Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr1 | 19669322 | . | C | A | CCDS55579.1:NM_001206540.1:c.768aaG>aaT_NP_001193469.1:p.256K>N | Homo sapiens capping actin protein of muscle Z-line beta subunit (CAPZB), transcript variant 2, mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
1izn | 2 | P14315 | 98.92 | 0.0 |
X-RAY |
2003-04-08 | LYS | B:256 | B:256 | 148.0 | 0.74 | H | -73.0 | -41.0 | 130.0 | 0.65 | 0.09 |
A:P13127:0.09 |
HOH |
5.113 |
O |
O |
|
LYS | D:256 | D:256 | 156.0 | 0.78 | H | -79.2 | -42.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2kz7 | 2 | P14315 | 98.92 | 0.0 |
NMR |
2010-07-14 | LYS | B:256 | B:556 | 153.0 | 0.765 | H | -69.6 | -37.5 | 139.0 | 0.695 | 0.07 |
A:P13127:0.07 |
|||||
3aaa | 2 | P14315 | 98.92 | 0.0 |
X-RAY |
2010-08-04 | LYS | B:256 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
3aae | 2 | P14315 | 98.92 | 0.0 |
X-RAY |
2010-11-17 | LYS | B:256 | B:256 | 95.0 | 0.475 | H | -53.6 | -32.1 | 95.0 | 0.475 | 0.0 | ||||||
LYS | D:256 | D:256 | 108.0 | 0.54 | H | -71.1 | -14.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LYS | F:256 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
LYS | H:256 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
LYS | J:256 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
3lk3 | 2 | P14315 | 98.92 | 0.0 |
X-RAY |
2010-04-07 | LYS | B:256 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
3lk4 | 2 | P14315 | 98.92 | 0.0 |
X-RAY |
2010-04-07 | LYS | B:256 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
LYS | E:256 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
LYS | H:256 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
LYS | K:256 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
LYS | N:256 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
LYS | Q:256 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
LYS | T:256 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
LYS | W:256 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
LYS | Z:256 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
LYS | CA:256 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
LYS | FA:256 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
LYS | IA:256 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5nw4 | 14 | D2JYW4 | 98.19 | 0.0 |
EM |
2017-08-02 | GLN | V:272 | Z:256 | 100.0 | 0.556 | H | -63.7 | -36.7 | 100.0 | 0.556 | 0.0 | ||||||
2kxp | 2 | P14315 | 98.89 | 0.0 |
NMR |
2010-06-09 | LYS | B:255 | B:556 | 130.0 | 0.65 | H | -57.5 | -47.0 | 111.0 | 0.555 | 0.095 |
A:P13127:0.095 |
|||||
5adx | 5 | D2JYW4 | 98.52 | 0.0 |
EM |
2015-12-30 | GLN | L:255 | L:256 | 100.0 | 0.556 | H | -63.7 | -36.7 | 100.0 | 0.556 | 0.0 | ||||||
5afu | 9 | D2JYW4 | 98.52 | 0.0 |
EM |
2015-03-11 | GLN | R:255 | L:256 | 100.0 | 0.556 | H | -63.7 | -36.7 | 100.0 | 0.556 | 0.0 | ||||||
6f1u | 3 | A9XFX6 | 92.96 | 0.0 |
EM |
2018-01-17 | GLU | E:256 | L:256 | 96.0 | 0.505 | H | -76.5 | -22.3 | 96.0 | 0.505 | 0.0 | ||||||
6f1t | 5 | A9XFX6 | 92.96 | 0.0 |
EM |
2018-01-17 | GLU | L:256 | L:256 | 96.0 | 0.505 | H | -76.5 | -22.3 | 96.0 | 0.505 | 0.0 | ||||||
6f38 | 5 | A9XFX6 | 92.96 | 0.0 |
EM |
2018-01-17 | GLU | L:256 | L:256 | 62.0 | NA | H | -70.3 | -24.9 | 62.0 | NA | NA | ||||||
6f3a | 5 | A9XFX6 | 92.96 | 0.0 |
EM |
2018-01-17 | GLU | L:256 | L:256 | 58.0 | NA | H | -67.7 | -28.6 | 58.0 | NA | NA | ||||||
6znl | 5 | A9XFX6 | 92.96 | 0.0 |
EM |
2020-07-29 | GLU | L:256 | L:256 | 90.0 | 0.474 | H | -64.3 | -40.0 | 90.0 | 0.474 | 0.0 | ||||||
7ccc | 4 | Q923G3 | 92.96 | 0.0 |
X-RAY |
2021-02-03 | GLU | D:256 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
7pdz | 1 | P47757 | 92.96 | 0.0 |
EM |
2021-09-01 | GLU | A:256 | E:256 | 131.0 | 0.689 | H | -53.3 | -42.4 | 75.0 | 0.395 | 0.294 |
C:P60712:0.295 |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p47756-f1 | 1 | P47756 | 100.0 | 0.0 | LYS | A:256 | A:256 | 103.0 | 0.515 | H | -64.4 | -37.0 |