Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr11 | 114182895 | . | T | A | CCDS8368.1:NM_006169.2:c.491cTg>cAg_NP_006160.1:p.164L>Q | Homo sapiens nicotinamide N-methyltransferase (NNMT), mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
5yjf | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2018-03-21 | LEU | A:184 | A:164 | 17.0 | 0.1 | S | 51.6 | 33.7 | 17.0 | 0.1 | 0.0 |
SAH 8WO HOH |
3.439 3.208 3.046 |
O O N |
C5' C8 O |
||
LEU | B:184 | B:164 | 17.0 | 0.1 | S | 48.3 | 33.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | C:184 | C:164 | 19.0 | 0.112 | S | 44.4 | 40.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | D:184 | D:164 | 19.0 | 0.112 | S | 62.5 | 27.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2iip | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2006-10-10 | LEU | A:183 | A:164 | 13.0 | 0.076 | S | 48.2 | 32.8 | 13.0 | 0.076 | 0.0 |
SAH HOH |
3.279 2.597 |
O O |
CG O |
||
LEU | B:183 | B:164 | 12.0 | 0.071 | S | 67.0 | 23.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | C:183 | C:164 | 15.0 | 0.088 | S | 62.3 | 28.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | D:183 | D:164 | 12.0 | 0.071 | S | 58.9 | 26.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3rod | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2011-09-07 | LEU | A:183 | A:164 | 17.0 | 0.1 | S | 42.9 | 39.4 | 17.0 | 0.1 | 0.0 |
SAH NCA HOH |
3.297 3.458 6.064 |
O O CD1 |
C5' C2 O |
||
LEU | B:183 | B:164 | 15.0 | 0.088 | S | 68.2 | 26.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | C:183 | C:164 | 13.0 | 0.076 | S | 39.3 | 32.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | D:183 | D:164 | 20.0 | 0.118 | S | 40.7 | 48.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6b1a | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2018-01-31 | LEU | A:183 | A:164 | 0.0 | 0.0 | S | 56.5 | 33.8 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
C8J HOH |
3.044 2.714 |
O O |
CE O |
||
LEU | B:183 | B:164 | 0.0 | 0.0 | S | 53.3 | 38.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | C:183 | C:164 | 0.0 | 0.0 | S | 55.3 | 27.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | D:183 | D:164 | 1.0 | 0.006 | S | 53.3 | 33.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6chh | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2018-06-13 | LEU | A:183 | A:164 | 0.0 | 0.0 | S | 57.5 | 35.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
F0P HOH |
3.024 2.823 |
O O |
CG O |
||
LEU | B:183 | B:164 | 0.0 | 0.0 | S | 53.6 | 40.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | C:183 | C:164 | 0.0 | 0.0 | S | 55.9 | 29.0 | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
F0P HOH |
2.990 2.724 |
O O |
CE O |
|||||||||
LEU | D:183 | D:164 | 1.0 | 0.006 | S | 53.9 | 33.7 | 1.0 | 0.006 | 0.0 |
F0P HOH |
3.003 2.849 |
O O |
CE O |
|||||||||
6orr | 1 | Q6FH49 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2019-10-23 | LEU | A:183 | A:164 | 32.0 | 0.188 | S | 61.9 | 36.0 | 32.0 | 0.188 | 0.0 |
N37 HOH |
3.055 2.975 |
O O |
C16 O |
||
LEU | B:183 | B:164 | 33.0 | 0.194 | S | 61.3 | 35.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | C:183 | C:164 | 32.0 | 0.188 | S | 59.0 | 38.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | D:183 | D:164 | 34.0 | 0.2 | S | 61.4 | 35.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6pve | 1 | Q6FH49 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-27 | LEU | A:183 | A:164 | 36.0 | 0.212 | S | 63.9 | 29.3 | 36.0 | 0.212 | 0.0 |
OZP HOH |
3.096 2.936 |
O O |
C25 O |
||
LEU | B:183 | B:164 | 33.0 | 0.194 | S | 62.5 | 30.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | C:183 | C:164 | 35.0 | 0.206 | S | 64.0 | 30.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | D:183 | D:164 | 34.0 | 0.2 | S | 64.3 | 30.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6pvs | 1 | Q6FH49 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-27 | LEU | A:183 | A:164 | 37.0 | 0.218 | S | 62.3 | 20.9 | 37.0 | 0.218 | 0.0 |
P0V HOH |
3.087 6.811 |
CD1 CD2 |
H321 O |
||
LEU | B:183 | B:164 | 33.0 | 0.194 | S | 66.4 | 24.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | C:183 | C:164 | 34.0 | 0.2 | S | 65.3 | 24.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | D:183 | D:164 | 28.0 | 0.165 | S | 62.7 | 22.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7bkg | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-17 | LEU | A:183 | A:164 | 19.0 | 0.112 | S | 53.8 | 33.3 | 19.0 | 0.112 | 0.0 |
