Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr1 | 161495601 | . | G | A | CCDS1231.1:NM_002155.3:c.1153Gac>Aac_NP_002146.2:p.385D>N | Homo sapiens heat shock 70kDa protein 6 (HSP70B') (HSPA6), mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
7kw7 | 2 | P0DMV8 | 84.32 | 0.0 |
EM |
2021-12-08 | ASP | C:383 | C:383 | 128.0 | 0.853 | S | -81.3 | 67.8 | 128.0 | 0.853 | 0.0 | ||||||
ASP | D:383 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
1yuw | 1 | P19120 | 82.88 | 0.0 |
X-RAY |
2005-10-04 | ASP | A:383 | A:383 | 53.0 | 0.353 | -159.4 | 124.0 | 53.0 | 0.353 | 0.0 |
HOH |
4.860 |
OD1 |
O |
|||
4fl9 | 1 | P19120 | 82.88 | 0.0 |
X-RAY |
2013-10-02 | ASP | A:383 | A:383 | 121.0 | 0.807 | 165.7 | 360.0 | 121.0 | 0.807 | 0.0 |
HOH |
5.854 |
HB2 |
O |
|||
6h54 | 1 | P19120 | 82.88 | 0.0 |
X-RAY |
2019-08-14 | ASP | A:383 | A:383 | 134.0 | 0.893 | -147.5 | 360.0 | 134.0 | 0.893 | 0.0 |
HOH |
7.185 |
CB |
O |
|||
3c7n | 2 | P19120 | 82.7 | 0.0 |
X-RAY |
2008-05-27 | ASP | B:383 | B:383 | 102.0 | 0.68 | T | 87.0 | 12.2 | 102.0 | 0.68 | 0.0 | ||||||
2v7z | 1 | Q4FZY7 | 83.64 | 0.0 |
X-RAY |
2008-04-08 | ASP | A:383 | A:383 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
HOH |
7.166 |
N |
O |
||
ASP | B:383 | B:383 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | |||||||||||||
3fe1 | 1 | P17066 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2008-12-16 | ASP | A:403 | A:385 | 239.0 | NA | -92.1 | 360.0 | 239.0 | NA | NA |
HOH |
2.395 |
O |
O |
|||
ASP | B:403 | B:385 | 241.0 | NA | -92.5 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ASP | C:403 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
2e88 | 1 | Q5JQI4 | 87.73 | 0.0 |
X-RAY |
2008-01-22 | ASP | A:386 | A:383 | 93.0 | 0.62 | -141.5 | 360.0 | 93.0 | 0.62 | 0.0 |
HOH |
2.485 |
OD1 |
O |
|||
2e8a | 1 | Q5JQI4 | 87.73 | 0.0 |
X-RAY |
2008-01-22 | ASP | A:386 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
3a8y | 1 | P08107 | 87.73 | 0.0 |
X-RAY |
2010-03-31 | ASP | A:387 | A:383 | 124.0 | 0.827 | 74.4 | 360.0 | 124.0 | 0.827 | 0.0 |
HOH |
2.885 |
OD2 |
O |
|||
ASP | B:387 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
3atu | 1 | P08107 | 87.73 | 0.0 |
X-RAY |
2011-12-28 | ASP | A:387 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
3atv | 1 | P08107 | 87.73 | 0.0 |
X-RAY |
2011-12-28 | ASP | A:387 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
3ay9 | 1 | P08107 | 87.73 | 0.0 |
X-RAY |
2011-12-28 | ASP | A:387 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
5bn8 | 1 | P0DMV8 | 87.73 | 0.0 |
X-RAY |
2016-09-14 | ASP | A:383 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
5bn9 | 1 | P0DMV8 | 87.47 | 0.0 |
X-RAY |
2016-09-14 | ASP | A:383 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
5bpl | 1 | P0DMV8 | 87.47 | 0.0 |
X-RAY |
2016-09-14 | ASP | A:383 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
3jxu | 1 | P08107 | 87.93 | 0.0 |
X-RAY |
2009-10-20 | ASP | A:405 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
5bpm | 1 | P0DMV8 | 87.21 | 0.0 |
X-RAY |
2016-09-14 | ASP | A:383 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
5bpn | 1 | P0DMV8 | 87.21 | 0.0 |
X-RAY |
2016-09-14 | ASP | A:383 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
2qw9 | 1 | P19120 | 83.29 | 0.0 |
X-RAY |
2007-12-18 | ASP | A:383 | A:383 | 116.0 | 0.773 | -117.2 | 33.7 | 116.0 | 0.773 | 0.0 |
