Variant
| Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr11 | 85967514 | . | T | A | CCDS8273.1:NM_003797.3:c.512aTa>aAa_NP_003788.2:p.171I>K | Homo sapiens embryonic ectoderm development (EED), transcript variant 1, mRNA. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
|
|
PDB
| Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
| 6c23 | 4 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2018-01-24 | ILE | D:171 | L:171 | 32.0 | 0.183 | E | -132.2 | 143.7 | 7.0 | 0.04 | 0.143 |
K:Q15910:0.143 |
|||||
| 6c24 | 5 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2018-01-24 | ILE | E:171 | L:171 | 28.0 | 0.16 | E | -135.9 | 149.7 | 8.0 | 0.046 | 0.114 |
L:Q15910:0.114 |
|||||
| 6wkr | 3 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-02-03 | ILE | C:171 | L:171 | 36.0 | 0.206 | -102.9 | 153.0 | 10.0 | 0.057 | 0.149 |
E:Q15910:0.149 |
||||||
| 7kso | 2 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-02-03 | ILE | B:171 | B:171 | 32.0 | 0.183 | -114.5 | 150.4 | 0.0 | 0.0 | 0.183 |
A:Q92800:0.183 |
||||||
| 7ksr | 4 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-02-03 | ILE | D:171 | B:171 | 31.0 | 0.177 | E | -113.8 | 148.5 | 1.0 | 0.006 | 0.171 |
A:Q92800:0.171 |
|||||
| 7ktp | 2 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
EM |
2021-02-03 | ILE | B:171 | B:171 | 31.0 | 0.177 | E | -122.2 | 149.5 | 2.0 | 0.011 | 0.166 |
A:Q92800:0.166 |
|||||
| 5wg6 | 2 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2018-06-27 | ILE | B:172 | B:171 | 21.0 | 0.12 | -92.7 | 143.4 | 3.0 | 0.017 | 0.103 |
A:Q15910+Q15022:0.103 |
||||||
| ILE | D:172 | D:171 | 18.0 | 0.103 | E | -117.2 | 126.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 3jpx | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2009-10-20 | ILE | A:132 | A:171 | 18.0 | 0.103 | E | -109.0 | 126.2 | 18.0 | 0.103 | 0.0 |
HOH |
2.681 |
O |
O |
||
| 3jzg | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2009-12-15 | ILE | A:132 | A:171 | 16.0 | 0.091 | E | -114.5 | 130.7 | 16.0 | 0.091 | 0.0 |
HOH |
2.610 |
O |
O |
||
| 3jzh | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2009-12-15 | ILE | A:132 | A:171 | 16.0 | 0.091 | E | -112.4 | 126.2 | 16.0 | 0.091 | 0.0 |
HOH |
2.677 |
O |
O |
||
| 7kxt | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-02-24 | ILE | A:132 | A:171 | 34.0 | 0.194 | -109.3 | 131.0 | 34.0 | 0.194 | 0.0 |
UNX HOH |
4.592 2.493 |
CA O |
UNK O |
|||
| ILE | B:132 | B:171 | 32.0 | 0.183 | -110.9 | 130.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5wp3 | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-09-13 | ILE | A:98 | A:171 | 36.0 | 0.206 | E | -113.4 | 131.5 | 36.0 | 0.206 | 0.0 |
UNX UNX |
6.921 8.275 |
N N |
UNK UNK |
||
| 5h13 | 1 | O75530 | 99.19 | 0.0 |
X-RAY |
2017-01-25 | ILE | A:106 | A:171 | 19.0 | 0.109 | E | -117.0 | 131.4 | 19.0 | 0.109 | 0.0 |
HOH |
2.679 |
O |
O |
||
| 3jzn | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2009-12-15 | ILE | A:96 | A:171 | 16.0 | 0.091 | -110.6 | 127.8 | 16.0 | 0.091 | 0.0 |
HOH |
2.686 |
O |
O |
|||
| 3k26 | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2009-12-15 | ILE | A:96 | A:171 | 15.0 | 0.086 | E | -115.1 | 128.2 | 15.0 | 0.086 | 0.0 |
HOH |
2.731 |
O |
O |
||
| 3k27 | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2009-12-15 | ILE | A:96 | A:171 | 16.0 | 0.091 | E | -115.9 | 127.1 | 16.0 | 0.091 | 0.0 |
HOH |
2.679 |
O |
O |
||
| 6sfb | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2019-09-25 | ILE | A:96 | A:171 | 19.0 | 0.109 | -110.4 | 128.1 | 19.0 | 0.109 | 0.0 |
HOH |
