 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 MET A:837 A:832 26.0 0.141 G -75.0 -6.1 26.0 0.141 0.0
5avx 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 MET A:837 A:832 26.0 0.141 G -75.0 -6.1 26.0 0.141 0.0
5avy 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 MET A:837 A:832 26.0 0.141 G -75.0 -6.2 26.0 0.141 0.0
5avz 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 MET A:837 A:832 26.0 0.141 G -75.0 -6.1 26.0 0.141 0.0
5aw0 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 MET A:837 A:832 25.0 0.135 G -75.0 -6.2 25.0 0.135 0.0
5aw1 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 MET A:837 A:832 26.0 0.141 G -75.0 -6.2 26.0 0.141 0.0
5aw2 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 MET A:837 A:832 25.0 0.135 G -75.0 -6.1 25.0 0.135 0.0
5aw3 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 MET A:837 A:832 25.0 0.135 G -75.0 -6.0 25.0 0.135 0.0
5aw4 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 MET A:837 A:832 25.0 0.135 G -75.0 -6.2 25.0 0.135 0.0
5aw5 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 MET A:837 A:832 25.0 0.135 G -75.1 -6.1 25.0 0.135 0.0
5aw6 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 MET A:837 A:832 25.0 0.135 G -75.0 -6.2 25.0 0.135 0.0
5aw7 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 MET A:837 A:832 25.0 0.135 G -75.2 -6.0 25.0 0.135 0.0
5aw8 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 MET A:837 A:832 25.0 0.135 G -75.0 -6.1 25.0 0.135 0.0
5aw9 1 Q4H132 84.65 0.0 X-RAY
 2015-09-02 MET A:837 A:832 24.0 0.13 G -77.9 -0.7 24.0 0.13 0.0 HOH
 7.080
 CE
 O

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p50993-f1 1 P50993 100.0 0.0 MET A:829 A:829 27.0 0.146 T -89.1 -4.6
af-p13637-f1 1 P13637 88.37 0.0 MET A:822 A:822 26.0 0.141 T -89.0 -4.0
af-p05023-f1 1 P05023 86.71 0.0 MET A:832 A:832 27.0 0.146 T -88.8 -4.5
af-q13733-f1 1 Q13733 80.48 0.0 MET A:838 A:838 28.0 0.151 T -89.7 -5.9