HOH |
7.524 |
O |
O |
|||
ASP | B:383 | B:383 | 83.0 | 0.553 | -113.6 | 26.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
2qwl | 1 | P19120 | 83.29 | 0.0 |
X-RAY |
2007-12-18 | ASP | A:383 | A:383 | 98.0 | 0.653 | -99.2 | 19.6 | 98.0 | 0.653 | 0.0 |
HOH |
4.519 |
N |
O |
|||
ASP | B:383 | B:383 | 102.0 | 0.68 | -91.6 | 0.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
2qwm | 1 | P19120 | 83.29 | 0.0 |
X-RAY |
2007-12-18 | ASP | A:383 | A:383 | 100.0 | 0.667 | -105.4 | 23.7 | 100.0 | 0.667 | 0.0 |
HOH |
7.038 |
CB |
O |
|||
ASP | B:383 | B:383 | 101.0 | 0.673 | -111.6 | 10.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
3gdq | 1 | P34931 | 83.68 | 0.0 |
X-RAY |
2009-04-14 | ASP | A:407 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
2qwn | 1 | P19120 | 83.03 | 0.0 |
X-RAY |
2007-12-18 | ASP | A:383 | A:383 | 86.0 | 0.573 | -106.8 | 12.6 | 86.0 | 0.573 | 0.0 |
HOH |
3.288 |
N |
O |
|||
2qwo | 1 | P19120 | 83.03 | 0.0 |
X-RAY |
2007-12-18 | ASP | A:383 | A:383 | 91.0 | 0.607 | -107.9 | 18.8 | 91.0 | 0.607 | 0.0 |
HOH |
2.635 |
OD2 |
O |
|||
2qwp | 1 | P19120 | 83.03 | 0.0 |
X-RAY |
2007-12-18 | ASP | A:383 | A:383 | 89.0 | 0.593 | -102.7 | 18.4 | 89.0 | 0.593 | 0.0 |
HOH |
2.527 |
OD2 |
O |
|||
2qwq | 1 | P19120 | 83.03 | 0.0 |
X-RAY |
2007-12-18 | ASP | A:383 | A:383 | 72.0 | 0.48 | S | -88.7 | 1.1 | 72.0 | 0.48 | 0.0 |
HOH |
4.303 |
C |
O |
||
2qwr | 1 | P19120 | 83.03 | 0.0 |
X-RAY |
2007-12-18 | ASP | A:383 | A:383 | 73.0 | 0.487 | S | -91.0 | 0.9 | 73.0 | 0.487 | 0.0 |
HOH |
4.243 |
C |
O |
||
1hpm | 1 | P19120 | 83.2 | 0.0 |
X-RAY |
1995-07-31 | ASP | A:383 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
1ngi | 1 | P19120 | 83.2 | 0.0 |
X-RAY |
1994-08-31 | ASP | A:383 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
1ngj | 1 | P19120 | 83.2 | 0.0 |
X-RAY |
1994-08-31 | ASP | A:383 | A:383 | 65.0 | 0.433 | -75.6 | -17.0 | 65.0 | 0.433 | 0.0 |
HOH |
4.629 |
OD2 |
O |
|||
3hsc | 1 | P19120 | 83.2 | 0.0 |
X-RAY |
1995-07-10 | ASP | A:383 | A:383 | 70.0 | 0.467 | -71.7 | -14.9 | 70.0 | 0.467 | 0.0 |
HOH |
4.066 |
OD2 |
O |
|||
1bup | 1 | P19120 | 82.94 | 0.0 |
X-RAY |
1998-09-09 | ASP | A:383 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
1ngb | 1 | P19120 | 82.94 | 0.0 |
X-RAY |
1994-08-31 | ASP | A:383 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
1ngd | 1 | P19120 | 82.94 | 0.0 |
X-RAY |
1994-08-31 | ASP | A:383 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
1ngf | 1 | P19120 | 82.94 | 0.0 |
X-RAY |
1994-08-31 | ASP | A:383 | A:383 | 66.0 | 0.44 | -113.4 | 8.4 | 66.0 | 0.44 | 0.0 |
HOH |
6.034 |
OD2 |
O |
|||
1ngh | 1 | P19120 | 82.94 | 0.0 |
X-RAY |
1994-08-31 | ASP | A:383 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
1nga | 1 | P19120 | 82.94 | 0.0 |
X-RAY |
1994-08-31 | ASP | A:383 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
1atr | 1 | P19120 | 82.94 | 0.0 |
X-RAY |
1993-10-31 | ASP | A:383 | A:383 | 120.0 | 0.8 | -135.5 | 16.1 | 120.0 | 0.8 | 0.0 |
HOH |
3.853 |
OD1 |
O |
|||
6zyj | 1 | P11142 | 83.38 | 0.0 |
X-RAY |
2020-12-16 | ASP | A:379 | A:383 | 104.0 | 0.693 | -104.5 | 13.3 | 104.0 | 0.693 | 0.0 |
HOH |
7.133 |
CB |
O |
|||
ASP | B:379 | B:383 | 103.0 | 0.687 | -96.6 | 6.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
1ngg | 1 | P19120 | 82.94 | 0.0 |
X-RAY |
1994-08-31 | ASP | A:383 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
