Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr1 | 226595617 | . | G | A | CCDS1554.1:NM_001618.3:c.14tCg>tTg_NP_001609.2:p.5S>L | Homo sapiens poly(ADP-ribose) polymerase 1 (PARP1), mRNA. |
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PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
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| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 2n8a | 1 | P09874 | 100.0 | 1e-152 |
NMR |
2015-12-02 | SER | A:5 | A:5 | 40.0 | 0.348 | -143.8 | 19.4 | 40.0 | 0.348 | 0.0 | |||||||
| 4av1 | 1 | P09874 | 98.02 | 1e-140 |
X-RAY |
2012-06-13 | SER | A:26 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
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| SER | D:26 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4opx | 1 | P09874 | 100.0 | 5e-62 |
X-RAY |
2014-07-02 | SER | A:5 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| SER | C:5 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4oqa | 1 | P09874 | 100.0 | 5e-62 |
X-RAY |
2014-07-02 | SER | A:5 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| SER | C:5 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4oqb | 1 | P09874 | 100.0 | 5e-62 |
X-RAY |
2014-07-02 | SER | A:5 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| SER | C:5 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2l30 | 1 | P09874 | 100.0 | 4e-71 |
NMR |
2011-02-02 | SER | A:5 | A:5 | 49.0 | 0.426 | T | -112.4 | 17.9 | 49.0 | 0.426 | 0.0 | ||||||
| 3od8 | 1 | P09874 | 100.0 | 1e-62 |
X-RAY |
2011-01-12 | SER | A:25 | A:5 | 103.0 | 0.896 | 360.0 | 132.9 | 103.0 | 0.896 | 0.0 |
HOH |
3.411 |
O |
O |
|||
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HOH |
7.337 |
OG |
O |
||||||||||
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| SER | D:25 | D:5 | 101.0 | 0.878 | 360.0 | 139.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | E:25 | E:5 | 121.0 | NA | 360.0 | -51.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
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| SER | H:25 | H:5 | 95.0 | 0.826 | 360.0 | 149.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 3oda | 1 | P09874 | 100.0 | 1e-62 |
X-RAY |
2011-01-12 | SER | A:25 | A:5 | 96.0 | 0.835 | 360.0 | 155.7 | 96.0 | 0.835 | 0.0 |
HOH |
7.157 |
OG |
O |
|||
| SER | B:25 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| SER | C:25 | C:5 | 97.0 | 0.843 | 360.0 | 155.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | D:25 | D:5 | 103.0 | 0.896 | 360.0 | 141.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
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| 4dqy | 1 | P09874 | 100.0 | 1e-62 |
X-RAY |
2012-05-30 | SER | A:25 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| SER | D:25 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
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| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p09874-f1 | 1 | P09874 | 100.0 | 0.0 | SER | A:5 | A:5 | 34.0 | 0.296 | -63.4 | 152.4 | ||