Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr11 | 18357388 | . | A | C | CCDS7838.1:NM_001142307.1:c.242aAt>aCt_NP_001135779.1:p.81N>T | Homo sapiens general transcription factor IIH subunit 1 (GTF2H1), transcript variant 1, mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
6o9l | 23 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2019-05-29 | ASN | W:81 | 1:81 | 17.0 | 0.106 | -72.9 | 107.9 | 3.0 | 0.019 | 0.087 |
CA:P19447:0.087 |
||||||
6o9m | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2019-05-29 | ASN | B:81 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
7ad8 | 10 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-07-28 | ASN | J:81 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
7egb | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | ASN | B:81 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
7egc | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-12 | ASN | B:81 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
7ena | 37 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-26 | ASN | QA:81 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
7enc | 26 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-26 | ASN | Z:81 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
7lbm | 29 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-03-24 | ASN | CA:81 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
7nvr | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | ASN | B:81 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
7nvw | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | ASN | B:81 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
7nvx | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | ASN | B:81 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
7nvy | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | ASN | B:81 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
7nvz | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | ASN | B:81 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
7nw0 | 2 | P32780 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-05-05 | ASN | B:81 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
7bul | 1 | P32780 | 100.0 | 2e-110 |
NMR |
2020-12-30 | ASN | A:84 | A:81 | 19.0 | 0.119 | -85.3 | 76.7 | 19.0 | 0.119 | 0.0 | |||||||
2ruk | 2 | P32780 | 100.0 | 7e-72 |
NMR |
2014-10-15 | ASN | B:83 | B:81 | 10.0 | 0.062 | -93.9 | 100.1 | 10.0 | 0.062 | 0.0 | |||||||
2rvb | 2 | P32780 | 100.0 | 7e-72 |
NMR |
2015-09-09 | ASN | B:83 | B:81 | 11.0 | 0.069 | -87.5 | 91.6 | 11.0 | 0.069 | 0.0 | |||||||
5gow | 2 | P32780 | 100.0 | 7e-72 |
NMR |
2016-12-07 | ASN | B:83 | B:81 | 18.0 | 0.113 | -79.8 | 91.3 | 18.0 | 0.113 | 0.0 | |||||||
5xv8 | 2 | P32780 | 100.0 | 7e-72 |
NMR |
2017-11-08 | ASN | B:83 | B:81 | 20.0 | 0.125 | -77.7 | 97.5 | 20.0 | 0.125 | 0.0 |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p32780-f1 | 1 | P32780 | 100.0 | 0.0 | ASN | A:81 | A:81 | 37.0 | 0.231 | -87.3 | 101.4 |