Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr10 103343363 . G A CCDS7513.1:NM_001174084.1:c.967Cgg>Tgg_NP_001167555.1:p.323R>W Homo sapiens DNA polymerase lambda (POLL), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id
alphafold_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
4xq8 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2016-02-24 ARG A:82 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:82 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5ca7 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2016-02-24 ARG A:82 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:82 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5iii 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2016-08-17 ARG A:82 A:323 46.0 NA G -57.9 -31.7 46.0 NA NA HOH
7.853
O
O
5iij 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2016-08-17 ARG A:82 A:323 42.0 NA G -59.2 -29.2 42.0 NA NA HOH
3.167
N
O
5iik 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2016-08-17 ARG A:82 A:323 44.0 NA G -63.0 -34.2 44.0 NA NA HOH
3.288
N
O
5iil 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2016-08-17 ARG A:82 A:323 161.0 0.716 H -56.2 -40.7 161.0 0.716 0.0 HOH
3.556
CB
O
5iim 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2016-09-07 ARG A:82 A:323 53.0 NA G -53.1 -38.3 53.0 NA NA HOH
4.422
N
O
5iin 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2016-08-17 ARG A:82 A:323 45.0 NA G -54.2 -38.7 45.0 NA NA HOH
6.662
O
O
5iio 4 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2016-08-17 ARG M:82 A:323 162.0 0.72 G -61.1 -33.3 162.0 0.72 0.0 HOH
3.438
N
O
ARG N:82 E:323 158.0 0.702 G -59.9 -25.4 NA NA NA
ARG O:82 I:323 155.0 0.689 G -59.9 -33.4 NA NA NA
ARG P:82 M:323 162.0 0.72 G -61.5 -31.2 NA NA NA
1xsl 4 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2005-01-18 ARG M:83 A:323 152.0 0.676 H -49.7 -42.7 152.0 0.676 0.0 HOH
3.436
N
O
ARG N:83 E:323 50.0 NA H -39.7 -43.0 NA NA NA
ARG O:83 I:323 44.0 NA G -30.4 -61.7 NA NA NA
ARG P:83 M:323 168.0 0.747 G -40.5 -45.6 NA NA NA
2bcq 4 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2006-03-07 ARG D:83 A:323 156.0 0.693 G -47.3 -27.7 156.0 0.693 0.0 HOH
3.469
N
O
2bcr 4 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2006-03-07 ARG D:83 A:323 46.0 NA G -50.8 -32.0 46.0 NA NA HOH
3.343
N
O
2bcs 4 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2006-03-07 ARG D:83 A:323 49.0 NA G -73.3 -5.6 49.0 NA NA
2bcu 4 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2006-03-07 ARG D:83 A:323 55.0 NA G -43.5 -31.6 55.0 NA NA HOH
5.652
N
O
2bcv 4 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2006-03-07 ARG D:83 A:323 56.0 NA G -51.6 -30.9 56.0 NA NA HOH
3.314
CB
O
2gws 4 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2006-09-05 ARG M:83 A:323 54.0 NA G -47.7 -36.7 54.0 NA NA HOH
5.208
N
O
ARG N:83 E:323 70.0 NA T -75.4 -17.9 NA NA NA
ARG O:83 I:323 49.0 NA G -33.1 -42.1 NA NA NA
ARG P:83 M:323 169.0 0.751 G -47.1 -30.9 NA NA NA
