Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr1 | 55529187 | . | G | A | CCDS603.1:NM_174936.3:c.2009gGg>gAg_NP_777596.2:p.670G>E | Homo sapiens proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 (PCSK9), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 2p4e | 1 | Q8NBP7 | 99.71 | 0.0 |
X-RAY |
2007-04-10 | GLU | A:670 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | B:670 | A:670 | 80.0 | 0.421 | -64.9 | 145.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6u2f | 1 | Q8NBP7 | 99.71 | 0.0 |
X-RAY |
2020-02-05 | GLY | A:670 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 5vlp | 1 | Q8NBP7 | 99.71 | 0.0 |
X-RAY |
2017-08-16 | GLU | A:670 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6u3i | 1 | Q8NBP7 | 99.71 | 0.0 |
X-RAY |
2020-02-05 | GLU | A:670 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6u26 | 1 | Q8NBP7 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-06 | GLU | A:640 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | B:640 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6u2n | 1 | Q8NBP7 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-06 | GLU | A:640 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | B:640 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6u2p | 1 | Q8NBP7 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-06 | GLU | A:640 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | B:640 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6u36 | 1 | Q8NBP7 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-06 | GLU | A:640 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | B:640 | B:670 | 165.0 | 0.868 | 360.0 | 152.4 | 165.0 | 0.868 | 0.0 | ||||||||||||||
| 6u38 | 1 | Q8NBP7 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-06 | GLU | A:640 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | B:640 | B:670 | 167.0 | 0.879 | 360.0 | 150.9 | 167.0 | 0.879 | 0.0 | ||||||||||||||
| 6u3x | 1 | Q8NBP7 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-06 | GLU | A:640 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | B:640 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2pmw | 2 | Q5SZQ2 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2007-05-08 | GLY | B:518 | B:670 | 114.0 | 1.0 | 360.0 | -114.9 | 114.0 | 1.0 | 0.0 | |||||||
| 3p5b | 2 | Q8NBP7 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2011-10-26 | GLY | B:518 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3p5c | 2 | Q8NBP7 | 99.81 | 0.0 |
X-RAY |
2011-10-26 | GLY | B:518 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3bps | 2 | Q8NBP7 | 99.63 | 0.0 |
X-RAY |
2008-02-12 | GLU | B:518 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3gcw | 2 | Q8NBP7 | 99.63 | 0.0 |
X-RAY |
2009-03-03 | GLU | B:518 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3gcx | 2 | Q8NBP7 | 99.63 | 0.0 |
X-RAY |
2009-03-03 | GLU | B:518 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3sqo | 1 | Q8NBP7 | 99.63 | 0.0 |
X-RAY |
2012-05-16 | GLU | A:518 | A:670 | 156.0 | 0.821 | 360.0 | 169.8 | 156.0 | 0.821 | 0.0 | |||||||
| 4ne9 | 1 | Q8NBP7 | 99.63 | 0.0 |
X-RAY |
2014-09-10 | GLU | A:518 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | B:518 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4k8r | 2 | Q8NBP7 | 99.63 | 0.0 |
X-RAY |
2013-05-08 | GLU | B:518 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 5vl7 | 2 | Q8NBP7 | 99.63 | 0.0 |
X-RAY |
2017-08-16 | GLU | B:518 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 2qtw | 2 | Q8NBP7 | 99.63 | 0.0 |
X-RAY |
2007-09-18 | GLU | B:518 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7kev | 2 | Q8NBP7 | 99.63 | 0.0 |
X-RAY |
2021-11-24 | GLU | B:518 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7kfa | 2 | Q8NBP7 | 99.63 | 0.0 |
X-RAY |
2021-11-10 | GLU | B:518 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3m0c | 2 | Q8NBP7 | 99.44 | 0.0 |
X-RAY |
2011-03-16 | GLU | B:518 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3h42 | 2 | Q8NBP7 | 99.26 | 0.0 |
X-RAY |
2009-05-05 | GLU | B:518 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 5oca | 2 | Q8NBP7 | 99.26 | 0.0 |
X-RAY |
2017-09-20 | GLU | B:518 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7anq | 1 | Q8NBP7 | 100.0 | 6e-167 |
X-RAY |
2021-10-20 | GLY | A:219 | A:670 | 48.0 | 0.64 | 72.5 | 177.5 | 48.0 | 0.64 | 0.0 | |||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-q8nbp7-f1 | 1 | Q8NBP7 | 100.0 | 0.0 | GLY | A:670 | A:670 | 51.0 | 0.68 | -68.9 | 147.8 | ||