Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr10 | 103343363 | . | G | A | CCDS7513.1:NM_001174084.1:c.967Cgg>Tgg_NP_001167555.1:p.323R>W | Homo sapiens DNA polymerase lambda (POLL), transcript variant 1, mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
4xq8 | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:82 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ARG | B:82 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5ca7 | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:82 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ARG | B:82 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5iii | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-08-17 | ARG | A:82 | A:323 | 46.0 | NA | G | -57.9 | -31.7 | 46.0 | NA | NA |
HOH |
7.853 |
O |
O |
||
5iij | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-08-17 | ARG | A:82 | A:323 | 42.0 | NA | G | -59.2 | -29.2 | 42.0 | NA | NA |
HOH |
3.167 |
N |
O |
||
5iik | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-08-17 | ARG | A:82 | A:323 | 44.0 | NA | G | -63.0 | -34.2 | 44.0 | NA | NA |
HOH |
3.288 |
N |
O |
||
5iil | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-08-17 | ARG | A:82 | A:323 | 161.0 | 0.716 | H | -56.2 | -40.7 | 161.0 | 0.716 | 0.0 |
HOH |
3.556 |
CB |
O |
||
5iim | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-09-07 | ARG | A:82 | A:323 | 53.0 | NA | G | -53.1 | -38.3 | 53.0 | NA | NA |
HOH |
4.422 |
N |
O |
||
5iin | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-08-17 | ARG | A:82 | A:323 | 45.0 | NA | G | -54.2 | -38.7 | 45.0 | NA | NA |
HOH |
6.662 |
O |
O |
||
5iio | 4 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-08-17 | ARG | M:82 | A:323 | 162.0 | 0.72 | G | -61.1 | -33.3 | 162.0 | 0.72 | 0.0 |
HOH |
3.438 |
N |
O |
||
ARG | N:82 | E:323 | 158.0 | 0.702 | G | -59.9 | -25.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | O:82 | I:323 | 155.0 | 0.689 | G | -59.9 | -33.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | P:82 | M:323 | 162.0 | 0.72 | G | -61.5 | -31.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1xsl | 4 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2005-01-18 | ARG | M:83 | A:323 | 152.0 | 0.676 | H | -49.7 | -42.7 | 152.0 | 0.676 | 0.0 |
HOH |
3.436 |
N |
O |
||
ARG | N:83 | E:323 | 50.0 | NA | H | -39.7 | -43.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | O:83 | I:323 | 44.0 | NA | G | -30.4 | -61.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | P:83 | M:323 | 168.0 | 0.747 | G | -40.5 | -45.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2bcq | 4 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2006-03-07 | ARG | D:83 | A:323 | 156.0 | 0.693 | G | -47.3 | -27.7 | 156.0 | 0.693 | 0.0 |
HOH |
3.469 |
N |
O |
||
2bcr | 4 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2006-03-07 | ARG | D:83 | A:323 | 46.0 | NA | G | -50.8 | -32.0 | 46.0 | NA | NA |
HOH |
3.343 |
N |
O |
||
2bcs | 4 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2006-03-07 | ARG | D:83 | A:323 | 49.0 | NA | G | -73.3 | -5.6 | 49.0 | NA | NA | ||||||
2bcu | 4 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2006-03-07 | ARG | D:83 | A:323 | 55.0 | NA | G | -43.5 | -31.6 | 55.0 | NA | NA |
HOH |
5.652 |
N |
O |
||
2bcv | 4 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2006-03-07 | ARG | D:83 | A:323 | 56.0 | NA | G | -51.6 | -30.9 | 56.0 | NA | NA |
HOH |
3.314 |
CB |
O |
||
2gws | 4 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2006-09-05 | ARG | M:83 | A:323 | 54.0 | NA | G | -47.7 | -36.7 | 54.0 | NA | NA |
HOH |
5.208 |
N |
O |
||
ARG | N:83 | E:323 | 70.0 | NA | T | -75.4 | -17.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | O:83 | I:323 | 49.0 | NA | G | -33.1 | -42.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | P:83 | M:323 | 169.0 | 0.751 | G | -47.1 | -30.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4xrh | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:83 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ARG | B:83 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5ddm | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:83 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ARG | B:83 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5ddy | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:83 | A:323 | 77.0 | NA | 57.3 | 22.9 | 77.0 | NA | NA | |||||||
