Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr11 | 114168819 | . | G | A | CCDS8368.1:NM_006169.2:c.301Gag>Aag_NP_006160.1:p.101E>K | Homo sapiens nicotinamide N-methyltransferase (NNMT), mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
5yjf | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2018-03-21 | ALA | A:121 | A:101 | 35.0 | 0.304 | -71.6 | 132.2 | 35.0 | 0.304 | 0.0 |
HOH |
7.514 |
O |
O |
|||
ALA | B:121 | B:101 | 31.0 | 0.27 | -68.0 | 139.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | C:121 | C:101 | 33.0 | 0.287 | -78.1 | 134.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | D:121 | D:101 | 38.0 | 0.33 | -64.3 | 141.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
2iip | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2006-10-10 | ALA | A:120 | A:101 | 27.0 | 0.235 | -58.4 | 135.7 | 27.0 | 0.235 | 0.0 |
HOH |
6.947 |
O |
O |
|||
ALA | B:120 | B:101 | 27.0 | 0.235 | -55.2 | 131.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | C:120 | C:101 | 33.0 | 0.287 | -82.5 | 160.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | D:120 | D:101 | 35.0 | 0.304 | -65.5 | 140.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
3rod | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2011-09-07 | ALA | A:120 | A:101 | 37.0 | 0.322 | -88.1 | 146.3 | 37.0 | 0.322 | 0.0 |
HOH |
4.933 |
O |
O |
|||
ALA | B:120 | B:101 | 33.0 | 0.287 | -77.0 | 131.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | C:120 | C:101 | 39.0 | 0.339 | -152.9 | 144.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | D:120 | D:101 | 30.0 | 0.261 | -89.6 | 148.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
6b1a | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2018-01-31 | ALA | A:120 | A:101 | 26.0 | 0.226 | -62.6 | 135.7 | 26.0 | 0.226 | 0.0 |
HOH |
6.048 |
O |
O |
|||
ALA | B:120 | B:101 | 24.0 | 0.209 | -59.9 | 136.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | C:120 | C:101 | 37.0 | 0.322 | -72.4 | 146.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | D:120 | D:101 | 34.0 | 0.296 | -69.7 | 146.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
6chh | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2018-06-13 | ALA | A:120 | A:101 | 27.0 | 0.235 | -63.1 | 134.4 | 27.0 | 0.235 | 0.0 |
HOH |
6.001 |
O |
O |
|||
ALA | B:120 | B:101 | 24.0 | 0.209 | -61.4 | 134.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | C:120 | C:101 | 36.0 | 0.313 | -72.4 | 147.2 | 36.0 | 0.313 | 0.0 |
HOH |
7.294 |
O |
O |
||||||||||
ALA | D:120 | D:101 | 34.0 | 0.296 | -71.7 | 147.3 | 34.0 | 0.296 | 0.0 |
HOH |
4.345 |
N |
O |
||||||||||
6orr | 1 | Q6FH49 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2019-10-23 | ALA | A:120 | A:101 | 24.0 | 0.209 | -66.6 | 147.0 | 24.0 | 0.209 | 0.0 |
HOH |
6.296 |
O |
O |
|||
ALA | B:120 | B:101 | 32.0 | 0.278 | -67.8 | 148.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | C:120 | C:101 | 26.0 | 0.226 | -67.2 | 140.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | D:120 | D:101 | 36.0 | 0.313 | -68.4 | 145.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
6pve | 1 | Q6FH49 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-27 | ALA | A:120 | A:101 | 31.0 | 0.27 | -67.0 | 142.2 | 31.0 | 0.27 | 0.0 |
HOH |
6.370 |
O |
O |
|||
ALA | B:120 | B:101 | 37.0 | 0.322 | -66.4 | 141.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | C:120 | C:101 | 30.0 | 0.261 | -66.1 | 146.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | D:120 | D:101 | 23.0 | 0.2 | -66.3 | 143.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
6pvs | 1 | Q6FH49 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-27 | ALA | A:120 | A:101 | 31.0 | 0.27 | -69.5 | 138.4 | 31.0 | 0.27 | 0.0 |
HOH |
9.025 |
CB |
O |
|||
ALA | B:120 | B:101 | 28.0 | 0.243 | -69.4 | 134.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | C:120 | C:101 | 32.0 | 0.278 | -69.7 | 145.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | D:120 | D:101 | 34.0 | 0.296 | -72.8 | 141.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