2.712 |
O |
O |
|||
| ILE | B:96 | B:171 | 38.0 | 0.217 | E | -105.1 | 130.6 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 6sfc | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2019-09-25 | ILE | A:96 | A:171 | 56.0 | 0.32 | -111.3 | 129.0 | 56.0 | 0.32 | 0.0 |
HOH |
2.652 |
O |
O |
|||
| ILE | B:96 | B:171 | 35.0 | 0.2 | -115.8 | 132.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6yvi | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-05-12 | ILE | A:96 | A:171 | 18.0 | 0.103 | -104.1 | 130.1 | 18.0 | 0.103 | 0.0 |
HOH |
2.641 |
O |
O |
|||
| ILE | B:96 | B:171 | 36.0 | 0.206 | -103.8 | 130.8 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6yvj | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-05-12 | ILE | A:96 | A:171 | 20.0 | 0.114 | -116.2 | 128.1 | 20.0 | 0.114 | 0.0 |
HOH |
2.792 |
O |
O |
|||
| ILE | B:96 | B:171 | 36.0 | 0.206 | -112.2 | 131.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 7p3c | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-12-08 | ILE | A:96 | A:171 | 19.0 | 0.109 | -111.3 | 129.6 | 19.0 | 0.109 | 0.0 |
HOH |
2.662 |
O |
O |
|||
| ILE | B:96 | B:171 | 36.0 | 0.206 | E | -108.5 | 130.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7p3g | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-12-08 | ILE | A:96 | A:171 | 18.0 | 0.103 | -111.3 | 129.7 | 18.0 | 0.103 | 0.0 |
HOH |
2.603 |
O |
O |
|||
| ILE | B:96 | B:171 | 33.0 | 0.189 | E | -111.7 | 130.4 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 7p3j | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-12-08 | ILE | A:96 | A:171 | 25.0 | 0.143 | -111.3 | 129.4 | 25.0 | 0.143 | 0.0 |
HOH |
2.762 |
O |
O |
|||
| ILE | B:96 | B:171 | 35.0 | 0.2 | E | -105.2 | 129.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5gsa | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-02-01 | ILE | A:97 | A:171 | 38.0 | 0.217 | -105.1 | 132.6 | 38.0 | 0.217 | 0.0 |
HOH |
2.612 |
O |
O |
|||
| ILE | B:97 | B:171 | 21.0 | 0.12 | -111.1 | 125.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5h14 | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-01-25 | ILE | A:97 | A:171 | 30.0 | 0.171 | -116.9 | 130.0 | 30.0 | 0.171 | 0.0 |
HOH |
2.647 |
O |
O |
|||
| ILE | B:97 | B:171 | 33.0 | 0.189 | E | -111.5 | 129.9 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5h15 | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-01-25 | ILE | A:97 | A:171 | 30.0 | 0.171 | -111.4 | 128.1 | 30.0 | 0.171 | 0.0 |
HOH |
2.819 |
N |
O |
|||
| ILE | B:97 | B:171 | 35.0 | 0.2 | -111.0 | 124.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5h17 | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-01-25 | ILE | A:97 | A:171 | 30.0 | 0.171 | -104.7 | 125.9 | 30.0 | 0.171 | 0.0 |
HOH |
3.252 |
CD1 |
O |
|||
| 5h19 | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-01-25 | ILE | A:97 | A:171 | 36.0 | 0.206 | E | -109.5 | 127.6 | 36.0 | 0.206 | 0.0 |
HOH |
2.716 |
O |
O |
||
| 5h24 | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-01-25 | ILE | A:97 | A:171 | 33.0 | 0.189 | -111.2 | 122.0 | 33.0 | 0.189 | 0.0 |
HOH |
4.793 |
CA |
O |
|||
| ILE | B:97 | B:171 | 34.0 | 0.194 | E | -102.4 | 127.3 | NA | NA | NA | |||||||||||||
| 5h25 | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-01-25 | ILE | A:97 | A:171 | 35.0 | 0.2 | -113.1 | 128.2 | 35.0 | 0.2 | 0.0 | |||||||
| ILE | B:97 | B:171 | 31.0 | 0.177 | -106.1 | 129.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5ttw | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-01-11 | ILE | A:97 | A:171 | 38.0 | 0.217 | E | -114.9 | 124.9 | 38.0 | 0.217 | 0.0 |
