Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr10 | 103340110 | . | G | A | CCDS7513.1:NM_001174084.1:c.1258Cgg>Tgg_NP_001167555.1:p.420R>W | Homo sapiens DNA polymerase lambda (POLL), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 4xq8 | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:179 | B:420 | 43.0 | 0.191 | T | -65.0 | -11.9 | 43.0 | 0.191 | 0.0 |
DA DC |
8.837 3.866 |
NH2 NH2 |
O3' O3' |
||
| ARG | B:179 | A:420 | 36.0 | 0.16 | T | -77.4 | 2.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5ca7 | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:179 | B:420 | 39.0 | 0.173 | T | -74.3 | -8.1 | 39.0 | 0.173 | 0.0 |
DA DC HOH |
8.988 3.598 4.453 |
NH1 NH1 NH2 |
O3' O3' O |
||
| ARG | B:179 | A:420 | 36.0 | 0.16 | T | -79.2 | 1.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5iii | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-08-17 | ARG | A:179 | A:420 | 35.0 | 0.156 | T | -77.1 | 4.9 | 35.0 | 0.156 | 0.0 |
DOC DTP MG HOH |
9.964 2.805 6.546 2.722 |
NH1 NH1 NH1 O |
C3' O2B MG O |
||
| 5iij | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-08-17 | ARG | A:179 | A:420 | 36.0 | 0.16 | T | -75.5 | 1.2 | 36.0 | 0.16 | 0.0 |
DOC DCT MG HOH |
9.913 2.748 6.604 2.750 |
NH1 NH1 NH1 O |
C3' O2B MG O |
||
| 5iik | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-08-17 | ARG | A:179 | A:420 | 35.0 | 0.156 | T | -77.8 | 0.7 | 35.0 | 0.156 | 0.0 |
DC DT CIT NA HOH |
9.176 3.643 2.663 6.291 2.851 |
NH1 NH1 NH1 NH1 NH2 |
O3' O3' O4 NA O |
||
| 5iil | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-08-17 | ARG | A:179 | A:420 | 39.0 | 0.173 | T | -79.9 | 1.5 | 39.0 | 0.173 | 0.0 |
DA DT CIT NA HOH |
9.153 3.638 2.799 6.239 2.874 |
NH1 NH1 NH1 NH1 NH2 |
O3' O3' O4 NA O |
||
| 5iim | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-09-07 | ARG | A:179 | A:420 | 39.0 | 0.173 | T | -77.2 | 1.2 | 39.0 | 0.173 | 0.0 |
DA DUP NA HOH |
9.811 2.828 6.490 4.246 |
NH1 NH1 NH1 NH2 |
C2' O1B NA O |
||
| 5iin | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-08-17 | ARG | A:179 | A:420 | 40.0 | 0.178 | T | -79.2 | 8.6 | 40.0 | 0.178 | 0.0 |
DC DUP MG HOH |
9.983 2.873 6.551 2.674 |
NH1 NH1 NH1 O |
C2' O2B MG O |
||
| 5iio | 4 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-08-17 | ARG | M:179 | A:420 | 34.0 | 0.151 | T | -78.5 | 3.2 | 34.0 | 0.151 | 0.0 |
HOH |
2.830 |
NH1 |
O |
||
| ARG | N:179 | E:420 | 36.0 | 0.16 | T | -82.4 | 5.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | O:179 | I:420 | 34.0 | 0.151 | T | -79.7 | 7.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | P:179 | M:420 | 36.0 | 0.16 | T | -80.5 | 5.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1xsl | 4 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2005-01-18 | ARG | M:180 | A:420 | 34.0 | 0.151 | T | -81.4 | 6.8 | 34.0 | 0.151 | 0.0 |
HOH |
2.646 |
NH2 |
O |
||
| ARG | N:180 | E:420 | 37.0 | 0.164 | T | -79.3 | 6.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | O:180 | I:420 | 33.0 | 0.147 | T | -79.4 | 14.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | P:180 | M:420 | 36.0 | 0.16 | T | -84.9 | 12.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2bcq | 4 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2006-03-07 | ARG | D:180 | A:420 | 35.0 | 0.156 | T | -76.4 | 0.6 | 35.0 | 0.156 | 0.0 |
DC DG MG PPV HOH |
