Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr1 | 55518082 | . | C | A | CCDS603.1:NM_174936.3:c.655Cag>Aag_NP_777596.2:p.219Q>K | Homo sapiens proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 (PCSK9), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 2p4e | 1 | Q8NBP7 | 99.71 | 0.0 |
X-RAY |
2007-04-10 | GLN | A:219 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLN | B:219 | A:219 | 193.0 | 1.0 | 360.0 | -40.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6u2f | 1 | Q8NBP7 | 99.71 | 0.0 |
X-RAY |
2020-02-05 | GLN | A:219 | A:219 | 165.0 | 0.917 | T | 60.7 | -121.5 | 165.0 | 0.917 | 0.0 | ||||||
| 5vlp | 1 | Q8NBP7 | 99.71 | 0.0 |
X-RAY |
2017-08-16 | GLN | A:219 | A:219 | 167.0 | 0.928 | T | 56.4 | -129.2 | 167.0 | 0.928 | 0.0 | ||||||
| 6u3i | 1 | Q8NBP7 | 99.71 | 0.0 |
X-RAY |
2020-02-05 | GLN | A:219 | A:219 | 167.0 | 0.928 | T | 59.2 | -124.2 | 167.0 | 0.928 | 0.0 | ||||||
| 6u26 | 1 | Q8NBP7 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-06 | GLN | A:189 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLN | B:189 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6u2n | 1 | Q8NBP7 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-06 | GLN | A:189 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLN | B:189 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6u2p | 1 | Q8NBP7 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-06 | GLN | A:189 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLN | B:189 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6u36 | 1 | Q8NBP7 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-06 | GLN | A:189 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLN | B:189 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6u38 | 1 | Q8NBP7 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-06 | GLN | A:189 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLN | B:189 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6u3x | 1 | Q8NBP7 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-06 | GLN | A:189 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLN | B:189 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2pmw | 2 | Q5SZQ2 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2007-05-08 | GLN | B:67 | B:219 | 164.0 | 0.911 | 360.0 | 124.2 | 164.0 | 0.911 | 0.0 |
HOH |
5.157 |
OE1 |
O |
|||
| 3p5b | 2 | Q8NBP7 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2011-10-26 | GLN | B:67 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3p5c | 2 | Q8NBP7 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2011-10-26 | GLN | B:67 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3bps | 2 | Q8NBP7 | 99.63 | 0.0 |
X-RAY |
2008-02-12 | GLN | B:67 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3gcw | 2 | Q8NBP7 | 99.63 | 0.0 |
X-RAY |
2009-03-03 | GLN | B:67 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3gcx | 2 | Q8NBP7 | 99.63 | 0.0 |
X-RAY |
2009-03-03 | GLN | B:67 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3sqo | 1 | Q8NBP7 | 99.63 | 0.0 |
X-RAY |
2012-05-16 | GLN | A:67 | A:219 | 192.0 | 1.0 | 360.0 | -55.1 | 192.0 | 1.0 | 0.0 |
HOH |
3.069 |
N |
O |
|||
| 4ne9 | 1 | Q8NBP7 | 99.63 | 0.0 |
X-RAY |
2014-09-10 | GLN | A:67 | A:219 | 134.0 | 0.744 | H | -78.6 | -35.1 | 134.0 | 0.744 | 0.0 | ||||||
| GLN | B:67 | B:219 | 192.0 | 1.0 | 360.0 | -37.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 4k8r | 2 | Q8NBP7 | 99.63 | 0.0 |
X-RAY |
2013-05-08 | GLN | B:67 | B:219 | 208.0 | 1.0 | T | -64.7 | -29.1 | 208.0 | 1.0 | 0.0 |
HOH |
3.137 |
O |
O |
||
| 5vl7 | 2 | Q8NBP7 | 99.63 | 0.0 |
X-RAY |
2017-08-16 | GLN | B:67 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 2qtw | 2 | Q8NBP7 | 99.63 | 0.0 |
X-RAY |
