Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr11 111637040 . C A CCDS8348.1:NM_181699.2:c.46Gga>Tga_NP_859050.1:p.16G>* Homo sapiens protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta (PPP2R1B), transcript variant 1, mRNA.
pdb_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id
alphafold_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
1b3u 1 P30153 86.22 0.0 X-RAY
1999-04-12 ALA A:3 A:3 93.0 0.809 S -79.5 66.0 93.0 0.809 0.0 HOH
4.091
CB
O
ALA B:3 B:3 90.0 0.783 G -73.1 23.0 NA NA NA
2ie3 1 Q96DH3 86.22 0.0 X-RAY
2006-11-07 ALA A:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2ie4 1 Q96DH3 86.22 0.0 X-RAY
2006-11-07 ALA A:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2npp 1 Q96DH3 86.22 0.0 X-RAY
2006-12-12 ALA A:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA D:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3k7v 1 P30153 86.22 0.0 X-RAY
2009-11-03 ALA A:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3k7w 1 P30153 86.22 0.0 X-RAY
2009-11-03 ALA A:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6nts 1 P30153 86.22 0.0 EM
2020-05-06 ALA A:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7cun 10 P30153 86.22 0.0 EM
2020-11-25 ALA J:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7k36 1 P30153 86.22 0.0 EM
2021-03-10 ALA A:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
7pks 31 P30153 86.22 0.0 EM
2021-12-08 ALA EA:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3fga 1 Q76MZ3 86.22 0.0 X-RAY
2009-09-22 ALA A:3 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2iae 1 Q76MZ3 86.22 0.0 X-RAY
2006-12-26 ALA A:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA D:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
2pf4 1 Q76MZ3 86.22 0.0 X-RAY
2007-08-07 ALA A:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA B:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA C:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
ALA D:4 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6ef4 1 Q76MZ3 85.93 0.0 X-RAY
2019-06-26 ALA A:5 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6iur 1 P30153 85.86 0.0 X-RAY
2019-12-04 SER A:2 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER B:2 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER E:2 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
SER F:2 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p30154-f1 1 P30154 100.0 0.0 GLY A:16 A:16 70.0 0.933 176.0 47.6
af-p30153-f1 1 P30153 86.22 0.0 ALA A:4 A:4 97.0 0.843 104.6 68.9