Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr11 114168736 . C A CCDS8368.1:NM_006169.2:c.218tCt>tAt_NP_006160.1:p.73S>Y Homo sapiens nicotinamide N-methyltransferase (NNMT), mRNA.
pdb_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id
alphafold_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
5yjf 1 P40261 98.86 0.0 X-RAY
2018-03-21 SER A:93 A:73 3.0 0.026 T -83.1 -38.4 3.0 0.026 0.0 HOH
3.120
N
O
SER B:93 B:73 4.0 0.035 T -84.5 -35.2 NA NA NA
SER C:93 C:73 4.0 0.035 T -76.5 -38.1 NA NA NA
SER D:93 D:73 4.0 0.035 T -76.3 -29.6 NA NA NA
2iip 1 P40261 98.86 0.0 X-RAY
2006-10-10 SER A:92 A:73 4.0 0.035 T -71.1 -31.4 4.0 0.035 0.0 HOH
2.782
OG
O
SER B:92 B:73 3.0 0.026 T -69.6 -33.7 NA NA NA
SER C:92 C:73 2.0 0.017 T -72.2 -30.8 NA NA NA
SER D:92 D:73 3.0 0.026 T -72.7 -36.0 NA NA NA
3rod 1 P40261 98.86 0.0 X-RAY
2011-09-07 SER A:92 A:73 6.0 0.052 T -92.8 -50.9 6.0 0.052 0.0 HOH
9.976
OG
O
SER B:92 B:73 3.0 0.026 T -84.8 -43.7 NA NA NA
SER C:92 C:73 4.0 0.035 T -89.8 -32.2 NA NA NA
SER D:92 D:73 4.0 0.035 T -95.4 -31.2 NA NA NA
6b1a 1 P40261 98.86 0.0 X-RAY
2018-01-31 SER A:92 A:73 4.0 0.035 T -77.4 -35.7 4.0 0.035 0.0 HOH
2.671
OG
O
SER B:92 B:73 3.0 0.026 T -65.2 -37.2 NA NA NA
SER C:92 C:73 3.0 0.026 T -80.8 -31.9 NA NA NA
SER D:92 D:73 2.0 0.017 T -72.9 -37.6 NA NA NA
6chh 1 P40261 98.86 0.0 X-RAY
2018-06-13 SER A:92 A:73 5.0 0.043 T -79.0 -35.1 5.0 0.043 0.0 HOH
2.701
OG
O
SER B:92 B:73 3.0 0.026 T -66.6 -35.9 NA NA NA
SER C:92 C:73 3.0 0.026 T -80.9 -32.9 3.0 0.026 0.0 HOH
2.721
OG
O
SER D:92 D:73 3.0 0.026 T -73.2 -38.1 3.0 0.026 0.0 HOH
2.718
OG
O
6orr 1 Q6FH49 98.86 0.0 X-RAY
2019-10-23 SER A:92 A:73 5.0 0.043 T -76.0 -28.5 5.0 0.043 0.0 HOH
3.122
N
O
SER B:92 B:73 4.0 0.035 T -77.5 -29.1 NA NA NA
SER C:92 C:73 4.0 0.035 T -75.9 -27.1 NA NA NA
SER D:92 D:73 4.0 0.035 T -76.7 -28.8 NA NA NA
6pve 1 Q6FH49 98.86 0.0 X-RAY
2019-11-27 SER A:92 A:73 4.0 0.035 T -75.7 -34.6 4.0 0.035 0.0 HOH
2.815
OG
O
SER B:92 B:73 5.0 0.043 T -76.6 -32.3 NA NA NA
SER C:92 C:73 4.0 0.035 T -74.5 -35.2 NA NA NA
SER D:92 D:73 5.0 0.043 T -76.0 -35.0 NA NA NA
6pvs 1 Q6FH49 98.86 0.0 X-RAY
2019-11-27 SER A:92 A:73 2.0 0.017 T -68.7 -27.9 2.0 0.017 0.0 HOH
2.419
OG
O
SER B:92 B:73 6.0 0.052 T -67.1 -26.1 NA NA NA
SER C:92 C:73 3.0 0.026 T -68.8 -25.7 NA NA NA
SER D:92 D:73 4.0 0.035 T -68.4 -27.6 NA NA NA
