Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr11 | 114168709 | . | C | A | CCDS8368.1:NM_006169.2:c.191tCt>tAt_NP_006160.1:p.64S>Y | Homo sapiens nicotinamide N-methyltransferase (NNMT), mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 5yjf | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2018-03-21 | SER | A:84 | A:64 | 0.0 | 0.0 | -49.1 | -28.2 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
SAH 8WO HOH |
3.068 8.722 8.540 |
O O N |
CA C8 O |
|||
| SER | B:84 | B:64 | 0.0 | 0.0 | -47.8 | -38.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | C:84 | C:64 | 0.0 | 0.0 | -44.4 | -33.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | D:84 | D:64 | 0.0 | 0.0 | -51.7 | -32.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 2iip | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2006-10-10 | SER | A:83 | A:64 | 0.0 | 0.0 | -65.5 | -17.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
SAH HOH |
3.229 3.879 |
O N |
CA O |
|||
| SER | B:83 | B:64 | 0.0 | 0.0 | -49.9 | -17.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | C:83 | C:64 | 0.0 | 0.0 | -50.5 | -37.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | D:83 | D:64 | 0.0 | 0.0 | -61.5 | -38.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 3rod | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2011-09-07 | SER | A:83 | A:64 | 0.0 | 0.0 | -45.0 | -33.5 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
SAH NCA |
2.913 8.883 |
O O |
CA N1 |
|||
| SER | B:83 | B:64 | 0.0 | 0.0 | -52.9 | -19.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | C:83 | C:64 | 0.0 | 0.0 | -61.9 | -28.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | D:83 | D:64 | 0.0 | 0.0 | -45.6 | -35.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6b1a | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2018-01-31 | SER | A:83 | A:64 | 0.0 | 0.0 | -54.8 | -24.1 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
C8J HOH |
2.924 3.619 |
O CA |
N O |
|||
| SER | B:83 | B:64 | 0.0 | 0.0 | -58.7 | -26.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | C:83 | C:64 | 0.0 | 0.0 | -49.4 | -28.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | D:83 | D:64 | 0.0 | 0.0 | -61.5 | -20.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6chh | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2018-06-13 | SER | A:83 | A:64 | 0.0 | 0.0 | -56.2 | -23.2 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
F0P HOH |
3.047 3.594 |
O CA |
CA O |
|||
| SER | B:83 | B:64 | 0.0 | 0.0 | -58.5 | -27.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | C:83 | C:64 | 0.0 | 0.0 | -48.8 | -28.7 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
F0P HOH |
3.278 3.609 |
O N |
CA O |
||||||||||
| SER | D:83 | D:64 | 0.0 | 0.0 | -62.3 | -21.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
F0P HOH |
3.232 3.520 |
O CA |
CA O |
||||||||||
| 6orr | 1 | Q6FH49 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2019-10-23 | SER | A:83 | A:64 | 4.0 | 0.035 | -67.8 | -26.9 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
N37 HOH |
3.215 3.761 |
O CA |
C14 O |
|||
| SER | B:83 | B:64 | 4.0 | 0.035 | -68.8 | -27.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | C:83 | C:64 | 3.0 | 0.026 | -66.9 | -26.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | D:83 | D:64 | 5.0 | 0.043 | -68.1 | -27.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6pve | 1 | Q6FH49 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-27 | SER | A:83 | A:64 | 3.0 | 0.026 | -59.2 | -26.3 | 3.0 | 0.026 | 0.0 |
OZP HOH |
3.250 3.745 |
O N |
C20 O |
|||
| SER | B:83 | B:64 | 2.0 | 0.017 | -58.9 | -26.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | C:83 | C:64 | 2.0 | 0.017 | -59.4 | -27.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | D:83 | D:64 | 2.0 | 0.017 | -58.4 | -28.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6pvs | 1 | Q6FH49 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-27 | SER | A:83 | A:64 | 2.0 | 0.017 | -57.6 | -22.6 | 2.0 | 0.017 | 0.0 |
P0V HOH |
2.125 7.387 |
O O |
H212 O |
|||
| SER | B:83 | B:64 | 4.0 | 0.035 | -61.4 | -24.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | C:83 | C:64 | 2.0 | 0.017 | -58.0 | -23.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | D:83 | D:64 | 1.0 | 0.009 | -58.3 | -21.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 7bkg | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-17 | SER | A:83 | A:64 | 0.0 | 0.0 | -61.9 | -24.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
