Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr11 | 18354655 | . | G | A | CCDS7838.1:NM_001142307.1:c.34Gta>Ata_NP_001135779.1:p.12V>I | Homo sapiens general transcription factor IIH subunit 1 (GTF2H1), transcript variant 1, mRNA. |
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PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 6o9l | 23 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2019-05-29 | VAL | W:12 | 1:12 | 9.0 | 0.058 | B | -114.4 | 118.6 | 9.0 | 0.058 | 0.0 | ||||||
| 6o9m | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2019-05-29 | VAL | B:12 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7ad8 | 10 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-07-28 | VAL | J:12 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7egb | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | VAL | B:12 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7egc | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-12 | VAL | B:12 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7ena | 37 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-26 | VAL | QA:12 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7enc | 26 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-26 | VAL | Z:12 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7lbm | 29 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-03-24 | VAL | CA:12 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7nvr | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | VAL | B:12 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7nvw | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | VAL | B:12 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7nvx | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | VAL | B:12 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7nvy | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | VAL | B:12 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7nvz | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | VAL | B:12 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7nw0 | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | VAL | B:12 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7bul | 1 | P32780 | 100.0 | 2e-110 |
NMR |
2020-12-30 | VAL | A:15 | A:12 | 1.0 | 0.006 | E | -120.3 | 141.7 | 1.0 | 0.006 | 0.0 | ||||||
| 2ruk | 2 | P32780 | 100.0 | 7e-72 |
NMR |
2014-10-15 | VAL | B:14 | B:12 | 0.0 | 0.0 | E | -101.2 | 144.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | ||||||
| 2rvb | 2 | P32780 | 100.0 | 7e-72 |
NMR |
2015-09-09 | VAL | B:14 | B:12 | 1.0 | 0.006 | E | -100.3 | 137.7 | 1.0 | 0.006 | 0.0 | ||||||
| 5gow | 2 | P32780 | 100.0 | 7e-72 |
NMR |
2016-12-07 | VAL | B:14 | B:12 | 1.0 | 0.006 | E | -115.1 | 150.1 | 1.0 | 0.006 | 0.0 | ||||||
| 5xv8 | 2 | P32780 | 100.0 | 7e-72 |
NMR |
2017-11-08 | VAL | B:14 | B:12 | 2.0 | 0.013 | E | -110.6 | 136.3 | 2.0 | 0.013 | 0.0 | ||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p32780-f1 | 1 | P32780 | 100.0 | 0.0 | VAL | A:12 | A:12 | 7.0 | 0.045 | E | -111.0 | 115.5 | |