2007-09-18 | GLN | B:67 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7kev | 2 | Q8NBP7 | 99.63 | 0.0 |
X-RAY |
2021-11-24 | GLN | B:67 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7kfa | 2 | Q8NBP7 | 99.63 | 0.0 |
X-RAY |
2021-11-10 | GLN | B:67 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3m0c | 2 | Q8NBP7 | 99.44 | 0.0 |
X-RAY |
2011-03-16 | GLN | B:67 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3h42 | 2 | Q8NBP7 | 99.26 | 0.0 |
X-RAY |
2009-05-05 | GLN | B:67 | B:219 | 203.0 | 1.0 | T | -67.5 | -26.5 | 203.0 | 1.0 | 0.0 |
HOH |
2.802 |
O |
O |
||
| 5oca | 2 | Q8NBP7 | 99.26 | 0.0 |
X-RAY |
2017-09-20 | GLN | B:67 | B:219 | 153.0 | 0.85 | T | -54.0 | -36.3 | 153.0 | 0.85 | 0.0 |
HOH |
2.392 |
OE1 |
O |
||
| 5vla | 1 | Q8NBP7 | 99.78 | 0.0 |
X-RAY |
2017-08-16 | GLN | A:219 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 5vlh | 1 | Q8NBP7 | 99.78 | 0.0 |
X-RAY |
2017-08-16 | GLN | A:219 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 5vlk | 1 | Q8NBP7 | 99.78 | 0.0 |
X-RAY |
2017-08-16 | GLN | A:219 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 5vll | 1 | Q8NBP7 | 99.78 | 0.0 |
X-RAY |
2017-08-16 | GLN | A:219 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 4nmx | 2 | Q8NBP7 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2013-12-04 | GLN | B:67 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6xib | 2 | Q8NBP7 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-11-18 | GLN | B:67 | B:219 | 112.0 | 0.622 | -93.2 | 124.2 | 112.0 | 0.622 | 0.0 |
HOH |
2.767 |
NE2 |
O |
|||
| 6xic | 2 | Q8NBP7 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-11-18 | GLN | B:67 | B:219 | 120.0 | 0.667 | -80.7 | 127.3 | 120.0 | 0.667 | 0.0 |
HOH |
2.842 |
NE2 |
O |
|||
| 6xid | 2 | Q8NBP7 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-11-18 | GLN | B:67 | B:219 | 107.0 | 0.594 | -92.7 | 125.2 | 107.0 | 0.594 | 0.0 |
HOH |
2.911 |
NE2 |
O |
|||
| 6xie | 2 | Q8NBP7 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-11-18 | GLN | B:67 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6xif | 2 | Q8NBP7 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-11-18 | GLN | B:67 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7s5g | 2 | Q8NBP7 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-11-03 | GLN | B:67 | B:219 | 115.0 | 0.639 | -101.0 | 122.7 | 115.0 | 0.639 | 0.0 |
HOH |
3.013 |
N |
O |
|||
| 7s5h | 2 | Q8NBP7 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-11-03 | GLN | B:67 | B:219 | 92.0 | 0.511 | S | -68.7 | 152.4 | 92.0 | 0.511 | 0.0 |
HOH |
3.755 |
N |
O |
||
| 2w2m | 1 | Q8NBP7 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2008-11-18 | GLN | A:67 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 2w2n | 1 | Q8NBP7 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2008-11-18 | GLN | A:67 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 2w2p | 1 | Q8NBP7 | 99.67 | 0.0 |
X-RAY |
2008-11-18 | GLN | A:67 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 2w2q | 1 | Q8NBP7 | 99.67 | 0.0 |
X-RAY |
2008-11-18 | GLN | A:67 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 2w2o | 1 | Q8NBP7 | 99.67 | 0.0 |
X-RAY |
2008-11-18 | GLN | A:67 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 2xtj | 1 | Q8NBP7 | 99.67 | 0.0 |
X-RAY |
2010-11-03 | GLN | A:67 | A:219 | 254.0 | 1.0 | 360.0 | -1.4 | 254.0 | 1.0 | 0.0 |
HOH |
3.033 |
OE1 |
O |
|||
| 4ov6 | 2 | Q8NBP7 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2014-07-02 | GLN | B:67 | B:219 | 114.0 | NA | T | -51.4 | -35.7 | 114.0 | NA | NA |
HOH |
4.136 |
O |
O |
||
| GLN | D:67 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-q8nbp7-f1 | 1 | Q8NBP7 | 100.0 | 0.0 | GLN | A:219 | A:219 | 177.0 | 0.983 | T | 51.4 | -121.7 | |