SAH U0Z HOH |
3.412 8.414 3.714 |
O O N |
CA N12 O |
|||
| SER | B:83 | B:64 | 0.0 | 0.0 | -59.8 | -20.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | C:83 | C:64 | 0.0 | 0.0 | -50.1 | -37.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | D:83 | D:64 | 0.0 | 0.0 | -52.8 | -33.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 7ble | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-17 | SER | A:83 | A:64 | 0.0 | 0.0 | -71.2 | -20.1 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
SAH U1W HOH |
3.310 8.540 3.905 |
O O CA |
CA N13 O |
|||
| SER | B:83 | B:64 | 0.0 | 0.0 | -57.1 | -13.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | C:83 | C:64 | 0.0 | 0.0 | -79.4 | -34.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | D:83 | D:64 | 0.0 | 0.0 | -54.9 | -31.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 7nbj | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-17 | SER | A:83 | A:64 | 4.0 | 0.035 | -67.4 | -29.5 | 4.0 | 0.035 | 0.0 |
U7H HOH |
5.264 3.019 |
C O |
C6 O |
|||
| SER | B:83 | B:64 | 4.0 | 0.035 | -63.2 | -28.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | C:83 | C:64 | 3.0 | 0.026 | -67.3 | -27.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | D:83 | D:64 | 2.0 | 0.017 | -53.7 | -32.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 7nbm | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-17 | SER | A:83 | A:64 | 5.0 | 0.043 | -62.4 | -16.9 | 5.0 | 0.043 | 0.0 |
U7K HOH |
5.404 3.343 |
C O |
O18 O |
|||
| SER | B:83 | B:64 | 3.0 | 0.026 | -51.8 | -32.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | C:83 | C:64 | 1.0 | 0.009 | -58.0 | -25.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | D:83 | D:64 | 3.0 | 0.026 | -50.2 | -38.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 7nbq | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-17 | SER | A:83 | A:64 | 0.0 | 0.0 | -57.2 | -27.7 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
SAH U72 HOH |
3.302 8.531 3.630 |
O O N |
CA N5 O |
|||
| SER | B:83 | B:64 | 0.0 | 0.0 | -59.8 | -30.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | C:83 | C:64 | 0.0 | 0.0 | -56.9 | -31.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | D:83 | D:64 | 0.0 | 0.0 | -53.1 | -36.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 7egu | 1 | P40261 | 99.61 | 0.0 |
X-RAY |
2021-12-15 | SER | A:63 | A:64 | 2.0 | 0.017 | -57.2 | -26.9 | 0.0 | 0.0 | 0.017 |
B:None:0.017 |
HOH |
4.571 |
N |
O |
||
| 7ehz | 1 | P40261 | 99.61 | 0.0 |
X-RAY |
2021-12-15 | SER | A:63 | A:64 | 2.0 | 0.017 | -90.7 | -2.2 | 0.0 | 0.0 | 0.017 |
B:None:0.017 |
HOH |
4.159 |
N |
O |
||
| 5xvq | 1 | F7ERX8 | 96.97 | 0.0 |
X-RAY |
2017-08-02 | SER | A:84 | A:64 | 0.0 | 0.0 | -58.0 | -28.8 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
SAH 8GC HOH |
3.090 8.543 3.611 |
O O N |
CA C9 O |
|||
| SER | B:84 | B:64 | 0.0 | 0.0 | -55.6 | -30.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 2i62 | 1 | O55239 | 85.5 | 7e-168 |
X-RAY |
2006-09-12 | SER | A:65 | A:65 | 0.0 | 0.0 | -62.1 | -26.3 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
SAH |
3.227 |
O |
CA |
|||
| SER | B:65 | B:65 | 0.0 | 0.0 | -54.9 | -26.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | C:65 | C:65 | 0.0 | 0.0 | -65.1 | -18.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| SER | D:65 | D:65 | 0.0 | 0.0 | -60.9 | -23.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5xvk | 1 | O55239 | 85.5 | 2e-167 |
X-RAY |
2017-08-02 | SER | A:84 | A:64 | 0.0 | 0.0 | -54.3 | -27.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
SAH 8GC HOH |
3.182 8.383 3.492 |
O O N |
CA C9 O |
|||
| SER | B:84 | B:64 | 0.0 | 0.0 | -57.3 | -29.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5yji | 1 | O55239 | 85.5 | 2e-167 |
X-RAY |
2018-03-21 | SER | A:84 | A:64 | 0.0 | 0.0 | -58.2 | -24.6 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
SAH 8WO HOH |
3.199 8.751 3.643 |
O O N |
CA C8 O |
|||
| SER | B:84 | B:64 | 0.0 | 0.0 | -56.8 | -26.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-p40261-f1 | 1 | P40261 | 100.0 | 0.0 | SER | A:64 | A:64 | 1.0 | 0.009 | -55.9 | -22.0 | ||