ARG | B:83 | C:323 | 37.0 | NA | -67.2 | 136.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ARG | C:83 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | D:83 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
3c5g | 1 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2008-07-29 | ARG | A:83 | A:323 | 160.0 | 0.711 | G | -50.2 | -32.9 | 160.0 | 0.711 | 0.0 |
HOH |
3.411 |
N |
O |
||
ARG | E:83 | B:323 | 165.0 | 0.733 | G | -51.6 | -34.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
5chg | 1 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:82 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ARG | B:82 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5cj7 | 1 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:82 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ARG | B:82 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5cp2 | 1 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:82 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ARG | B:82 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
5cr0 | 1 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:82 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
ARG | B:82 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
3c5f | 4 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2008-09-02 | ARG | G:83 | A:323 | 162.0 | 0.72 | G | -50.9 | -41.3 | 162.0 | 0.72 | 0.0 |
HOH |
3.453 |
N |
O |
||
ARG | H:83 | B:323 | 176.0 | 0.782 | G | -52.6 | -44.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
1xsn | 4 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2005-01-18 | ARG | D:83 | A:323 | 47.0 | NA | G | -62.5 | -20.1 | 47.0 | NA | NA | ||||||
1xsp | 4 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2005-01-18 | ARG | D:83 | A:323 | 48.0 | NA | G | -51.9 | -21.7 | 48.0 | NA | NA |
HOH |
5.747 |
N |
O |
||
2pfn | 4 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2007-05-15 | ARG | D:83 | A:323 | 47.0 | NA | G | -52.3 | -26.0 | 47.0 | NA | NA |
HOH |
3.165 |
N |
O |
||
2pfo | 4 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2007-05-15 | ARG | D:83 | A:323 | 45.0 | NA | G | -53.4 | -55.7 | 45.0 | NA | NA |
HOH |
7.378 |
O |
O |
||
2pfp | 4 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2007-05-15 | ARG | D:83 | A:323 | 44.0 | NA | G | -43.9 | -43.9 | 44.0 | NA | NA |
HOH |
3.132 |
CB |
O |
||
2pfq | 4 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2007-05-15 | ARG | D:83 | A:323 | 165.0 | 0.733 | H | -41.9 | -48.3 | 165.0 | 0.733 | 0.0 |
DG HOH |
7.506 2.524 |
NH2 NH2 |
OP3 O |
||
3hw8 | 1 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2009-08-25 | ARG | A:83 | A:323 | 47.0 | NA | G | -63.4 | -11.4 | 47.0 | NA | NA | ||||||
3hwt | 1 | Q9UGP5 | 99.7 | 0.0 |
X-RAY |
2009-08-25 | ARG | A:83 | A:323 | 66.0 | NA | G | -48.9 | -33.8 | 66.0 | NA | NA | ||||||
1rzt | 4 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2004-03-02 | ARG | M:79 | A:323 | 137.0 | 0.609 | G | -56.2 | -31.1 | 137.0 | 0.609 | 0.0 |
NA HOH |
9.220 3.857 |
O CG |
NA O |
||
ARG | N:79 | E:323 | 44.0 | NA | G | -38.7 | -40.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | O:79 | I:323 | 39.0 | NA | G | -25.4 | -42.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | P:79 | M:323 | 161.0 | 0.716 | G | -44.2 | -33.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4k4g | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2014-07-16 | ARG | A:80 | A:323 | 163.0 | 0.724 | G | -60.1 | -45.9 | 163.0 | 0.724 | 0.0 |
HOH |
3.171 |
CB |
O |
||
ARG | E:80 | E:323 | 153.0 | 0.68 | G | -48.5 | -42.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | I:80 | I:323 | 191.0 | 0.849 | S | -82.3 | -43.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | M:80 | M:323 | 165.0 | 0.733 | G | -60.1 | -27.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4k4h | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2014-07-16 | ARG | A:80 | A:323 | 159.0 | 0.707 | G | -45.4 | -46.9 | 159.0 | 0.707 | 0.0 |
HOH |
3.276 |
CB |
O |
||
ARG | E:80 | E:323 | 167.0 | 0.742 | G | -47.4 | -44.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | I:80 | I:323 | 169.0 | 0.751 | G | -71.2 | -38.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | M:80 | M:323 | 160.0 | 0.711 | G | -67.2 | -14.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
