Variant

Genome Chromosome Position VCF ID Ref Alt mRNA Change mRNA Info
GRCh37 chr12 14019049 . G A CCDS8662.1:NM_000834.3:c.94Ccc>Tcc_NP_000825.2:p.32P>S Homo sapiens glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2B (GRIN2B), mRNA.
pdb_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id
alphafold_id
label_asym_id
label_seq_id
label_comp_id
auth_asym_id
auth_seq_id

PDB

Entity Residue Monomer BioUnit Ligand View
PDB Entity Uniprot Identity Evalue ExpMethod Date Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ ASA rASA ΔASA Interaction Name Distance Atom(p) Atom(l)
7eu8 2 Q13224 100.0 0.0 EM
2021-07-28 PRO B:32 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO D:32 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6wi1 2 ? 99.28 0.0 EM
2020-07-15 PRO B:63 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO D:63 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5fxg 2 Q00960 98.91 0.0 EM
2016-05-11 PRO B:7 B:32 101.0 NA 360.0 -8.3 101.0 NA NA
PRO D:7 D:32 100.0 NA 360.0 -8.3 100.0 NA NA
5fxh 2 Q00960 98.91 0.0 EM
2016-05-11 PRO B:7 B:32 94.0 NA 360.0 105.7 94.0 NA NA
PRO D:7 D:32 95.0 NA 360.0 105.7 95.0 NA NA
5fxi 2 Q00960 98.91 0.0 EM
2016-05-11 PRO B:7 B:32 102.0 NA 360.0 21.3 102.0 NA NA
PRO D:7 D:32 101.0 NA 360.0 21.3 101.0 NA NA
5fxj 2 Q00960 98.91 0.0 EM
2016-05-25 PRO B:7 B:32 84.0 NA 360.0 41.7 84.0 NA NA
PRO D:7 D:32 84.0 NA 360.0 41.7 84.0 NA NA
5fxk 2 Q00960 98.91 0.0 EM
2016-05-11 PRO B:7 B:32 95.0 NA 360.0 111.4 95.0 NA NA
PRO D:7 D:32 92.0 NA 360.0 111.5 92.0 NA NA
6whr 2 Q00960 98.91 0.0 EM
2020-08-05 PRO B:63 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO D:63 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6whs 2 Q00960 98.91 0.0 EM
2020-08-05 PRO B:63 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO D:63 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6wht 2 Q00960 98.91 0.0 EM
2020-08-05 PRO B:63 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO D:63 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6whu 2 Q00960 98.91 0.0 EM
2020-08-05 PRO B:63 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO D:63 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6whv 2 Q00960 98.91 0.0 EM
2020-08-05 PRO B:63 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO D:63 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6whw 2 ? 98.91 0.0 EM
2020-07-15 PRO B:63 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO D:63 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6whx 2 ? 98.91 0.0 EM
2020-07-15 PRO B:63 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO D:63 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6why 2 ? 98.91 0.0 EM