7bkg 1 P40261 98.86 0.0 X-RAY
2021-03-17 SER A:92 A:73 4.0 0.035 T -76.9 -35.6 4.0 0.035 0.0 HOH
2.673
OG
O
SER B:92 B:73 2.0 0.017 T -72.2 -36.0 NA NA NA
SER C:92 C:73 3.0 0.026 T -87.3 -36.6 NA NA NA
SER D:92 D:73 4.0 0.035 T -90.3 -33.6 NA NA NA
7ble 1 P40261 98.86 0.0 X-RAY
2021-03-17 SER A:92 A:73 6.0 0.052 T -88.4 -23.0 6.0 0.052 0.0 HOH
2.825
OG
O
SER B:92 B:73 5.0 0.043 G -76.8 -34.7 NA NA NA
SER C:92 C:73 3.0 0.026 T -81.3 -35.9 NA NA NA
SER D:92 D:73 3.0 0.026 T -89.5 -38.2 NA NA NA
7nbj 1 P40261 98.86 0.0 X-RAY
2021-03-17 SER A:92 A:73 3.0 0.026 T -79.5 -33.0 3.0 0.026 0.0 HOH
2.658
OG
O
SER B:92 B:73 4.0 0.035 T -80.8 -34.4 NA NA NA
SER C:92 C:73 4.0 0.035 T -80.5 -39.3 NA NA NA
SER D:92 D:73 2.0 0.017 T -76.1 -32.4 NA NA NA
7nbm 1 P40261 98.86 0.0 X-RAY
2021-03-17 SER A:92 A:73 3.0 0.026 T -78.2 -38.4 3.0 0.026 0.0 HOH
3.370
OG
O
SER B:92 B:73 4.0 0.035 T -75.3 -39.4 NA NA NA
SER C:92 C:73 4.0 0.035 T -78.8 -37.8 NA NA NA
SER D:92 D:73 4.0 0.035 T -75.4 -40.0 NA NA NA
7nbq 1 P40261 98.86 0.0 X-RAY
2021-03-17 SER A:92 A:73 3.0 0.026 T -77.2 -28.5 3.0 0.026 0.0 HOH
2.572
OG
O
SER B:92 B:73 5.0 0.043 T -75.6 -32.7 NA NA NA
SER C:92 C:73 5.0 0.043 T -80.1 -36.8 NA NA NA
SER D:92 D:73 4.0 0.035 T -80.6 -41.0 NA NA NA
7egu 1 P40261 99.61 0.0 X-RAY
2021-12-15 SER A:72 A:73 5.0 0.043 T -75.5 -32.4 5.0 0.043 0.0 HOH
2.843
OG
O
7ehz 1 P40261 99.61 0.0 X-RAY
2021-12-15 SER A:72 A:73 4.0 0.035 T -83.0 -37.1 4.0 0.035 0.0 HOH
2.664
OG
O
5xvq 1 F7ERX8 96.97 0.0 X-RAY
2017-08-02 SER A:93 A:73 4.0 0.035 T -75.5 -33.1 4.0 0.035 0.0 HOH
2.691
OG
O
SER B:93 B:73 4.0 0.035 T -83.0 -34.6 NA NA NA
2i62 1 O55239 85.5 7e-168 X-RAY
2006-09-12 SER A:74 A:74 5.0 0.043 T -80.5 -36.4 5.0 0.043 0.0 HOH
2.703
OG
O
SER B:74 B:74 4.0 0.035 T -72.6 -35.7 NA NA NA
SER C:74 C:74 5.0 0.043 T -82.4 -36.3 NA NA NA
SER D:74 D:74 3.0 0.026 T -73.1 -34.6 NA NA NA
5xvk 1 O55239 85.5 2e-167 X-RAY
2017-08-02 SER A:93 A:73 4.0 0.035 T -76.1 -36.2 4.0 0.035 0.0 HOH
2.870
OG
O
SER B:93 B:73 5.0 0.043 T -76.0 -33.6 NA NA NA
5yji 1 O55239 85.5 2e-167 X-RAY
2018-03-21 SER A:93 A:73 5.0 0.043 T -75.4 -37.9 5.0 0.043 0.0 HOH
2.991
OG
O
SER B:93 B:73 5.0 0.043 T -78.7 -30.1 NA NA NA

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-p40261-f1 1 P40261 100.0 0.0 SER A:73 A:73 2.0 0.017 T -86.8 -26.7