4k4i | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2014-07-16 | ARG | A:80 | A:323 | 164.0 | 0.729 | G | -40.0 | -48.6 | 164.0 | 0.729 | 0.0 |
HOH |
3.520 |
N |
O |
||
ARG | E:80 | E:323 | 148.0 | 0.658 | G | -59.4 | -41.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | I:80 | I:323 | 179.0 | 0.796 | G | -74.9 | -33.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | M:80 | M:323 | 166.0 | 0.738 | G | -61.3 | -22.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3hx0 | 1 | Q9UGP5 | 98.8 | 0.0 |
X-RAY |
2009-08-25 | ARG | A:83 | A:323 | 44.0 | NA | S | -75.1 | -36.9 | 44.0 | NA | NA |
HOH |
9.737 |
O |
O |
||
ARG | E:83 | F:323 | 36.0 | NA | H | -63.0 | -48.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | I:83 | K:323 | 41.0 | NA | G | -36.7 | -33.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ARG | M:83 | P:323 | 50.0 | NA | H | -28.9 | -46.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
5dkw | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:75 | A:323 | 167.0 | 0.742 | G | -64.6 | -35.3 | 167.0 | 0.742 | 0.0 |
HOH |
6.237 |
N |
O |
||
ARG | B:75 | B:323 | 157.0 | 0.698 | G | -56.9 | -26.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
5cb1 | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:74 | A:323 | 119.0 | 0.529 | 70.7 | 10.9 | 119.0 | 0.529 | 0.0 | |||||||
ARG | B:74 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
4x5v | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-10-28 | ARG | A:73 | A:323 | 39.0 | NA | H | -71.2 | -27.5 | 39.0 | NA | NA |
DG |
9.670 |
C |
OP3 |
||
4xa5 | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-10 | ARG | A:73 | A:323 | 43.0 | NA | G | -57.5 | -38.5 | 43.0 | NA | NA |
ACT HOH |
9.641 3.261 |
O N |
CH3 O |
||
4xus | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-03 | ARG | A:73 | A:323 | 43.0 | NA | G | -57.9 | -36.2 | 43.0 | NA | NA |
HOH |
4.908 |
CB |
O |
||
5cwr | 1 | Q9UGP5 | 99.69 | 0.0 |
X-RAY |
2016-02-24 | ARG | A:74 | A:323 | 162.0 | 0.72 | G | -59.1 | -34.5 | 162.0 | 0.72 | 0.0 |
HOH |
3.571 |
N |
O |
||
ARG | D:74 | B:323 | 162.0 | 0.72 | G | -60.6 | -32.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3mda | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2010-04-28 | ARG | A:73 | A:323 | 155.0 | 0.689 | G | -60.3 | -24.8 | 155.0 | 0.689 | 0.0 |
HOH |
3.119 |
N |
O |
||
3mdc | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2010-04-28 | ARG | A:73 | A:323 | 40.0 | NA | G | -50.4 | -29.4 | 40.0 | NA | NA |
DG HOH |
9.871 3.774 |
C CB |
OP3 O |
||
3mgh | 1 | Q9UGP5 | 97.6 | 0.0 |
X-RAY |
2010-05-19 | ARG | A:82 | A:323 | 184.0 | 0.818 | G | -52.2 | -39.0 | 184.0 | 0.818 | 0.0 |
HOH |
3.469 |
N |
O |
||
ARG | E:82 | C:323 | 164.0 | 0.729 | G | -68.6 | -31.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3mgi | 1 | Q9UGP5 | 97.6 | 0.0 |
X-RAY |
2010-05-19 | ARG | A:82 | A:323 | 51.0 | NA | H | -49.7 | -40.5 | 51.0 | NA | NA | ||||||
3pml | 1 | Q9UGP5 | 97.6 | 0.0 |
X-RAY |
2011-01-26 | ARG | A:82 | A:323 | 183.0 | 0.813 | G | -44.9 | -46.9 | 183.0 | 0.813 | 0.0 | ||||||
ARG | B:82 | B:323 | 176.0 | 0.782 | G | -42.4 | -31.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3pmn | 1 | Q9UGP5 | 97.6 | 0.0 |
X-RAY |
2011-02-02 | ARG | A:82 | A:323 | 45.0 | NA | G | -42.2 | -33.1 | 45.0 | NA | NA |
HOH |
5.470 |
N |
O |
||
3pnc | 1 | Q9UGP5 | 97.6 | 0.0 |
X-RAY |
2011-02-02 | ARG | A:82 | A:323 | 41.0 | NA | G | -44.0 | -33.6 | 41.0 | NA | NA |
HOH |
3.042 |
CB |
O |
||
3upq | 1 | Q9UGP5 | 97.6 | 0.0 |
X-RAY |
2012-05-23 | ARG | A:82 | A:323 | 46.0 | NA | G | -69.9 | -36.4 | 46.0 | NA | NA | ||||||
3uq0 | 1 | Q9UGP5 | 97.6 | 0.0 |
X-RAY |
2012-05-23 | ARG | A:82 | A:323 | 47.0 | NA | G | -62.7 | -21.5 | 47.0 | NA | NA |
HOH |
9.083 |
O |
O |
||
3uq2 | 1 | Q9UGP5 | 97.31 | 0.0 |
X-RAY |
2012-05-23 | ARG | A:82 | A:323 | 55.0 | NA | G | -62.0 | -33.7 | 55.0 | NA | NA |
DG HOH |
9.802 8.665 |
C O |
OP3 O |
||
4fo6 | 1 | Q9UGP5 | 97.31 | 0.0 |
X-RAY |
2012-07-11 | ARG | A:82 | A:323 | 59.0 | NA | H | -57.3 | -34.0 | 59.0 | NA | NA |
DG HOH |
9.972 3.561 |
C N |
OP1 O |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-q9ugp5-f1 | 1 | Q9UGP5 | 100.0 | 0.0 | ARG | A:323 | A:323 | 169.0 | 0.751 | T | -55.6 | -25.2 |