Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr1 | 53679053 | . | C | A | CCDS575.1:NM_000098.2:c.1763tCc>tAc_NP_000089.1:p.588S>Y | Homo sapiens carnitine palmitoyltransferase 2 (CPT2), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 4eyw | 1 | P18886 | 84.02 | 0.0 |
X-RAY |
2013-04-24 | SER | A:564 | A:588 | 11.0 | 0.096 | E | -109.7 | 122.0 | 11.0 | 0.096 | 0.0 |
L0R P6G HOH |
9.943 9.022 2.643 |
OG O OG |
C18 C14 O |
||
| SER | B:564 | B:588 | 12.0 | 0.104 | E | -118.0 | 125.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2deb | 1 | P18886 | 84.02 | 0.0 |
X-RAY |
2007-02-10 | SER | A:583 | A:588 | 11.0 | 0.096 | E | -108.8 | 122.6 | 11.0 | 0.096 | 0.0 |
PLM HOH |
9.051 2.773 |
O OG |
CC O |
||
| SER | B:583 | B:588 | 11.0 | 0.096 | E | -109.8 | 125.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2fw3 | 1 | P18886 | 84.02 | 0.0 |
X-RAY |
2007-02-01 | SER | A:583 | A:588 | 10.0 | 0.087 | E | -112.5 | 127.8 | 10.0 | 0.087 | 0.0 |
BUI HOH |
3.312 3.874 |
OG CB |
C12 O |
||
| 2fyo | 1 | P18886 | 84.02 | 0.0 |
X-RAY |
2007-02-08 | SER | A:583 | A:588 | 11.0 | 0.096 | E | -104.7 | 121.4 | 11.0 | 0.096 | 0.0 |
HOH |
2.846 |
OG |
O |
||
| 2rcu | 1 | P18886 | 84.02 | 0.0 |
X-RAY |
2007-10-16 | SER | A:583 | A:588 | 11.0 | 0.096 | E | -108.9 | 124.5 | 11.0 | 0.096 | 0.0 |
BUJ HOH |
3.486 2.700 |
OG OG |
C11 O |
||
| SER | B:583 | B:588 | 11.0 | 0.096 | E | -109.7 | 124.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4ep9 | 1 | P18886 | 84.02 | 0.0 |
X-RAY |
2013-04-17 | SER | A:583 | A:588 | 9.0 | 0.078 | E | -115.6 | 117.4 | 9.0 | 0.078 | 0.0 |
0RD PLM HOH |
9.381 8.889 2.873 |
OG O OG |
O21 CD O |
||
| 4eph | 1 | P18886 | 84.02 | 0.0 |
X-RAY |
2013-04-17 | SER | A:583 | A:588 | 10.0 | 0.087 | E | -116.9 | 117.4 | 10.0 | 0.087 | 0.0 |
0RK BOG HOH |
9.331 3.366 3.633 |
OG OG CB |
O30 O4 O |
||
| 2h4t | 1 | P18886 | 84.27 | 0.0 |
X-RAY |
2006-07-25 | SER | A:558 | A:588 | 5.0 | 0.043 | E | -106.0 | 127.7 | 5.0 | 0.043 | 0.0 |
D12 HOH |
4.350 3.398 |
OG OG |
C7 O |
||
| SER | B:558 | B:588 | 5.0 | 0.043 | E | -106.3 | 123.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p23786-f1 | 1 | P23786 | 100.0 | 0.0 | SER | A:588 | A:588 | 8.0 | 0.07 | E | -104.9 | 117.8 | |