Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr10 | 131565170 | . | A | C | CCDS7660.2:NM_002412.3:c.626aAg>aCg_NP_002403.2:p.209K>T | Homo sapiens O-6-methylguanine-DNA methyltransferase (MGMT), mRNA. |
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PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 1eh6 | 1 | P16455 | 100.0 | 5e-151 |
X-RAY |
2000-04-12 | LYS | A:178 | A:178 | 107.0 | 0.535 | -72.4 | 112.9 | 107.0 | 0.535 | 0.0 |
HOH |
4.456 |
NZ |
O |
|||
| 1eh7 | 1 | P16455 | 100.0 | 5e-151 |
X-RAY |
2000-04-12 | LYS | A:178 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 1eh8 | 1 | P16455 | 100.0 | 5e-151 |
X-RAY |
2000-04-12 | LYS | A:178 | A:178 | 108.0 | 0.54 | -71.4 | 103.5 | 108.0 | 0.54 | 0.0 |
HOH |
2.792 |
O |
O |
|||
| 1yfh | 3 | P16455 | 100.0 | 1e-130 |
X-RAY |
2005-12-13 | LYS | E:178 | A:178 | 158.0 | 0.79 | B | -111.3 | 74.5 | NA | NA | NA | ||||||
| LYS | F:178 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| LYS | G:178 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3kzy | 1 | ? | 89.27 | 9e-112 |
X-RAY |
2010-12-15 | LYS | A:181 | A:178 | 138.0 | 0.69 | -150.9 | 128.8 | 138.0 | 0.69 | 0.0 |
HOH |
2.762 |
NZ |
O |
|||
| LYS | B:181 | B:178 | 137.0 | 0.685 | -156.0 | 129.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 3l00 | 1 | ? | 89.27 | 9e-112 |
X-RAY |
2010-12-15 | LYS | A:181 | A:178 | 128.0 | 0.64 | -144.7 | 128.6 | 128.0 | 0.64 | 0.0 |
HOH |
2.683 |
O |
O |
|||
| 6sc2 | 2 | E5BBQ0,B0I1S0 | 89.07 | 4e-111 |
EM |
2019-09-04 | LYS | B:178 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6sc2 | 1 | E5BBQ0,B0I1S0 | 89.07 | 4e-111 |
EM |
2019-09-04 | LYS | A:178 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6rla | 1 | E5BBQ0,B0I1S0 | 89.07 | 4e-111 |
EM |
2019-08-28 | LYS | A:178 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| LYS | B:178 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6rlb | 1 | E5BBQ0,B0I1S0 | 89.07 | 4e-111 |
EM |
2019-08-28 | LYS | A:178 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| LYS | B:178 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3kzz | 1 | ? | 88.7 | 7e-111 |
X-RAY |
2010-12-15 | LYS | A:181 | A:178 | 125.0 | 0.625 | -147.3 | 122.2 | 125.0 | 0.625 | 0.0 |
HOH |
2.784 |
O |
O |
|||
| 6y8p | 1 | E5BBQ0 | 89.14 | 4e-110 |
X-RAY |
2021-03-31 | LYS | A:176 | A:178 | 134.0 | 0.67 | -148.2 | 104.7 | 134.0 | 0.67 | 0.0 |
HOH |
2.508 |
O |
O |
|||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p16455-f1 | 1 | P16455 | 100.0 | 2e-151 | LYS | A:178 | A:178 | 113.0 | 0.565 | -131.2 | 126.4 | ||