HOH |
2.742 |
O |
O |
||
| ILE | C:97 | C:171 | 36.0 | 0.206 | -117.9 | 127.3 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5u5h | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-01-11 | ILE | A:97 | A:171 | 37.0 | 0.211 | E | -119.6 | 123.4 | 37.0 | 0.211 | 0.0 |
HOH |
2.718 |
O |
O |
||
| 5u5k | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-01-11 | ILE | A:97 | A:171 | 37.0 | 0.211 | E | -108.7 | 122.1 | 37.0 | 0.211 | 0.0 |
HOH |
2.867 |
O |
O |
||
| 5u5t | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-01-11 | ILE | A:97 | A:171 | 38.0 | 0.217 | -105.6 | 131.4 | 38.0 | 0.217 | 0.0 |
HOH |
2.711 |
O |
O |
|||
| ILE | B:97 | B:171 | 37.0 | 0.211 | -111.7 | 126.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5u62 | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-01-11 | ILE | A:97 | A:171 | 38.0 | 0.217 | -111.9 | 129.2 | 38.0 | 0.217 | 0.0 |
HOH |
2.783 |
O |
O |
|||
| ILE | B:97 | B:171 | 36.0 | 0.206 | -106.6 | 125.9 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6lo2 | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-07-07 | ILE | A:97 | A:171 | 32.0 | 0.183 | -121.1 | 136.2 | 32.0 | 0.183 | 0.0 |
HOH |
2.668 |
O |
O |
|||
| ILE | B:97 | B:171 | 35.0 | 0.2 | -112.7 | 133.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 6v3x | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-05-26 | ILE | A:97 | A:171 | 21.0 | 0.12 | -113.4 | 126.9 | 21.0 | 0.12 | 0.0 |
HOH |
2.824 |
O |
O |
|||
| 4x3e | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2015-01-21 | ILE | A:97 | A:171 | 21.0 | 0.12 | -122.9 | 125.0 | 21.0 | 0.12 | 0.0 |
HOH |
2.790 |
O |
O |
|||
| 5hyn | 2 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-05-11 | ILE | B:97 | B:171 | 25.0 | 0.143 | -115.9 | 137.0 | 2.0 | 0.011 | 0.132 |
A:Q15910:0.131 |
||||||
| ILE | G:97 | G:171 | 26.0 | 0.149 | -113.5 | 134.0 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | L:97 | L:171 | 20.0 | 0.114 | -110.7 | 137.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | Q:97 | R:171 | 23.0 | 0.131 | -112.7 | 134.5 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5ls6 | 2 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-02-22 | ILE | B:97 | B:171 | 28.0 | 0.16 | -118.9 | 127.5 | 3.0 | 0.017 | 0.143 |
A:Q15910:0.143 |
||||||
| ILE | E:97 | E:171 | 30.0 | 0.171 | -125.7 | 135.6 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | H:97 | H:171 | 22.0 | 0.126 | -115.5 | 129.7 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| ILE | K:97 | K:171 | 24.0 | 0.137 | -119.6 | 120.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5u69 | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-03-15 | ILE | A:99 | A:171 | 16.0 | 0.091 | E | -114.3 | 123.8 | 16.0 | 0.091 | 0.0 |
HOH |
2.732 |
O |
O |
||
| 5u6d | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-03-15 | ILE | A:99 | A:171 | 17.0 | 0.097 | E | -110.7 | 124.0 | 17.0 | 0.097 | 0.0 |
HOH |
2.748 |
O |
O |
||
| 5u8a | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-03-15 | ILE | A:99 | A:171 | 16.0 | 0.091 | E | -111.9 | 124.4 | 16.0 | 0.091 | 0.0 |
HOH |
2.708 |
O |
O |
||
| 5u8f | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-03-15 | ILE | A:99 | A:171 | 16.0 | 0.091 | E | -112.9 | 123.6 | 16.0 | 0.091 | 0.0 |
HOH |
2.722 |
O |
O |
||
| 3iiw | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2009-09-15 | ILE | A:95 | A:171 | 20.0 | 0.114 | E | -113.8 | 123.2 | 20.0 | 0.114 | 0.0 |
HOH |
2.771 |
O |
O |
||
| 5k0m | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-01-25 | ILE | A:102 | A:171 | 18.0 | 0.103 | E | -111.9 | 124.8 | 18.0 | 0.103 | 0.0 |
