Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr10 | 93041 | . | C | A | CCDS7051.1:NM_177987.2:c.1291Gag>Tag_NP_817124.1:p.431E>* | Homo sapiens tubulin beta 8 class VIII (TUBB8), mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 6xer | 2 | A0A287AGU7 | 89.84 | 0.0 |
X-RAY |
2021-08-25 | ASP | B:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ASP | D:431 | D:431 | 187.0 | 1.0 | -81.0 | 360.0 | 185.0 | 1.0 | 0.0 |
C:Q2XVP4:0.013 |
|||||||||||||
| 6xes | 2 | A0A287AGU7 | 89.84 | 0.0 |
X-RAY |
2021-08-25 | ASP | B:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ASP | D:431 | D:431 | 184.0 | 1.0 | -118.7 | 360.0 | 180.0 | 1.0 | 0.0 |
C:Q2XVP4:0.027 |
HOH |
4.223 |
O |
O |
|||||||||
| 6xet | 2 | A0A287AGU7 | 89.84 | 0.0 |
X-RAY |
2021-08-25 | ASP | B:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ASP | D:431 | D:431 | 179.0 | 1.0 | -83.6 | 360.0 | 178.0 | 1.0 | 0.0 |
C:Q2XVP4:0.007 |
HOH |
5.521 |
N |
O |
|||||||||
| 5kmg | 2 | P02554 | 90.02 | 0.0 |
EM |
2016-08-03 | ASP | B:431 | B:441 | 199.0 | NA | -111.6 | 360.0 | 198.0 | NA | NA |
A:Q2XVP4:NA |
||||||
| 6zpi | 3 | P02554 | 90.02 | 0.0 |
EM |
2020-12-30 | ASP | C:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 5gon | 2 | Q6B856 | 90.02 | 0.0 |
X-RAY |
2017-03-22 | ASP | B:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ASP | D:431 | D:441 | 202.0 | 1.0 | -82.0 | 360.0 | 202.0 | 1.0 | 0.0 |
HOH |
5.526 |
OD2 |
O |
||||||||||
| 5z4p | 2 | Q6B856 | 90.02 | 0.0 |
X-RAY |
2019-01-16 | ASP | B:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ASP | D:431 | D:441 | 192.0 | 1.0 | -163.2 | 360.0 | 192.0 | 1.0 | 0.0 | ||||||||||||||
| 6i5c | 2 | Q6B856 | 90.02 | 0.0 |
X-RAY |
2019-03-13 | ASP | B:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ASP | D:431 | D:441 | 189.0 | 1.0 | -96.7 | 360.0 | 189.0 | 1.0 | 0.0 |
HOH |
5.943 |
N |
O |
||||||||||
| 7e4q | 2 | Q6B856 | 90.02 | 0.0 |
X-RAY |
2021-07-07 | ASP | B:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ASP | D:431 | D:441 | 194.0 | 1.0 | -82.2 | 360.0 | 193.0 | 1.0 | 0.0 |
C:P81947:0.007 |
HOH |
5.637 |
N |
O |
|||||||||
| 7e4r | 2 | Q6B856 | 90.02 | 0.0 |
X-RAY |
2021-07-07 | ASP | B:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ASP | D:431 | D:431 | 193.0 | 1.0 | -98.5 | 360.0 | 193.0 | 1.0 | 0.0 |
HOH |
5.534 |
N |
O |
||||||||||
| 7e4z | 2 | Q6B856 | 90.02 | 0.0 |
X-RAY |
2021-07-07 | ASP | B:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ASP | D:431 | D:441 | 174.0 | 1.0 | -94.1 | 360.0 | 174.0 | 1.0 | 0.0 |
HOH |
4.950 |
HA |
O |
||||||||||
| 6h9b | 2 | ? | 89.79 | 0.0 |
X-RAY |
2018-12-19 | ASP | B:431 | B:441 | 190.0 | 1.0 | -128.6 | 360.0 | 176.0 | 1.0 | 0.0 |
A:None:0.093 |
HOH |
3.773 |
OD1 |
O |
||
| ASP | D:431 | D:441 | 192.0 | 1.0 | -124.7 | 360.0 | 182.0 | 1.0 | 0.0 |
C:None:0.067 |
HOH |
3.799 |
OD2 |
O |
|||||||||
| 4drx | 2 | D0VWY9 | 89.79 | 0.0 |
X-RAY |
2012-07-11 | ASP | B:431 | B:441 | 176.0 | 1.0 | 39.3 | 360.0 | 174.0 | 1.0 | 0.0 |
A:D0VWZ0:0.013 |
HOH |
4.415 |
OD2 |
O |
||
| ASP | D:431 | D:441 | 177.0 | 1.0 | 39.5 | 360.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6s8l | 2 | Q13509 | 85.91 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-27 | GLU | B:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6wsl | 2 | Q13509 | 85.91 | 0.0 |
EM |
2020-08-26 | GLU | B:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | F:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7alr | 2 | Q2T9S0 | 85.91 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-03 | GLU | B:431 | B:441 | 226.0 | 1.0 | 58.5 | 360.0 | 225.0 | 1.0 | 0.0 |
A:P81947:0.005 |
HOH |
4.733 |
HB3 |
O |
||
| 7lxb | 2 | Q13509 | 85.91 | 0.0 |
EM |
2021-09-08 | GLU | B:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | D:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | F:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | H:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | J:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | L:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | N:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | P:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7m18 | 1 | Q13509 | 85.91 | 0.0 |
EM |
2021-09-08 | GLU | A:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | C:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | E:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | G:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | I:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | K:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | M:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | O:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7m20 | 1 | Q13509 | 85.91 | 0.0 |
EM |
2021-09-08 | GLU | A:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | C:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | E:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | G:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | I:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | K:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | M:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | O:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | Q:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7pjf | 2 | Q13509 | 85.91 | 0.0 |
X-RAY |
2021-09-22 | GLU | B:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7sj7 | 2 | Q13509 | 85.91 | 0.0 |
EM |
2022-01-19 | GLU | G:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | H:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | I:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | J:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | K:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | L:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7sj8 | 2 | Q13509 | 85.91 | 0.0 |
EM |
2022-01-19 | GLU | G:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | H:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | I:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | J:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | K:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | L:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7sj9 | 2 | Q13509 | 85.91 | 0.0 |
EM |
2022-01-19 | GLU | B:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | D:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | F:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | G:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | H:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | I:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7sja | 2 | Q13509 | 85.91 | 0.0 |
EM |
2022-01-19 | GLU | B:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLU | D:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | F:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | G:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | H:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLU | I:431 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-q3zcm7-f1 | 1 | Q3ZCM7 | 100.0 | 0.0 | GLU | A:431 | A:431 | 162.0 | 0.853 | H | -80.0 | -23.0 | |
| af-q13509-f1 | 1 | Q13509 | 85.91 | 0.0 | GLU | A:431 | A:431 | 185.0 | 0.974 | T | -84.2 | -26.4 | |
| af-q9buf5-f1 | 1 | Q9BUF5 | 86.81 | 0.0 | ASN | A:431 | A:431 | 145.0 | 0.906 | T | -79.6 | -22.4 | |