9.204 3.422 6.476 2.842 2.645 |
NH1 NH1 NH1 NH1 O |
O3' O3' MG O32 O |
||
| 2bcr | 4 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2006-03-07 | ARG | D:180 | A:420 | 32.0 | 0.142 | T | -75.1 | 3.1 | 32.0 | 0.142 | 0.0 |
DC DG MG PPV HOH |
9.296 3.523 6.435 2.918 2.813 |
NH1 NH1 NH1 NH1 O |
O3' O3' MG O32 O |
||
| 2bcs | 4 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2006-03-07 | ARG | D:180 | A:420 | 37.0 | 0.164 | T | -76.9 | 1.4 | 37.0 | 0.164 | 0.0 |
DC DG MG PPV HOH |
9.204 3.427 6.302 2.807 3.688 |
NH1 NH1 NH1 NH2 NH2 |
O3' O3' MG O32 O |
||
| 2bcu | 4 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2006-03-07 | ARG | D:180 | A:420 | 37.0 | 0.164 | T | -76.7 | 2.5 | 37.0 | 0.164 | 0.0 |
DC DG NA PPV HOH |
9.213 3.464 6.283 2.900 2.615 |
NH1 NH1 NH1 NH1 O |
O3' O3' NA O32 O |
||
| 2bcv | 4 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2006-03-07 | ARG | D:180 | A:420 | 34.0 | 0.151 | T | -79.4 | 1.9 | 34.0 | 0.151 | 0.0 |
O2C MG NA TTP HOH |
9.954 6.718 9.115 3.032 2.946 |
NH1 NH1 NH1 NH1 O |
C3' MG NA O2B O |
||
| 2gws | 4 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2006-09-05 | ARG | M:180 | A:420 | 33.0 | 0.147 | T | -81.4 | 5.9 | 33.0 | 0.147 | 0.0 |
HOH |
2.792 |
NH2 |
O |
||
| ARG | N:180 | E:420 | 39.0 | 0.173 | T | -74.7 | 4.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | O:180 | I:420 | 34.0 | 0.151 | T | -82.2 | 15.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | P:180 | M:420 | 35.0 | 0.156 | T | -83.1 | 14.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4xrh | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:180 | B:420 | 35.0 | 0.156 | T | -77.2 | -1.2 | 35.0 | 0.156 | 0.0 |
DA DC |
8.518 3.557 |
NH2 NH2 |
O3' O3' |
||
| ARG | B:180 | A:420 | 35.0 | 0.156 | T | -78.0 | 3.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5ddm | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:180 | B:420 | 35.0 | 0.156 | H | -64.4 | -17.9 | 35.0 | 0.156 | 0.0 |
DA DC HOH |
8.961 3.881 6.437 |
NH2 NH2 CG |
O3' O3' O |
||
| ARG | B:180 | A:420 | 39.0 | 0.173 | T | -73.2 | 2.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5ddy | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:180 | A:420 | 38.0 | 0.169 | T | -74.7 | 2.4 | 38.0 | 0.169 | 0.0 |
MG MN DCP |
6.274 9.094 2.283 |
NH1 NH1 NH1 |
MG MN O1B |
||
| ARG | B:180 | C:420 | 41.0 | 0.182 | G | -71.4 | -5.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | C:180 | E:420 | 41.0 | 0.182 | T | -74.2 | -7.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | D:180 | G:420 | 37.0 | 0.164 | T | -70.2 | -12.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3c5g | 1 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2008-07-29 | ARG | A:180 | A:420 | 38.0 | 0.169 | T | -74.5 | 3.1 | 38.0 | 0.169 | 0.0 |
MG NA D3T HOH |
6.670 9.122 2.881 2.886 |
NH1 NH1 NH1 O |
MG NA O2B O |
||
| ARG | E:180 | B:420 | 34.0 | 0.151 | T | -77.4 | 5.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5chg | 1 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:179 | A:420 | 36.0 | 0.16 | T | -76.7 | -2.5 | 36.0 | 0.16 | 0.0 |
DA DC |
8.870 3.548 |
NH1 NH1 |
O3' O3' |
||
| ARG | B:179 | B:420 | 29.0 | 0.129 | T | -78.1 | 4.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5cj7 | 1 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:179 | A:420 | 38.0 | 0.169 | T | -75.8 | -8.7 | 38.0 | 0.169 | 0.0 |
