Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr11 | 18354667 | . | C | A | CCDS7838.1:NM_001142307.1:c.46Cgt>Agt_NP_001135779.1:p.16R>S | Homo sapiens general transcription factor IIH subunit 1 (GTF2H1), transcript variant 1, mRNA. |
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PDB
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| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
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EM |
2019-05-29 | ARG | W:16 | 1:16 | 101.0 | 0.449 | E | -70.2 | 154.8 | 51.0 | 0.227 | 0.222 |
CA:P19447:0.222 |
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| 6o9m | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2019-05-29 | ARG | B:16 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7ad8 | 10 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-07-28 | ARG | J:16 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7egb | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | ARG | B:16 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7egc | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-12 | ARG | B:16 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7ena | 37 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-26 | ARG | QA:16 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7enc | 26 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-26 | ARG | Z:16 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7lbm | 29 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-03-24 | ARG | CA:16 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
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EM |
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EM |
2021-05-05 | ARG | B:16 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7nw0 | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
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2021-05-05 | ARG | B:16 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7bul | 1 | P32780 | 100.0 | 2e-110 |
NMR |
2020-12-30 | ARG | A:19 | A:16 | 115.0 | 0.511 | E | -89.5 | 116.4 | 115.0 | 0.511 | 0.0 | ||||||
| 2ruk | 2 | P32780 | 100.0 | 7e-72 |
NMR |
2014-10-15 | ARG | B:18 | B:16 | 101.0 | 0.449 | E | -92.0 | 116.9 | 99.0 | 0.44 | 0.009 |
A:P04637:0.009 |
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| 2rvb | 2 | P32780 | 100.0 | 7e-72 |
NMR |
2015-09-09 | ARG | B:18 | B:16 | 97.0 | 0.431 | E | -119.5 | 131.5 | 97.0 | 0.431 | 0.0 | ||||||
| 5gow | 2 | P32780 | 100.0 | 7e-72 |
NMR |
2016-12-07 | ARG | B:18 | B:16 | 81.0 | 0.36 | E | -89.4 | 128.4 | 43.0 | 0.191 | 0.169 |
A:None:0.169 |
|||||
| 5xv8 | 2 | P32780 | 100.0 | 7e-72 |
NMR |
2017-11-08 | ARG | B:18 | B:16 | 99.0 | 0.44 | E | -94.6 | 132.2 | 41.0 | 0.182 | 0.258 |
A:Q2YD98:0.258 |
|||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p32780-f1 | 1 | P32780 | 100.0 | 0.0 | ARG | A:16 | A:16 | 97.0 | 0.431 | E | -89.0 | 128.5 | |