2020-07-15 PRO B:63 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO D:63 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
6wi0 2 Q00960 98.91 0.0 EM
2020-07-15 PRO B:63 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
PRO D:63 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
4pe5 2 Q00960 97.82 0.0 X-RAY
2014-06-04 PRO B:6 B:32 93.0 0.641 S -59.0 119.2 93.0 0.641 0.0
PRO D:6 D:32 124.0 0.855 360.0 147.0 124.0 0.855 0.0
5ewj 2 Q13224 99.73 0.0 X-RAY
2016-03-02 PRO B:2 B:32 128.0 0.883 360.0 148.1 128.0 0.883 0.0 HOH
4.838
O
O
PRO D:2 D:32 142.0 0.979 360.0 -50.0 NA NA NA
5ewl 2 Q13224 99.73 0.0 X-RAY
2016-03-02 PRO B:2 B:32 123.0 0.848 360.0 150.8 123.0 0.848 0.0 HOH
3.067
N
O
PRO D:2 D:32 131.0 0.903 360.0 -74.4 NA NA NA
5ewm 2 Q13224 99.73 0.0 X-RAY
2016-03-02 PRO B:2 B:32 128.0 0.883 360.0 148.8 128.0 0.883 0.0 HOH
3.027
N
O
PRO D:2 D:32 142.0 0.979 360.0 -54.4 NA NA NA
3qel 2 Q00960 99.45 0.0 X-RAY
2011-06-15 PRO B:2 B:32 132.0 0.91 360.0 147.0 132.0 0.91 0.0
PRO D:2 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
3qem 2 Q00960 99.45 0.0 X-RAY
2011-06-15 PRO B:2 B:32 147.0 1.0 360.0 121.2 147.0 1.0 0.0
PRO D:2 NA:NA DO NA DO DO DO NA NA NA
5b3j 2 Q00960 99.45 0.0 X-RAY
2016-05-11 PRO C:2 C:32 33.0 0.228 -69.1 129.4 33.0 0.228 0.0 HOH
5.019
CD
O
PRO E:2 D:32 32.0 0.221 -68.4 129.9 NA NA NA
3jpw 1 Q00960 99.45 0.0 X-RAY
2009-12-08 PRO A:1 A:32 168.0 1.0 360.0 162.7 168.0 1.0 0.0
3jpy 1 Q00960 99.45 0.0 X-RAY
2009-12-08 PRO A:1 A:32 173.0 1.0 360.0 72.8 173.0 1.0 0.0
6e7r 2 Q00960 99.45 0.0 X-RAY
2019-01-30 PRO B:1 B:32 122.0 0.841 360.0 144.8 122.0 0.841 0.0
PRO D:1 D:32 116.0 0.8 360.0 150.2 NA NA NA
6e7s 2 Q00960 99.45 0.0 X-RAY
2019-01-30 PRO B:1 B:32 129.0 0.89 360.0 130.9 129.0 0.89 0.0
PRO D:1 D:32 130.0 0.897 360.0 134.0 NA NA NA
6e7t 2 Q00960 99.45 0.0 X-RAY
2019-01-30 PRO B:1 B:32 126.0 0.869 360.0 139.1 126.0 0.869 0.0
PRO D:1 D:32 123.0 0.848 360.0 136.8 NA NA NA
6e7u 2 Q00960 99.45 0.0 X-RAY
2019-01-30 PRO B:1 B:32 124.0 0.855 360.0 132.2 124.0 0.855 0.0
PRO D:1 D:32 126.0 0.869 360.0 125.0 NA NA NA
6e7v 2 Q00960 99.45 0.0 X-RAY
2019-01-30 PRO B:1 B:32 118.0 0.814 360.0 140.3 118.0 0.814 0.0
PRO D:1 D:32 114.0 0.786 360.0 160.5 NA NA NA
6e7w 2 Q00960 99.45 0.0 X-RAY
2019-01-30 PRO B:1 B:32 127.0 0.876 360.0 137.3 127.0 0.876 0.0
PRO D:1 D:32 125.0 0.862 360.0 139.4 NA NA NA
6e7x 2 Q00960 99.45 0.0 X-RAY
2019-01-30 PRO B:1 B:32 125.0 0.862 360.0 142.3 125.0 0.862 0.0
PRO D:1 D:32 124.0 0.855 360.0 137.0 NA NA NA
5tpz 2 Q00960 99.45 0.0 X-RAY
2016-12-14 PRO B:1 D:32 168.0 1.0 360.0 145.0 168.0 1.0 0.0

AlphaFold DB

Entity Residue Monomer View
ID Entity Uniprot Identity Evalue Name Label Auth ASA rASA SS φ ψ
af-q13224-f1 1 Q13224 100.0 0.0 PRO A:32 A:32 72.0 0.497 -49.0 136.3