Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr11 | 110306626 | . | T | A | CCDS8344.1:NM_004109.4:c.254gTt>gAt_NP_004100.1:p.85V>D | Homo sapiens ferredoxin 1 (FDX1), mRNA. |
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PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 3p1m | 1 | P10109 | 100.0 | 1e-88 |
X-RAY |
2010-11-03 | VAL | A:26 | A:85 | 83.0 | 0.535 | T | -55.6 | 146.3 | 83.0 | 0.535 | 0.0 | ||||||
| VAL | B:26 | B:85 | 74.0 | 0.477 | T | -58.5 | 133.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| VAL | C:26 | C:85 | 59.0 | 0.381 | T | -66.0 | 143.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| VAL | D:26 | D:85 | 65.0 | 0.419 | T | -59.1 | 135.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| VAL | E:26 | E:85 | 61.0 | 0.394 | T | -58.6 | 133.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| VAL | F:26 | F:85 | 45.0 | 0.29 | T | -58.5 | 137.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| VAL | G:26 | G:85 | 41.0 | 0.265 | T | -58.7 | 136.6 | 41.0 | 0.265 | 0.0 |
HOH |
8.526 |
CG2 |
O |
|||||||||
| VAL | H:26 | H:85 | 65.0 | 0.419 | T | -59.1 | 134.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3n9z | 2 | P10109 | 100.0 | 6e-88 |
X-RAY |
2011-06-08 | VAL | C:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| VAL | D:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3na1 | 2 | P10109 | 100.0 | 6e-88 |
X-RAY |
2011-06-08 | VAL | C:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| VAL | D:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7m8i | 1 | P10109,P19099 | 100.0 | 9e-86 |
X-RAY |
2021-05-26 | VAL | A:26 | A:85 | 73.0 | 0.471 | T | -68.0 | 140.6 | 73.0 | 0.471 | 0.0 | ||||||
| VAL | B:26 | B:85 | 69.0 | 0.445 | S | -56.8 | 136.9 | 69.0 | 0.445 | 0.0 | |||||||||||||
| VAL | C:26 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3n9y | 2 | P10109 | 100.0 | 4e-81 |
X-RAY |
2011-06-08 | VAL | C:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| VAL | D:24 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1l6u | 1 | P00257 | 89.52 | 9e-81 |
NMR |
2002-06-26 | ILE | A:25 | A:25 | 62.0 | 0.354 | T | -32.7 | 98.6 | 62.0 | 0.354 | 0.0 | ||||||
| 1cje | 1 | P00257 | 89.43 | 3e-80 |
X-RAY |
2000-01-21 | ILE | A:24 | A:25 | 75.0 | 0.429 | T | -56.1 | 135.6 | 75.0 | 0.429 | 0.0 |
HOH |
3.910 |
CG2 |
O |
||
| ILE | B:24 | B:25 | 78.0 | 0.446 | T | -62.3 | 138.6 | 78.0 | 0.446 | 0.0 |
HOH |
8.107 |
N |
O |
|||||||||
| ILE | C:24 | C:25 | 81.0 | 0.463 | T | -55.4 | 151.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ILE | D:24 | D:25 | 54.0 | 0.309 | T | -56.6 | 136.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1e6e | 2 | P00257 | 89.43 | 5e-80 |
X-RAY |
2001-08-09 | ILE | B:25 | B:25 | 69.0 | 0.394 | T | -47.0 | 147.5 | 69.0 | 0.394 | 0.0 | ||||||
| ILE | D:25 | D:25 | 66.0 | 0.377 | T | -58.4 | 141.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 1ayf | 1 | P00257 | 94.29 | 1e-71 |
X-RAY |
1998-12-30 | ILE | A:22 | A:25 | 105.0 | 0.6 | T | -53.4 | 135.3 | 105.0 | 0.6 | 0.0 |
HOH |
2.993 |
CD1 |
O |
||
| ILE | B:22 | B:25 | 91.0 | 0.52 | T | -46.3 | 130.5 | 91.0 | 0.52 | 0.0 |
HOH |
3.238 |
N |
O |
|||||||||
| 2bt6 | 1 | P00257 | 93.46 | 2e-71 |
X-RAY |
2006-01-25 | ILE | A:25 | A:25 | 60.0 | 0.343 | T | -50.4 | 130.1 | 60.0 | 0.343 | 0.0 |
RUA HOH |
8.761 2.779 |
C O |
C23 O |
||
| ILE | B:25 | B:25 | 79.0 | 0.451 | T | -50.4 | 133.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p10109-f1 | 1 | P10109 | 100.0 | 6e-134 | VAL | A:85 | A:85 | 43.0 | 0.277 | T | -55.3 | 127.7 | |