1ngc | 1 | P19120 | 82.94 | 0.0 |
X-RAY |
1994-08-31 | ASP | A:383 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
1nge | 1 | P19120 | 82.94 | 0.0 |
X-RAY |
1994-08-31 | ASP | A:383 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
1ats | 1 | P19120 | 82.94 | 0.0 |
X-RAY |
1993-10-31 | ASP | A:383 | A:383 | 153.0 | 1.0 | 179.1 | 360.0 | 153.0 | 1.0 | 0.0 |
HOH |
7.077 |
C |
O |
|||
4h5n | 1 | P11142 | 83.38 | 0.0 |
X-RAY |
2014-03-19 | ASP | A:382 | A:383 | 99.0 | 0.66 | -120.1 | 25.0 | 99.0 | 0.66 | 0.0 |
HOH |
2.631 |
OD2 |
O |
|||
ASP | B:382 | B:383 | 64.0 | 0.427 | -65.9 | -0.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
4h5r | 1 | P11142 | 83.38 | 0.0 |
X-RAY |
2014-03-19 | ASP | A:382 | A:383 | 97.0 | 0.647 | -109.9 | -3.4 | 97.0 | 0.647 | 0.0 |
HOH |
3.904 |
OD2 |
O |
|||
ASP | B:382 | B:383 | 89.0 | 0.593 | -123.2 | 6.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
4h5t | 1 | P11142 | 83.38 | 0.0 |
X-RAY |
2014-03-19 | ASP | A:382 | A:383 | 102.0 | 0.68 | -91.4 | 31.4 | 102.0 | 0.68 | 0.0 |
HOH |
2.651 |
O |
O |
|||
4h5v | 1 | P11142 | 83.38 | 0.0 |
X-RAY |
2014-03-19 | ASP | A:382 | A:383 | 80.0 | 0.533 | -91.4 | 3.4 | 80.0 | 0.533 | 0.0 |
HOH |
2.580 |
OD2 |
O |
|||
4h5w | 1 | P11142 | 83.38 | 0.0 |
X-RAY |
2014-03-19 | ASP | A:382 | A:383 | 94.0 | 0.627 | -90.8 | 9.3 | 94.0 | 0.627 | 0.0 |
HOH |
4.508 |
N |
O |
|||
ASP | B:382 | B:383 | 86.0 | 0.573 | -84.4 | 13.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
1ba0 | 1 | P19120 | 82.94 | 0.0 |
X-RAY |
1998-07-15 | ASP | A:383 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
4fsv | 1 | P54652 | 83.42 | 0.0 |
X-RAY |
2012-07-18 | ASP | A:386 | A:386 | 57.0 | NA | -89.4 | -2.5 | 57.0 | NA | NA |
HOH |
3.902 |
O |
O |
|||
1ba1 | 1 | P19120 | 82.94 | 0.0 |
X-RAY |
1998-07-15 | ASP | A:383 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
5fpd | 1 | P54652 | 83.2 | 0.0 |
X-RAY |
2015-12-16 | ASP | A:387 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ASP | B:387 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5fpe | 1 | P54652 | 83.2 | 0.0 |
X-RAY |
2015-12-23 | ASP | A:387 | A:385 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
HOH |
2.688 |
N |
O |
||
ASP | B:387 | B:385 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | |||||||||||||
5fpm | 1 | P54652 | 83.2 | 0.0 |
X-RAY |
2015-12-16 | ASP | A:387 | A:385 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
HOH |
2.733 |
N |
O |
||
ASP | B:387 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
3i33 | 1 | P54652 | 84.21 | 0.0 |
X-RAY |
2009-07-21 | ASP | A:404 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
5xi9 | 1 | P0DMV8 | 83.7 | 2e-108 |
NMR |
2018-05-16 | ASP | A:4 | A:4 | 162.0 | 1.0 | -107.1 | 153.8 | 162.0 | 1.0 | 0.0 | |||||||
5xir | 1 | P0DMV8 | 83.15 | 2e-107 |
NMR |
2018-05-16 | ASP | A:4 | A:4 | 104.0 | 0.693 | 65.9 | 107.7 | 104.0 | 0.693 | 0.0 |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p17066-f1 | 1 | P17066 | 100.0 | 0.0 | ASP | A:385 | A:385 | 26.0 | 0.173 | -61.9 | 135.6 | ||
af-p0dmv8-f1 | 1 | P0DMV8 | 84.32 | 0.0 | ASP | A:383 | A:383 | 49.0 | 0.327 | -61.2 | 143.5 | ||
af-p0dmv9-f1 | 1 | P0DMV9 | 84.32 | 0.0 | ASP | A:383 | A:383 | 49.0 | 0.327 | -61.9 | 145.6 | ||
af-p11142-f1 | 1 | P11142 | 80.03 | 0.0 | ASP | A:383 | A:383 | 52.0 | 0.347 | -59.6 | 138.8 |