HOH |
2.731 |
O |
O |
||
| 5wuk | 1 | O75530 | 99.73 | 0.0 |
X-RAY |
2017-05-03 | ILE | A:96 | A:171 | 34.0 | 0.194 | -114.6 | 132.3 | 34.0 | 0.194 | 0.0 |
HOH |
2.689 |
O |
O |
|||
| 6u4y | 2 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2020-07-08 | ILE | D:96 | D:171 | 18.0 | 0.103 | -122.8 | 130.6 | 3.0 | 0.017 | 0.086 |
A:Q15910:0.086 |
||||||
| ILE | E:96 | E:171 | 26.0 | 0.149 | E | -121.9 | 143.2 | 11.0 | 0.063 | 0.086 |
B:Q15910:0.086 |
||||||||||||
| ILE | F:96 | F:171 | 22.0 | 0.126 | -115.1 | 131.7 | 11.0 | 0.063 | 0.063 |
C:Q15910:0.063 |
|||||||||||||
| 6w7f | 1 | O75530 | 99.73 | 0.0 |
X-RAY |
2020-07-08 | ILE | A:98 | A:171 | 20.0 | 0.114 | E | -115.8 | 126.6 | 20.0 | 0.114 | 0.0 |
GOL HOH |
5.426 2.724 |
N O |
H2 O |
||
| 6w7g | 1 | O75530 | 99.73 | 0.0 |
X-RAY |
2020-07-08 | ILE | A:98 | A:171 | 15.0 | 0.086 | E | -110.6 | 131.0 | 15.0 | 0.086 | 0.0 |
NA HOH |
7.243 2.759 |
CG2 O |
NA O |
||
| 7msb | 1 | O75530 | 99.73 | 0.0 |
X-RAY |
2021-10-20 | ILE | A:98 | A:171 | 16.0 | 0.091 | E | -116.4 | 128.1 | 16.0 | 0.091 | 0.0 |
HOH |
2.740 |
O |
O |
||
| 7msd | 1 | O75530 | 99.73 | 0.0 |
X-RAY |
2021-10-20 | ILE | A:98 | A:171 | 18.0 | 0.103 | E | -116.2 | 124.6 | 18.0 | 0.103 | 0.0 |
HOH |
2.742 |
O |
O |
||
| 3iiy | 1 | O75530 | 99.73 | 0.0 |
X-RAY |
2009-09-15 | ILE | A:95 | A:171 | 20.0 | 0.114 | E | -118.0 | 127.2 | 20.0 | 0.114 | 0.0 |
HOH |
2.628 |
O |
O |
||
| 3ij0 | 1 | O75530 | 99.73 | 0.0 |
X-RAY |
2009-09-15 | ILE | A:95 | A:171 | 19.0 | 0.109 | -116.6 | 124.5 | 19.0 | 0.109 | 0.0 |
HOH |
2.605 |
O |
O |
|||
| 3ij1 | 1 | O75530 | 99.73 | 0.0 |
X-RAY |
2009-09-15 | ILE | A:95 | A:171 | 15.0 | 0.086 | E | -112.0 | 129.5 | 15.0 | 0.086 | 0.0 |
HOH |
2.645 |
O |
O |
||
| 3ijc | 1 | O75530 | 99.73 | 0.0 |
X-RAY |
2009-09-15 | ILE | A:95 | A:171 | 19.0 | 0.109 | E | -116.3 | 126.9 | 19.0 | 0.109 | 0.0 |
HOH |
2.710 |
O |
O |
||
| 2qxv | 1 | Q921E6 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2007-08-28 | ILE | A:91 | A:170 | 18.0 | 0.103 | -119.5 | 138.7 | 18.0 | 0.103 | 0.0 |
HOH |
2.757 |
O |
O |
|||
| 4w2r | 2 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-12-27 | ILE | C:92 | E:157 | 20.0 | 0.114 | E | -125.3 | 139.1 | NA | NA | NA | ||||||
| ILE | D:92 | F:157 | 20.0 | 0.114 | E | -130.2 | 135.5 | 0.0 | 0.0 | 0.114 |
A:G1KPH4:0.114 |
||||||||||||
| 5ij7 | 2 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-05-04 | ILE | C:92 | E:157 | 17.0 | 0.097 | -106.5 | 130.8 | 0.0 | 0.0 | 0.097 |
A:G1KPH4+Q15910:0.097 |
||||||
| ILE | D:92 | F:157 | 17.0 | 0.097 | -107.0 | 131.1 | NA | NA | NA | ||||||||||||||
| 5ij8 | 2 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2016-05-04 | ILE | C:92 | E:157 | 15.0 | 0.086 | E | -121.9 | 131.2 | NA | NA | NA | ||||||
| ILE | D:92 | F:157 | 18.0 | 0.103 | E | -120.7 | 130.2 | 0.0 | 0.0 | 0.103 |
A:G1KPH4+Q15910:0.103 |
||||||||||||
| 6b3w | 2 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2017-12-27 | ILE | C:92 | E:157 | 20.0 | 0.114 | E | -135.0 | 133.1 | NA | NA | NA | ||||||
| ILE | D:92 | F:157 | 19.0 | 0.109 | E | -134.7 | 135.3 | 0.0 | 0.0 | 0.109 |
A:G1KPH4:0.109 |
||||||||||||
| 6v3y | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 |
X-RAY |
2021-05-26 | ILE | A:91 | A:171 | 17.0 | 0.097 | E | -111.6 | 126.2 | 17.0 | 0.097 | 0.0 |
HOH |
2.740 |
O |
O |
||
AlphaFold DB
| Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
| af-o75530-f1 | 1 | O75530 | 100.0 | 0.0 | ILE | A:171 | A:171 | 34.0 | 0.194 | E | -108.5 | 127.8 | |