SAH U0Z HOH |
3.073 3.049 3.503 |
O O CD1 |
CG C8 O |
||
LEU | B:183 | B:164 | 19.0 | 0.112 | S | 51.5 | 39.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | C:183 | C:164 | 19.0 | 0.112 | S | 47.2 | 34.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | D:183 | D:164 | 19.0 | 0.112 | S | 50.5 | 37.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7ble | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-17 | LEU | A:183 | A:164 | 15.0 | 0.088 | S | 39.1 | 44.6 | 15.0 | 0.088 | 0.0 |
SAH U1W HOH |
3.159 2.835 3.917 |
O O N |
CG N13 O |
||
LEU | B:183 | B:164 | 21.0 | 0.124 | S | 43.3 | 44.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | C:183 | C:164 | 21.0 | 0.124 | S | 54.2 | 35.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | D:183 | D:164 | 20.0 | 0.118 | S | 57.5 | 39.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7nbj | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-17 | LEU | A:183 | A:164 | 38.0 | 0.224 | S | 51.4 | 39.0 | 38.0 | 0.224 | 0.0 |
U7H HOH |
3.122 3.154 |
O O |
C1 O |
||
LEU | B:183 | B:164 | 34.0 | 0.2 | S | 52.9 | 32.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | C:183 | C:164 | 38.0 | 0.224 | S | 54.1 | 32.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | D:183 | D:164 | 38.0 | 0.224 | S | 52.2 | 41.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7nbm | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-17 | LEU | A:183 | A:164 | 39.0 | 0.229 | S | 49.9 | 58.0 | 39.0 | 0.229 | 0.0 |
U7K HOH |
3.340 3.503 |
O CD1 |
C8 O |
||
LEU | B:183 | B:164 | 47.0 | 0.276 | S | 46.9 | 41.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | C:183 | C:164 | 41.0 | 0.241 | S | 60.4 | 59.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | D:183 | D:164 | 40.0 | 0.235 | S | 49.9 | 86.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7nbq | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-17 | LEU | A:183 | A:164 | 19.0 | 0.112 | S | 47.3 | 40.0 | 19.0 | 0.112 | 0.0 |
SAH U72 HOH |
3.140 3.131 3.620 |
O O N |
CG C14 O |
||
LEU | B:183 | B:164 | 21.0 | 0.124 | S | 42.4 | 40.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | C:183 | C:164 | 21.0 | 0.124 | S | 52.0 | 32.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | D:183 | D:164 | 23.0 | 0.135 | S | 57.7 | 36.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7egu | 1 | P40261 | 99.61 | 0.0 |
X-RAY |
2021-12-15 | LEU | A:163 | A:164 | 54.0 | 0.318 | S | 50.7 | 52.2 | 1.0 | 0.006 | 0.312 |
B:None:0.312 |
HOH |
3.140 |
N |
O |
|
7ehz | 1 | P40261 | 99.61 | 0.0 |
X-RAY |
2021-12-15 | LEU | A:163 | A:164 | 71.0 | 0.418 | S | 53.9 | 36.5 | 1.0 | 0.006 | 0.412 |
B:None:0.412 |
HOH |
3.031 |
C |
O |
|
5xvq | 1 | F7ERX8 | 96.97 | 0.0 |
X-RAY |
2017-08-02 | LEU | A:184 | A:164 | 19.0 | 0.112 | S | 52.4 | 39.2 | 19.0 | 0.112 | 0.0 |
SAH 8GC HOH |
3.344 3.303 2.879 |
O O O |
C5' C9 O |
||
LEU | B:184 | B:164 | 20.0 | 0.118 | S | 50.5 | 37.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2i62 | 1 | O55239 | 85.5 | 7e-168 |
X-RAY |
2006-09-12 | LEU | A:165 | A:165 | 15.0 | 0.088 | S | 55.0 | 36.7 | 15.0 | 0.088 | 0.0 |
SAH HOH |
3.082 2.866 |
O O |
CG O |
||
LEU | B:165 | B:165 | 16.0 | 0.094 | S | 55.9 | 33.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | C:165 | C:165 | 17.0 | 0.1 | S | 56.3 | 38.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
LEU | D:165 | D:165 | 15.0 | 0.088 | S | 55.7 | 36.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
5xvk | 1 | O55239 | 85.5 | 2e-167 |
X-RAY |
2017-08-02 | LEU | A:184 | A:164 | 17.0 | 0.1 | S | 56.8 | 31.8 | 17.0 | 0.1 | 0.0 |
SAH 8GC HOH |
3.358 3.276 2.863 |
O O O |
C5' C9 O |
||
LEU | B:184 | B:164 | 16.0 | 0.094 | S | 56.7 | 31.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
5yji | 1 | O55239 | 85.5 | 2e-167 |
X-RAY |
2018-03-21 | LEU | A:184 | A:164 | 18.0 | 0.106 | S | 57.4 | 28.7 | 18.0 | 0.106 | 0.0 |
SAH 8WO HOH |
3.466 3.271 2.834 |
O O O |
C5' C8 O |
||
LEU | B:184 | B:164 | 18.0 | 0.106 | S | 58.2 | 32.9 | NA | NA | NA |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p40261-f1 | 1 | P40261 | 100.0 | 0.0 | LEU | A:164 | A:164 | 31.0 | 0.182 | S | 54.8 | 39.7 |