Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr11 | 114182950 | . | C | A | CCDS8368.1:NM_006169.2:c.546aaC>aaA_NP_006160.1:p.182N>K | Homo sapiens nicotinamide N-methyltransferase (NNMT), mRNA. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
5yjf | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2018-03-21 | ASN | A:202 | A:182 | 20.0 | 0.125 | H | -55.0 | -46.6 | 20.0 | 0.125 | 0.0 |
SAH HOH |
8.812 4.705 |
ND2 ND2 |
N6 O |
||
ASN | B:202 | B:182 | 20.0 | 0.125 | H | -64.9 | -40.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | C:202 | C:182 | 25.0 | 0.156 | H | -61.5 | -44.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | D:202 | D:182 | 22.0 | 0.138 | H | -48.1 | -43.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2iip | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2006-10-10 | ASN | A:201 | A:182 | 24.0 | 0.15 | H | -52.3 | -42.1 | 24.0 | 0.15 | 0.0 |
SAH HOH |
8.974 2.815 |
ND2 ND2 |
N6 O |
||
ASN | B:201 | B:182 | 26.0 | 0.163 | H | -62.7 | -41.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | C:201 | C:182 | 22.0 | 0.138 | H | -61.0 | -44.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | D:201 | D:182 | 22.0 | 0.138 | H | -50.1 | -50.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
3rod | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2011-09-07 | ASN | A:201 | A:182 | 21.0 | 0.131 | H | -67.0 | -36.9 | 21.0 | 0.131 | 0.0 |
SAH HOH |
9.245 4.630 |
ND2 O |
N6 O |
||
ASN | B:201 | B:182 | 19.0 | 0.119 | H | -75.0 | -37.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | C:201 | C:182 | 11.0 | 0.069 | H | -62.3 | -34.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | D:201 | D:182 | 19.0 | 0.119 | H | -48.1 | -49.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6b1a | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2018-01-31 | ASN | A:201 | A:182 | 21.0 | 0.131 | H | -54.8 | -46.0 | 21.0 | 0.131 | 0.0 |
C8J HOH |
8.895 2.767 |
OD1 OD1 |
N6 O |
||
ASN | B:201 | B:182 | 22.0 | 0.138 | H | -49.6 | -51.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | C:201 | C:182 | 22.0 | 0.138 | H | -53.9 | -44.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | D:201 | D:182 | 21.0 | 0.131 | H | -59.4 | -42.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6chh | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2018-06-13 | ASN | A:201 | A:182 | 21.0 | 0.131 | H | -58.6 | -45.8 | 21.0 | 0.131 | 0.0 |
F0P HOH |
8.862 2.845 |
ND2 ND2 |
N6 O |
||
ASN | B:201 | B:182 | 22.0 | 0.138 | H | -50.8 | -52.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | C:201 | C:182 | 22.0 | 0.138 | H | -55.4 | -46.8 | 22.0 | 0.138 | 0.0 |
F0P HOH |
8.724 2.898 |
ND2 ND2 |
N6 O |
|||||||||
ASN | D:201 | D:182 | 21.0 | 0.131 | H | -59.8 | -41.6 | 21.0 | 0.131 | 0.0 |
F0P HOH |
8.628 4.902 |
ND2 O |
N6 O |
|||||||||
6orr | 1 | Q6FH49 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2019-10-23 | ASN | A:201 | A:182 | 21.0 | 0.131 | H | -64.3 | -41.0 | 21.0 | 0.131 | 0.0 |
N37 HOH |
8.734 4.576 |
ND2 O |
N4 O |
||
ASN | B:201 | B:182 | 23.0 | 0.144 | H | -65.4 | -40.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | C:201 | C:182 | 17.0 | 0.106 | H | -63.1 | -40.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | D:201 | D:182 | 26.0 | 0.163 | H | -64.4 | -39.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6pve | 1 | Q6FH49 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-27 | ASN | A:201 | A:182 | 14.0 | 0.087 | H | -58.1 | -42.8 | 14.0 | 0.087 | 0.0 |
OZP HOH |
8.880 3.078 |
ND2 ND2 |
N17 O |
||
ASN | B:201 | B:182 | 22.0 | 0.138 | H | -56.4 | -43.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | C:201 | C:182 | 22.0 | 0.138 | H | -59.1 | -43.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | D:201 | D:182 | 24.0 | 0.15 | H | -57.9 | -43.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
6pvs | 1 | Q6FH49 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2019-11-27 | ASN | A:201 | A:182 | 6.0 | 0.037 | H | -57.1 | -42.8 | 6.0 | 0.037 | 0.0 |
P0V HOH |
8.173 5.445 |
ND2 OD1 |
H171 O |
||
ASN | B:201 | B:182 | 20.0 | 0.125 | H | -58.5 | -48.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | C:201 | C:182 | 20.0 | 0.125 | H | -60.2 | -44.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | D:201 | D:182 | 21.0 | 0.131 | H | -59.5 | -43.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7bkg | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-17 | ASN | A:201 | A:182 | 23.0 | 0.144 | H | -60.7 | -44.4 | 23.0 | 0.144 | 0.0 |