4xrh 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2016-02-24 ARG A:83 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:83 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5ddm 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2016-02-24 ARG A:83 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:83 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5ddy 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2016-02-24 ARG A:83 A:323 77.0 NA 57.3 22.9 77.0 NA NA
ARG B:83 C:323 37.0 NA -67.2 136.8 NA NA NA
ARG C:83 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG D:83 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3c5g 1 Q9UGP5 99.7 0.0 X-RAY
2008-07-29 ARG A:83 A:323 160.0 0.711 G -50.2 -32.9 160.0 0.711 0.0 HOH
3.411
N
O
ARG E:83 B:323 165.0 0.733 G -51.6 -34.4 NA NA NA
5chg 1 Q9UGP5 99.7 0.0 X-RAY
2016-02-24 ARG A:82 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:82 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5cj7 1 Q9UGP5 99.7 0.0 X-RAY
2016-02-24 ARG A:82 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:82 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5cp2 1 Q9UGP5 99.7 0.0 X-RAY
2016-02-24 ARG A:82 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:82 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5cr0 1 Q9UGP5 99.7 0.0 X-RAY
2016-02-24 ARG A:82 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ARG B:82 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3c5f 4 Q9UGP5 99.7 0.0 X-RAY
2008-09-02 ARG G:83 A:323 162.0 0.72 G -50.9 -41.3 162.0 0.72 0.0 HOH
3.453
N
O
ARG H:83 B:323 176.0 0.782 G -52.6 -44.8 NA NA NA
1xsn 4 Q9UGP5 99.7 0.0 X-RAY
2005-01-18 ARG D:83 A:323 47.0 NA G -62.5 -20.1 47.0 NA NA
1xsp 4 Q9UGP5 99.7 0.0 X-RAY
2005-01-18 ARG D:83 A:323 48.0 NA G -51.9 -21.7 48.0 NA NA HOH
5.747
N
O
2pfn 4 Q9UGP5 99.7 0.0 X-RAY
2007-05-15 ARG D:83 A:323 47.0 NA G -52.3 -26.0 47.0 NA NA HOH
3.165
N
O
2pfo 4 Q9UGP5 99.7 0.0 X-RAY
2007-05-15 ARG D:83 A:323 45.0 NA G -53.4 -55.7 45.0 NA NA HOH
7.378
O
O
2pfp 4 Q9UGP5 99.7 0.0 X-RAY
2007-05-15 ARG D:83 A:323 44.0 NA G -43.9 -43.9 44.0 NA NA HOH
3.132
CB
O
2pfq 4 Q9UGP5 99.7 0.0 X-RAY
2007-05-15 ARG D:83 A:323 165.0 0.733 H -41.9 -48.3 165.0 0.733 0.0 DG
HOH
7.506
2.524
NH2
NH2
OP3
O
3hw8 1 Q9UGP5 99.7 0.0 X-RAY
2009-08-25 ARG A:83 A:323 47.0 NA G -63.4 -11.4 47.0 NA NA
3hwt 1 Q9UGP5 99.7 0.0 X-RAY
2009-08-25 ARG A:83 A:323 66.0 NA G -48.9 -33.8 66.0 NA NA
1rzt 4 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2004-03-02 ARG M:79 A:323 137.0 0.609 G -56.2 -31.1 137.0 0.609 0.0 NA
HOH
9.220
3.857
O
CG
NA
O
ARG N:79 E:323 44.0 NA G -38.7 -40.2 NA NA NA
ARG O:79 I:323 39.0 NA G -25.4 -42.9 NA NA NA
ARG P:79 M:323 161.0 0.716 G -44.2 -33.0 NA NA NA
4k4g 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2014-07-16 ARG A:80 A:323 163.0 0.724 G -60.1 -45.9 163.0 0.724 0.0 HOH
3.171
CB
O
ARG E:80 E:323 153.0 0.68 G -48.5 -42.1 NA NA NA
ARG I:80 I:323 191.0 0.849 S -82.3 -43.8 NA NA NA
ARG M:80 M:323 165.0 0.733 G -60.1 -27.7 NA NA NA
4k4h 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2014-07-16 ARG A:80 A:323 159.0 0.707 G -45.4 -46.9 159.0 0.707 0.0 HOH
