Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr10 | 101180427 | . | G | A | CCDS7479.1:NM_002079.2:c.254tCt>tTt_NP_002070.1:p.85S>F | Homo sapiens glutamic-oxaloacetic transaminase 1 (GOT1), mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
3wzf | 1 | P17174 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-10-07 | SER | A:84 | A:84 | 5.0 | 0.043 | H | -59.6 | -41.8 | 5.0 | 0.043 | 0.0 | ||||||
6dnd | 1 | P17174 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2018-11-14 | SER | A:83 | A:85 | 4.0 | 0.035 | H | -62.6 | -38.8 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
7.436 |
N |
O |
||
SER | B:83 | B:85 | 4.0 | 0.035 | H | -62.0 | -39.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6lig | 1 | P17174 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-12-16 | SER | A:83 | A:85 | 4.0 | 0.035 | H | -66.7 | -36.0 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
7.288 |
O |
O |
||
SER | B:83 | B:85 | 4.0 | 0.035 | H | -74.9 | -31.0 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
6.439 |
N |
O |
|||||||||
6dnb | 1 | P17174 | 99.27 | 0.0 |
X-RAY |
2018-11-14 | SER | A:83 | A:85 | 3.0 | 0.026 | H | -63.4 | -42.4 | 3.0 | 0.026 | 0.0 |
PG4 HOH |
5.853 2.999 |
O OG |
O1 O |
||
6dna | 1 | P17174 | 99.75 | 0.0 |
X-RAY |
2018-11-14 | SER | A:80 | A:85 | 5.0 | 0.043 | H | -60.1 | -39.1 | 5.0 | 0.043 | 0.0 | ||||||
SER | B:80 | B:85 | 5.0 | 0.043 | H | -59.1 | -40.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | C:80 | C:85 | 4.0 | 0.035 | H | -60.4 | -39.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:80 | D:85 | 6.0 | 0.052 | H | -56.9 | -42.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | E:80 | E:85 | 4.0 | 0.035 | H | -60.1 | -39.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | F:80 | F:85 | 4.0 | 0.035 | H | -60.1 | -39.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3ii0 | 1 | P17174 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2009-08-11 | SER | A:73 | A:85 | 4.0 | 0.035 | H | -64.0 | -36.6 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
EDO HOH |
3.467 6.599 |
OG OG |
O2 O |
||
SER | B:73 | B:85 | 4.0 | 0.035 | H | -73.2 | -34.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | C:73 | C:85 | 4.0 | 0.035 | H | -59.3 | -34.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
SER | D:73 | D:85 | 4.0 | 0.035 | H | -62.4 | -39.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
5toq | 1 | P00503 | 92.01 | 0.0 |
X-RAY |
2017-03-01 | SER | A:86 | A:84 | 4.0 | 0.035 | H | -65.1 | -37.2 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
2.875 |
OG |
O |
||
SER | B:86 | B:84 | 5.0 | 0.043 | H | -65.4 | -35.8 | 5.0 | 0.043 | 0.0 |
HOH |
2.882 |
OG |
O |
|||||||||
5vk7 | 1 | P00503 | 92.01 | 0.0 |
X-RAY |
2017-11-01 | SER | A:86 | A:84 | 4.0 | 0.035 | H | -65.6 | -37.3 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
3.190 |
OG |
O |
||
SER | B:86 | B:84 | 4.0 | 0.035 | H | -62.7 | -42.5 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
3.221 |
OG |
O |
|||||||||
1ajr | 1 | P00503 | 91.99 | 0.0 |
X-RAY |
1997-08-20 | SER | A:84 | A:84 | 5.0 | 0.043 | H | -64.8 | -42.3 | 5.0 | 0.043 | 0.0 |
HOH |
2.987 |
OG |
O |
||
SER | B:84 | B:84 | 5.0 | 0.043 | H | -64.9 | -40.5 | 5.0 | 0.043 | 0.0 |
HOH |
2.957 |
OG |
O |
|||||||||
1ajs | 1 | P00503 | 91.99 | 0.0 |
X-RAY |
1997-08-20 | SER | A:84 | A:84 | 5.0 | 0.043 | H | -62.3 | -40.9 | 5.0 | 0.043 | 0.0 |
HOH |
2.933 |
OG |
O |
||
1ajs | 2 | P00503 | 91.99 | 0.0 |
X-RAY |
1997-08-20 | SER | B:84 | B:84 | 5.0 | 0.043 | H | -63.6 | -41.3 | 5.0 | 0.043 | 0.0 |
HOH |
2.985 |
OG |
O |
||
5vjz | 1 | P00503 | 91.99 | 0.0 |
NEUTRON DIFFRACTION X-RAY |
2017-11-01 | SER | A:84 | A:84 | 0.0 | 0.0 | H | -60.5 | -40.9 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | ||||||
5vjz | 2 | P00503 | 91.99 | 0.0 |
NEUTRON DIFFRACTION X-RAY |
2017-11-01 | SER | B:84 | B:84 | 0.0 | 0.0 | H | -64.1 | -39.7 | NA | NA | NA | ||||||
5tor | 1 | P00503 | 91.77 | 0.0 |
X-RAY |
2017-03-01 | SER | A:86 | A:84 | 4.0 | 0.035 | H | -66.3 | -36.1 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
2.919 |
OG |
O |
||
SER | B:86 | B:84 | 5.0 | 0.043 | H | -65.5 | -37.0 | 5.0 | 0.043 | 0.0 |
HOH |
3.036 |
OG |
O |
|||||||||
5ton | 1 | P00503 | 91.77 | 0.0 |
X-RAY |
2017-03-01 | SER | A:86 | A:84 | 4.0 | 0.035 | H | -64.8 | -36.5 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
2.882 |
OG |
O |
||
SER | B:86 | B:84 | 4.0 | 0.035 | H | -65.4 | -35.8 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
2.932 |
OG |
O |
|||||||||
5tot | 1 | P00503 | 91.53 | 0.0 |
X-RAY |
2017-03-01 | SER | A:86 | A:84 | 4.0 | 0.035 | H | -63.2 | -37.2 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
2.909 |
OG |
O |
||
SER | B:86 | B:84 | 5.0 | 0.043 | H | -64.8 | -33.7 | 5.0 | 0.043 | 0.0 |
HOH |
2.977 |
OG |
O |
|||||||||
2cst | 1 | P00504 | 80.44 | 0.0 |
X-RAY |
1994-11-30 | SER | A:83 | A:84 | 6.0 | 0.052 | H | -64.3 | -34.3 | 6.0 | 0.052 | 0.0 |
HOH |
4.440 |
CB |
O |
||
SER | B:83 | B:84 | 4.0 | 0.035 | H | -63.3 | -36.6 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
HOH |
3.524 |
OG |
O |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p17174-f1 | 1 | P17174 | 100.0 | 0.0 | SER | A:85 | A:85 | 4.0 | 0.035 | H | -62.4 | -39.0 |