7bkg | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-17 | ALA | A:120 | A:101 | 29.0 | 0.252 | -62.9 | 126.1 | 29.0 | 0.252 | 0.0 |
HOH |
2.686 |
O |
O |
|||
ALA | B:120 | B:101 | 31.0 | 0.27 | -66.7 | 128.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | C:120 | C:101 | 34.0 | 0.296 | -68.4 | 161.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | D:120 | D:101 | 36.0 | 0.313 | -65.8 | 137.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
7ble | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-17 | ALA | A:120 | A:101 | 26.0 | 0.226 | -71.5 | 151.2 | 26.0 | 0.226 | 0.0 |
HOH |
6.424 |
O |
O |
|||
ALA | B:120 | B:101 | 21.0 | 0.183 | -65.0 | 131.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | C:120 | C:101 | 37.0 | 0.322 | -57.3 | 158.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | D:120 | D:101 | 36.0 | 0.313 | -71.1 | 145.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
7nbj | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-17 | ALA | A:120 | A:101 | 30.0 | 0.261 | -65.6 | 142.0 | 30.0 | 0.261 | 0.0 |
HOH |
2.689 |
O |
O |
|||
ALA | B:120 | B:101 | 23.0 | 0.2 | -65.4 | 137.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | C:120 | C:101 | 35.0 | 0.304 | -71.7 | 146.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | D:120 | D:101 | 36.0 | 0.313 | -68.2 | 141.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
7nbm | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-17 | ALA | A:120 | A:101 | 26.0 | 0.226 | -71.9 | 128.3 | 26.0 | 0.226 | 0.0 |
HOH |
4.801 |
O |
O |
|||
ALA | B:120 | B:101 | 26.0 | 0.226 | -60.5 | 134.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | C:120 | C:101 | 33.0 | 0.287 | -67.0 | 150.2 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | D:120 | D:101 | 45.0 | 0.391 | -77.6 | 154.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
7nbq | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-17 | ALA | A:120 | A:101 | 33.0 | 0.287 | -70.1 | 138.1 | 33.0 | 0.287 | 0.0 |
HOH |
3.732 |
CB |
O |
|||
ALA | B:120 | B:101 | 32.0 | 0.278 | -65.1 | 135.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | C:120 | C:101 | 35.0 | 0.304 | -61.6 | 157.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
ALA | D:120 | D:101 | 35.0 | 0.304 | -64.7 | 142.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
7egu | 1 | P40261 | 99.61 | 0.0 |
X-RAY |
2021-12-15 | GLU | A:100 | A:101 | 79.0 | 0.416 | -65.6 | 142.2 | 79.0 | 0.416 | 0.0 |
HOH |
2.924 |
O |
O |
|||
7ehz | 1 | P40261 | 99.61 | 0.0 |
X-RAY |
2021-12-15 | GLU | A:100 | A:101 | 95.0 | 0.5 | -67.6 | 162.6 | 95.0 | 0.5 | 0.0 |
HOH |
3.454 |
C |
O |
|||
5xvq | 1 | F7ERX8 | 96.97 | 0.0 |
X-RAY |
2017-08-02 | GLU | A:121 | A:101 | 66.0 | 0.347 | -82.1 | 152.1 | 66.0 | 0.347 | 0.0 |
HOH |
4.287 |
O |
O |
|||
GLU | B:121 | B:101 | 94.0 | 0.495 | -84.4 | 154.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
2i62 | 1 | O55239 | 85.5 | 7e-168 |
X-RAY |
2006-09-12 | GLU | A:102 | A:102 | 88.0 | 0.463 | -80.8 | 153.6 | 88.0 | 0.463 | 0.0 |
HOH |
3.409 |
OE1 |
O |
|||
GLU | B:102 | B:102 | 86.0 | 0.453 | -72.5 | 141.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
GLU | C:102 | C:102 | 94.0 | 0.495 | -78.6 | 149.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
GLU | D:102 | D:102 | 85.0 | 0.447 | -81.7 | 150.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
5xvk | 1 | O55239 | 85.5 | 2e-167 |
X-RAY |
2017-08-02 | GLU | A:121 | A:101 | 77.0 | 0.405 | -78.7 | 147.6 | 77.0 | 0.405 | 0.0 |
HOH |
4.152 |
C |
O |
|||
GLU | B:121 | B:101 | 86.0 | 0.453 | -81.3 | 153.4 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
5yji | 1 | O55239 | 85.5 | 2e-167 |
X-RAY |
2018-03-21 | GLU | A:121 | A:101 | 80.0 | 0.421 | -77.3 | 149.7 | 80.0 | 0.421 | 0.0 |
HOH |
4.175 |
O |
O |
|||
GLU | B:121 | B:101 | 91.0 | 0.479 | -81.4 | 156.0 | NA | NA | NA |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p40261-f1 | 1 | P40261 | 100.0 | 0.0 | GLU | A:101 | A:101 | 79.0 | 0.416 | -67.1 | 144.8 |