DA DC |
8.938 3.500 |
NH1 NH1 |
O3' O3' |
||
| ARG | B:179 | B:420 | 33.0 | 0.147 | T | -73.1 | 9.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5cp2 | 1 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:179 | A:420 | 31.0 | 0.138 | T | -76.4 | 3.4 | 31.0 | 0.138 | 0.0 |
SO4 HOH |
4.511 3.263 |
NH2 NH2 |
O4 O |
||
| ARG | B:179 | B:420 | 39.0 | 0.173 | T | -73.2 | -3.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5cr0 | 1 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:179 | A:420 | 32.0 | 0.142 | H | -72.7 | -14.3 | 32.0 | 0.142 | 0.0 |
DA DC |
8.301 3.358 |
NH1 NH1 |
O3' O3' |
||
| ARG | B:179 | B:420 | 31.0 | 0.138 | T | -73.1 | -4.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3c5f | 4 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2008-09-02 | ARG | G:180 | A:420 | 35.0 | 0.156 | T | -80.3 | 10.5 | 35.0 | 0.156 | 0.0 |
HOH |
2.909 |
O |
O |
||
| ARG | H:180 | B:420 | 35.0 | 0.156 | T | -70.3 | 3.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1xsn | 4 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2005-01-18 | ARG | D:180 | A:420 | 35.0 | 0.156 | T | -76.1 | 1.9 | 35.0 | 0.156 | 0.0 |
2DT MG D3T HOH |
9.977 6.518 2.999 2.671 |
NH1 NH1 NH1 O |
C2' MG O2B O |
||
| 1xsp | 4 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2005-01-18 | ARG | D:180 | A:420 | 38.0 | 0.169 | T | -76.4 | 4.0 | 38.0 | 0.169 | 0.0 |
DC DG NA PPV HOH |
9.293 3.541 6.391 2.816 3.096 |
NH1 NH1 NH1 NH1 NH2 |
O3' O3' NA O32 O |
||
| 2pfn | 4 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2007-05-15 | ARG | D:180 | A:420 | 36.0 | 0.16 | T | -76.1 | 3.7 | 36.0 | 0.16 | 0.0 |
DC MG NA DUP HOH |
9.707 6.686 9.109 2.842 2.856 |
NH1 NH1 NH1 NH1 O |
C2' MG NA O1B O |
||
| 2pfo | 4 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2007-05-15 | ARG | D:180 | A:420 | 34.0 | 0.151 | T | -77.7 | 4.2 | 34.0 | 0.151 | 0.0 |
DC MG MN DUP HOH |
9.540 6.456 9.195 3.017 2.856 |
NH1 NH1 NH1 NH1 O |
O3' MG MN O1B O |
||
| 2pfp | 4 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2007-05-15 | ARG | D:180 | A:420 | 35.0 | 0.156 | T | -79.2 | -2.8 | 35.0 | 0.156 | 0.0 |
MG NA DCP HOH |
6.600 9.207 2.962 2.669 |
NH1 NH1 NH1 O |
MG NA O1B O |
||
| 2pfq | 4 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2007-05-15 | ARG | D:180 | A:420 | 33.0 | 0.147 | T | -84.5 | -1.2 | 33.0 | 0.147 | 0.0 |
DC DC MG NA MN MN DCP PPV HOH |
9.070 3.610 6.609 9.336 6.694 9.350 3.283 3.079 4.164 |
NH1 NH1 NH1 NH1 NH1 NH1 NH1 NH1 NH2 |
O3' O3' MG NA MN MN O1B O31 O |
||
| 3hw8 | 1 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2009-08-25 | ARG | A:180 | A:420 | 35.0 | 0.156 | T | -76.8 | 6.0 | 35.0 | 0.156 | 0.0 |
MG NA D3T HOH |
6.610 9.106 2.985 2.771 |
NH1 NH1 NH2 O |
MG NA O2B O |
||
| 3hwt | 1 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2009-08-25 | ARG | A:180 | A:420 | 36.0 | 0.16 | T | -79.0 | 3.8 | 36.0 | 0.16 | 0.0 |
2DT D3T MG HOH |
9.777 2.917 6.504 2.775 |
NH1 NH1 NH1 NH2 |
C2' O2B MG O |
||
| 1rzt | 4 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2004-03-02 | ARG | M:176 | A:420 | 34.0 | 0.151 | T | -79.0 | 6.5 | 34.0 | 0.151 | 0.0 |
HOH |
2.867 |
NH2 |
O |
||
