Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr11 | 111637042 | . | C | A | CCDS8348.1:NM_181699.2:c.44gGt>gTt_NP_859050.1:p.15G>V | Homo sapiens protein phosphatase 2 scaffold subunit Abeta (PPP2R1B), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 1b3u | 1 | P30153 | 86.22 | 0.0 |
X-RAY |
1999-04-12 | ALA | A:2 | A:2 | 103.0 | 0.896 | -67.2 | -33.8 | 103.0 | 0.896 | 0.0 |
HOH |
5.962 |
O |
O |
|||
| ALA | B:2 | B:2 | 100.0 | 0.87 | G | -55.3 | -41.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2ie3 | 1 | Q96DH3 | 86.22 | 0.0 |
X-RAY |
2006-11-07 | ALA | A:3 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 2ie4 | 1 | Q96DH3 | 86.22 | 0.0 |
X-RAY |
2006-11-07 | ALA | A:3 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 2npp | 1 | Q96DH3 | 86.22 | 0.0 |
X-RAY |
2006-12-12 | ALA | A:3 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ALA | D:3 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3k7v | 1 | P30153 | 86.22 | 0.0 |
X-RAY |
2009-11-03 | ALA | A:3 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3k7w | 1 | P30153 | 86.22 | 0.0 |
X-RAY |
2009-11-03 | ALA | A:3 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6nts | 1 | P30153 | 86.22 | 0.0 |
EM |
2020-05-06 | ALA | A:3 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7cun | 10 | P30153 | 86.22 | 0.0 |
EM |
2020-11-25 | ALA | J:3 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7k36 | 1 | P30153 | 86.22 | 0.0 |
EM |
2021-03-10 | ALA | A:3 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 7pks | 31 | P30153 | 86.22 | 0.0 |
EM |
2021-12-08 | ALA | EA:3 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 3fga | 1 | Q76MZ3 | 86.22 | 0.0 |
X-RAY |
2009-09-22 | ALA | A:2 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 2iae | 1 | Q76MZ3 | 86.22 | 0.0 |
X-RAY |
2006-12-26 | ALA | A:3 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ALA | D:3 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 2pf4 | 1 | Q76MZ3 | 86.22 | 0.0 |
X-RAY |
2007-08-07 | ALA | A:3 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| ALA | B:3 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ALA | C:3 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| ALA | D:3 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6ef4 | 1 | Q76MZ3 | 85.93 | 0.0 |
X-RAY |
2019-06-26 | ALA | A:4 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| 6iur | 1 | P30153 | 85.86 | 0.0 |
X-RAY |
2019-12-04 | GLY | A:1 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | ||||||
| GLY | B:1 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLY | E:1 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
| GLY | F:1 | NA:NA | DO | NA | DO | DO | DO | NA | NA | NA | |||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p30154-f1 | 1 | P30154 | 100.0 | 0.0 | GLY | A:15 | A:15 | 90.0 | 1.0 | -65.1 | 145.5 | ||
| af-p30153-f1 | 1 | P30153 | 86.22 | 0.0 | ALA | A:3 | A:3 | 104.0 | 0.904 | 77.7 | 130.2 | ||