Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr11 | 18357338 | . | G | A | CCDS7838.1:NM_001142307.1:c.192caG>caA_NP_001135779.1:p.64Q>Q | Homo sapiens general transcription factor IIH subunit 1 (GTF2H1), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 6o9l | 23 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2019-05-29 | GLN | W:64 | 1:64 | 69.0 | 0.383 | E | -122.8 | 144.4 | 31.0 | 0.172 | 0.211 |
Q:P29083:0.211 |
|||||
| 6o9m | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2019-05-29 | GLN | B:64 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7ad8 | 10 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-07-28 | GLN | J:64 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7egb | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | GLN | B:64 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7egc | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-12 | GLN | B:64 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7ena | 37 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-26 | GLN | QA:64 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7enc | 26 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-26 | GLN | Z:64 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7lbm | 29 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-03-24 | GLN | CA:64 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7nvr | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | GLN | B:64 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7nvw | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | GLN | B:64 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7nvx | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | GLN | B:64 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7nvy | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | GLN | B:64 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7nvz | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | GLN | B:64 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7nw0 | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | GLN | B:64 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7bul | 1 | P32780 | 100.0 | 2e-110 |
NMR |
2020-12-30 | GLN | A:67 | A:64 | 38.0 | 0.211 | E | -110.0 | 130.9 | 38.0 | 0.211 | 0.0 | ||||||
| 2ruk | 2 | P32780 | 100.0 | 7e-72 |
NMR |
2014-10-15 | GLN | B:66 | B:64 | 19.0 | 0.106 | E | -138.6 | 163.4 | 0.0 | 0.0 | 0.106 |
A:P04637:0.106 |
|||||
| 2rvb | 2 | P32780 | 100.0 | 7e-72 |
NMR |
2015-09-09 | GLN | B:66 | B:64 | 22.0 | 0.122 | E | -139.0 | 171.5 | 0.0 | 0.0 | 0.122 |
A:Q01831:0.122 |
|||||
| 5gow | 2 | P32780 | 100.0 | 7e-72 |
NMR |
2016-12-07 | GLN | B:66 | B:64 | 41.0 | 0.228 | E | -135.5 | 163.2 | 0.0 | 0.0 | 0.228 |
A:None:0.228 |
|||||
| 5xv8 | 2 | P32780 | 100.0 | 7e-72 |
NMR |
2017-11-08 | GLN | B:66 | B:64 | 32.0 | 0.178 | E | -137.4 | 169.8 | 0.0 | 0.0 | 0.178 |
A:Q2YD98:0.178 |
|||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p32780-f1 | 1 | P32780 | 100.0 | 0.0 | GLN | A:64 | A:64 | 68.0 | 0.378 | E | -137.5 | 146.6 | |