| ARG | N:176 | E:420 | 36.0 | 0.16 | T | -78.1 | 5.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | O:176 | I:420 | 37.0 | 0.164 | T | -83.5 | 5.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | P:176 | M:420 | 34.0 | 0.151 | T | -82.4 | 10.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4k4g | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2014-07-16 | ARG | A:177 | A:420 | 40.0 | 0.178 | T | -82.4 | 7.9 | 40.0 | 0.178 | 0.0 |
DC 1S0 CA CA HOH |
9.028 2.885 6.665 8.919 2.859 |
NH1 NH2 NH1 NH1 NE |
O3' OAL CA CA O |
||
| ARG | E:177 | E:420 | 36.0 | 0.16 | T | -77.4 | 8.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | I:177 | I:420 | 36.0 | 0.16 | T | -86.8 | 2.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | M:177 | M:420 | 33.0 | 0.147 | T | -79.8 | 1.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4k4h | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2014-07-16 | ARG | A:177 | A:420 | 36.0 | 0.16 | T | -83.2 | 7.0 | 36.0 | 0.16 | 0.0 |
DC 1RZ CA CA HOH |
9.514 2.904 6.597 9.034 3.694 |
NH1 NH1 NH1 NH1 C |
O3' O1B CA CA O |
||
| ARG | E:177 | E:420 | 33.0 | 0.147 | T | -78.5 | 7.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | I:177 | I:420 | 30.0 | 0.133 | T | -86.5 | 3.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | M:177 | M:420 | 31.0 | 0.138 | T | -88.5 | 10.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4k4i | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2014-07-16 | ARG | A:177 | A:420 | 41.0 | 0.182 | T | -80.4 | 10.9 | 41.0 | 0.182 | 0.0 |
DC 1RY CA CA HOH |
9.615 2.912 6.510 8.940 3.025 |
NH1 NH2 NH1 NH1 NE |
O3' OAI CA CA O |
||
| ARG | E:177 | E:420 | 35.0 | 0.156 | T | -76.9 | 6.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | I:177 | I:420 | 34.0 | 0.151 | T | -85.1 | 5.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | M:177 | M:420 | 31.0 | 0.138 | T | -80.6 | 9.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3hx0 | 1 | Q9UGP5 | 98.8 | 0.0 |
X-RAY |
2009-08-25 | ARG | A:180 | A:420 | 39.0 | 0.173 | T | -72.9 | 0.5 | 39.0 | 0.173 | 0.0 |
D3T MG HOH |
2.770 6.699 6.671 |
NH2 NH1 NH1 |
O2B MG O |
||
| ARG | E:180 | F:420 | 41.0 | 0.182 | T | -75.7 | 11.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | I:180 | K:420 | 35.0 | 0.156 | T | -79.2 | -0.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ARG | M:180 | P:420 | 37.0 | 0.164 | T | -98.7 | 0.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5dkw | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:172 | A:420 | 35.0 | 0.156 | T | -91.3 | 8.4 | 35.0 | 0.156 | 0.0 |
DTP CA HOH |
3.057 6.925 3.379 |
NH1 NH1 NH2 |
O2B CA O |
||
| ARG | B:172 | B:420 | 36.0 | 0.16 | T | -84.2 | 1.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5cb1 | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:171 | A:420 | 22.0 | 0.098 | T | -76.8 | -3.3 | 22.0 | 0.098 | 0.0 | ||||||
| ARG | B:171 | B:420 | 34.0 | 0.151 | H | -67.6 | -27.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 4x5v | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-10-28 | ARG | A:170 | A:420 | 38.0 | 0.169 | T | -72.8 | -3.5 | 38.0 | 0.169 | 0.0 |
DC 8OG NA CIT HOH |
9.326 3.886 6.371 2.820 2.685 |
NH1 NH1 NH1 NH1 NH2 |
O3' O3' NA O3 O |
||
| 4xa5 | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-10 | ARG | A:170 | A:420 | 35.0 | 0.156 | T | -74.8 | 1.8 | 35.0 | 0.156 | 0.0 |
8DG MG ACT HOH |
2.964 6.910 8.832 2.673 |
NH1 NH1 C O |
O1B MG O O |
||