SAH HOH |
8.851 4.662 |
ND2 O |
N6 O |
||
ASN | B:201 | B:182 | 25.0 | 0.156 | H | -56.3 | -41.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | C:201 | C:182 | 21.0 | 0.131 | H | -69.2 | -39.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | D:201 | D:182 | 20.0 | 0.125 | H | -63.2 | -35.8 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7ble | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-17 | ASN | A:201 | A:182 | 26.0 | 0.163 | H | -66.9 | -35.2 | 26.0 | 0.163 | 0.0 |
SAH HOH |
9.390 6.529 |
ND2 ND2 |
N6 O |
||
ASN | B:201 | B:182 | 28.0 | 0.175 | H | -58.5 | -37.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | C:201 | C:182 | 23.0 | 0.144 | H | -71.0 | -35.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | D:201 | D:182 | 20.0 | 0.125 | H | -58.0 | -42.5 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7nbj | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-17 | ASN | A:201 | A:182 | 23.0 | 0.144 | H | -61.8 | -39.2 | 23.0 | 0.144 | 0.0 |
U7H GOL HOH |
9.042 8.839 3.077 |
ND2 ND2 OD1 |
N33 O2 O |
||
ASN | B:201 | B:182 | 23.0 | 0.144 | H | -64.5 | -37.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | C:201 | C:182 | 22.0 | 0.138 | H | -59.5 | -39.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | D:201 | D:182 | 20.0 | 0.125 | H | -59.8 | -39.2 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7nbm | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-17 | ASN | A:201 | A:182 | 27.0 | 0.169 | H | -61.4 | -35.2 | 27.0 | 0.169 | 0.0 |
U7K HOH |
8.732 2.440 |
ND2 OD1 |
N33 O |
||
ASN | B:201 | B:182 | 21.0 | 0.131 | H | -68.3 | -41.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | C:201 | C:182 | 24.0 | 0.15 | H | -58.6 | -47.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | D:201 | D:182 | 25.0 | 0.156 | H | -63.6 | -25.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7nbq | 1 | P40261 | 98.86 | 0.0 |
X-RAY |
2021-03-17 | ASN | A:201 | A:182 | 23.0 | 0.144 | H | -60.6 | -40.6 | 23.0 | 0.144 | 0.0 |
SAH HOH |
8.882 3.120 |
ND2 OD1 |
N6 O |
||
ASN | B:201 | B:182 | 25.0 | 0.156 | H | -56.2 | -42.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | C:201 | C:182 | 22.0 | 0.138 | H | -60.8 | -37.1 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | D:201 | D:182 | 21.0 | 0.131 | H | -63.1 | -39.0 | NA | NA | NA | |||||||||||||
7egu | 1 | P40261 | 99.61 | 0.0 |
X-RAY |
2021-12-15 | ASN | A:181 | A:182 | 21.0 | 0.131 | H | -62.2 | -42.8 | 21.0 | 0.131 | 0.0 |
HOH |
2.934 |
ND2 |
O |
||
7ehz | 1 | P40261 | 99.61 | 0.0 |
X-RAY |
2021-12-15 | ASN | A:181 | A:182 | 18.0 | 0.113 | H | -68.3 | -37.7 | 18.0 | 0.113 | 0.0 |
HOH |
5.716 |
O |
O |
||
5xvq | 1 | F7ERX8 | 96.97 | 0.0 |
X-RAY |
2017-08-02 | ASN | A:202 | A:182 | 15.0 | 0.094 | H | -61.5 | -47.8 | 15.0 | 0.094 | 0.0 |
SAH HOH |
8.976 2.872 |
ND2 OD1 |
N6 O |
||
ASN | B:202 | B:182 | 13.0 | 0.081 | H | -64.1 | -41.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
2i62 | 1 | O55239 | 85.5 | 7e-168 |
X-RAY |
2006-09-12 | ASN | A:183 | A:183 | 21.0 | 0.131 | H | -57.9 | -49.5 | 21.0 | 0.131 | 0.0 |
SAH HOH |
9.036 3.676 |
ND2 OD1 |
N6 O |
||
ASN | B:183 | B:183 | 16.0 | 0.1 | H | -58.0 | -43.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | C:183 | C:183 | 0.0 | 0.0 | H | -58.6 | -47.7 | NA | NA | NA | |||||||||||||
ASN | D:183 | D:183 | 11.0 | 0.069 | H | -61.2 | -45.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
5xvk | 1 | O55239 | 85.5 | 2e-167 |
X-RAY |
2017-08-02 | ASN | A:202 | A:182 | 14.0 | 0.087 | H | -57.6 | -43.3 | 14.0 | 0.087 | 0.0 |
SAH HOH |
8.688 3.798 |
ND2 OD1 |
N6 O |
||
ASN | B:202 | B:182 | 21.0 | 0.131 | H | -59.3 | -45.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
5yji | 1 | O55239 | 85.5 | 2e-167 |
X-RAY |
2018-03-21 | ASN | A:202 | A:182 | 18.0 | 0.113 | H | -56.1 | -47.8 | 18.0 | 0.113 | 0.0 |
SAH HOH |
8.735 4.917 |
ND2 ND2 |
N6 O |
||
ASN | B:202 | B:182 | 20.0 | 0.125 | H | -57.8 | -41.5 | NA | NA | NA |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-p40261-f1 | 1 | P40261 | 100.0 | 0.0 | ASN | A:182 | A:182 | 21.0 | 0.131 | H | -64.7 | -42.1 |