3.276
CB
O
ARG E:80 E:323 167.0 0.742 G -47.4 -44.6 NA NA NA
ARG I:80 I:323 169.0 0.751 G -71.2 -38.6 NA NA NA
ARG M:80 M:323 160.0 0.711 G -67.2 -14.1 NA NA NA
4k4i 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2014-07-16 ARG A:80 A:323 164.0 0.729 G -40.0 -48.6 164.0 0.729 0.0 HOH
3.520
N
O
ARG E:80 E:323 148.0 0.658 G -59.4 -41.5 NA NA NA
ARG I:80 I:323 179.0 0.796 G -74.9 -33.0 NA NA NA
ARG M:80 M:323 166.0 0.738 G -61.3 -22.5 NA NA NA
3hx0 1 Q9UGP5 98.8 0.0 X-RAY
2009-08-25 ARG A:83 A:323 44.0 NA S -75.1 -36.9 44.0 NA NA HOH
9.737
O
O
ARG E:83 F:323 36.0 NA H -63.0 -48.1 NA NA NA
ARG I:83 K:323 41.0 NA G -36.7 -33.7 NA NA NA
ARG M:83 P:323 50.0 NA H -28.9 -46.9 NA NA NA
5dkw 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2016-02-24 ARG A:75 A:323 167.0 0.742 G -64.6 -35.3 167.0 0.742 0.0 HOH
6.237
N
O
ARG B:75 B:323 157.0 0.698 G -56.9 -26.3 NA NA NA
5cb1 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2016-02-24 ARG A:74 A:323 119.0 0.529 70.7 10.9 119.0 0.529 0.0
ARG B:74 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4x5v 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2015-10-28 ARG A:73 A:323 39.0 NA H -71.2 -27.5 39.0 NA NA DG
9.670
C
OP3
4xa5 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2016-02-10 ARG A:73 A:323 43.0 NA G -57.5 -38.5 43.0 NA NA ACT
HOH
9.641
3.261
O
N
CH3
O
4xus 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2016-02-03 ARG A:73 A:323 43.0 NA G -57.9 -36.2 43.0 NA NA HOH
4.908
CB
O
5cwr 1 Q9UGP5 99.69 0.0 X-RAY
2016-02-24 ARG A:74 A:323 162.0 0.72 G -59.1 -34.5 162.0 0.72 0.0 HOH
3.571
N
O
ARG D:74 B:323 162.0 0.72 G -60.6 -32.1 NA NA NA
3mda 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2010-04-28 ARG A:73 A:323 155.0 0.689 G -60.3 -24.8 155.0 0.689 0.0 HOH
3.119
N
O
3mdc 1 Q9UGP5 100.0 0.0 X-RAY
2010-04-28 ARG A:73 A:323 40.0 NA G -50.4 -29.4 40.0 NA NA DG
HOH
9.871
3.774
C
CB
OP3
O
3mgh 1 Q9UGP5 97.6 0.0 X-RAY
2010-05-19 ARG A:82 A:323 184.0 0.818 G -52.2 -39.0 184.0 0.818 0.0 HOH
3.469
N
O
ARG E:82 C:323 164.0 0.729 G -68.6 -31.4 NA NA NA
3mgi 1 Q9UGP5 97.6 0.0 X-RAY
2010-05-19 ARG A:82 A:323 51.0 NA H -49.7 -40.5 51.0 NA NA
3pml 1 Q9UGP5 97.6 0.0 X-RAY
2011-01-26 ARG A:82 A:323 183.0 0.813 G -44.9 -46.9 183.0 0.813 0.0
ARG B:82 B:323 176.0 0.782 G -42.4 -31.3 NA NA NA
3pmn 1 Q9UGP5 97.6 0.0 X-RAY
2011-02-02 ARG A:82 A:323 45.0 NA G -42.2 -33.1 45.0 NA NA HOH
5.470
N
O
3pnc 1 Q9UGP5 97.6 0.0 X-RAY
2011-02-02 ARG A:82 A:323 41.0 NA G -44.0 -33.6 41.0 NA NA HOH
3.042
CB
O
3upq 1 Q9UGP5 97.6 0.0 X-RAY
2012-05-23 ARG A:82 A:323 46.0 NA G -69.9 -36.4 46.0 NA NA
3uq0 1 Q9UGP5 97.6 0.0 X-RAY
2012-05-23 ARG A:82 A:323 47.0 NA G -62.7 -21.5 47.0 NA NA HOH
9.083
O
O
3uq2 1 Q9UGP5 97.31 0.0 X-RAY
2012-05-23 ARG A:82 A:323 55.0 NA G -62.0 -33.7 55.0 NA NA DG
HOH
9.802
8.665
C
O
OP3
O
4fo6 1 Q9UGP5 97.31 0.0 X-RAY
2012-07-11 ARG A:82 A:323 59.0 NA H -57.3 -34.0 59.0 NA NA DG
HOH
9.972
3.561
C
N
OP1
O

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-q9ugp5-f1 1 Q9UGP5 100.0 0.0 ARG A:323 A:323 169.0 0.751 T -55.6 -25.2