| 4xus | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-03 | ARG | A:170 | A:420 | 38.0 | 0.169 | T | -82.1 | 18.4 | 38.0 | 0.169 | 0.0 |
TTP MG DOC HOH |
2.856 6.632 9.999 4.298 |
NH1 NH1 NH1 NH2 |
O1B MG C3' O |
||
| 5cwr | 1 | Q9UGP5 | 99.69 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:171 | A:420 | 33.0 | 0.147 | T | -81.0 | 2.1 | 33.0 | 0.147 | 0.0 |
DC DCP CA CA HOH |
9.693 2.878 9.113 6.817 4.278 |
NH1 NH1 NH1 NH1 NH2 |
O3' O1B CA CA O |
||
| ARG | D:171 | B:420 | 25.0 | 0.111 | T | -78.0 | 3.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3mda | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2010-04-28 | ARG | A:170 | A:420 | 33.0 | 0.147 | T | -64.5 | -5.0 | 33.0 | 0.147 | 0.0 |
DC CAR PPV MG HOH |
9.233 3.593 2.892 6.525 2.984 |
NH1 NH1 NH1 NH1 NH2 |
O3' O3' O21 MG O |
||
| 3mdc | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2010-04-28 | ARG | A:170 | A:420 | 40.0 | 0.178 | T | -74.5 | -3.7 | 40.0 | 0.178 | 0.0 |
DC GTF MG MG HOH |
9.406 3.113 9.040 6.598 3.424 |
NH1 NH1 NH1 NH1 NH2 |
O3' O2B MG MG O |
||
| 3mgh | 1 | Q9UGP5 | 97.6 | 0.0 |
X-RAY |
2010-05-19 | ARG | A:179 | A:420 | 33.0 | 0.147 | T | -78.6 | 5.0 | 33.0 | 0.147 | 0.0 |
HOH |
3.027 |
O |
O |
||
| ARG | E:179 | C:420 | 33.0 | 0.147 | T | -81.3 | 4.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3mgi | 1 | Q9UGP5 | 97.6 | 0.0 |
X-RAY |
2010-05-19 | ARG | A:179 | A:420 | 34.0 | 0.151 | T | -76.4 | 6.7 | 34.0 | 0.151 | 0.0 |
DT D3T MG HOH |
9.882 2.665 6.908 2.771 |
NH1 NH1 NH1 O |
C2' O2B MG O |
||
| 3pml | 1 | Q9UGP5 | 97.6 | 0.0 |
X-RAY |
2011-01-26 | ARG | A:179 | A:420 | 33.0 | 0.147 | T | -77.5 | 5.0 | 33.0 | 0.147 | 0.0 |
DC 1GC MG MG HOH |
9.606 3.104 6.544 9.098 5.978 |
NH1 NH1 NH1 NH1 CD |
O3' O1B MG MG O |
||
| ARG | B:179 | B:420 | 34.0 | 0.151 | T | -84.9 | 14.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3pmn | 1 | Q9UGP5 | 97.6 | 0.0 |
X-RAY |
2011-02-02 | ARG | A:179 | A:420 | 39.0 | 0.173 | T | -83.6 | 5.2 | 39.0 | 0.173 | 0.0 |
DG 1GC MG MN HOH |
9.464 3.105 6.591 9.206 4.098 |
NH1 NH1 NH1 NH1 NH2 |
O3' O1B MG MN O |
||
| 3pnc | 1 | Q9UGP5 | 97.6 | 0.0 |
X-RAY |
2011-02-02 | ARG | A:179 | A:420 | 39.0 | 0.173 | T | -80.6 | 7.1 | 39.0 | 0.173 | 0.0 |
DG 1GC MG NA TRS HOH |
9.670 3.076 6.526 9.032 8.810 3.245 |
NH1 NH1 NH1 NH1 NH2 NH2 |
C2' O1B MG NA O1 O |
||
| 3upq | 1 | Q9UGP5 | 97.6 | 0.0 |
X-RAY |
2012-05-23 | ARG | A:179 | A:420 | 35.0 | 0.156 | T | -73.6 | 5.2 | 35.0 | 0.156 | 0.0 |
DC ZAN MN MN SO4 HOH |
9.272 2.731 6.406 9.013 6.587 3.890 |
NH1 NH1 NH1 NH1 N NH2 |
O3' O2B MN MN O4 O |
||
| 3uq0 | 1 | Q9UGP5 | 97.6 | 0.0 |
X-RAY |
2012-05-23 | ARG | A:179 | A:420 | 32.0 | 0.142 | T | -76.4 | 6.7 | 32.0 | 0.142 | 0.0 |
A SO4 CL HOH |
4.195 4.476 7.817 2.806 |
NH1 NH2 N NH1 |
O2' O2 CL O |
||
| 3uq2 | 1 | Q9UGP5 | 97.31 | 0.0 |
X-RAY |
2012-05-23 | ARG | A:179 | A:420 | 30.0 | 0.133 | T | -82.2 | -0.3 | 30.0 | 0.133 | 0.0 |
C DA PPV MG HOH |
9.042 3.396 2.671 6.233 3.943 |
NH1 NH1 NH2 NH1 NH2 |
O3' O3' O21 MG O |
||
| 4fo6 | 1 | Q9UGP5 | 97.31 | 0.0 |
X-RAY |
2012-07-11 | ARG | A:179 | A:420 | 36.0 | 0.16 | T | -80.8 | -0.6 | 36.0 | 0.16 | 0.0 |
C MG MN F2A HOH |
9.153 6.567 9.116 2.975 4.212 |
NH1 NH1 NH1 NH1 NH2 |
O3' MG MN O1B O |
||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-q9ugp5-f1 | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 | ARG | A:420 | A:420 | 38.0 | 0.169 | T | -78.5 | 8.8 | |