Variant
Genome | Chromosome | Position | VCF ID | Ref | Alt | mRNA Change | mRNA Info | GRCh37 | chr12 | 54059117 | . | A | C | CCDS8863.2:NM_005176.5:c.578cTc>cGc_NP_005167.2:p.193L>R | Homo sapiens ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex subunit C2 (subunit 9) (ATP5G2), transcript variant 1, mRNA. |
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PDB
Entity | Residue | Monomer | BioUnit | Ligand | View | ||||||||||||||||||
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PDB | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | ExpMethod | Date | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | ASA | rASA | ΔASA | Interaction | Name | Distance | Atom(p) | Atom(l) | |
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K:P07926:0.253 |
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||||||||||||
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||||||||||||
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6z1u | 7 | P07926 | 100.0 | 3e-47 |
EM |
2020-09-09 | LEU | K:70 | K:70 | 102.0 | 0.6 | H | -73.8 | -45.0 | 102.0 | 0.6 | 0.0 | ||||||
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L:P07926:0.006 |
||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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EM |
2020-09-09 | LEU | B:70 | K:70 | 102.0 | 0.6 | H | -51.9 | -47.4 | 74.0 | 0.435 | 0.165 |
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||||||||||||
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C:P32876:0.082 |
||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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G:P32876:0.153 |
||||||||||||
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H:P32876:0.218 |
||||||||||||
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EM |
2020-09-09 | LEU | D:70 | R:70 | 101.0 | 0.594 | H | -59.9 | -45.2 | 66.0 | 0.388 | 0.206 |
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|||||
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||||||||||||
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F:P07926:0.188 |
||||||||||||
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G:P07926:0.194 |
||||||||||||
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||||||||||||
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I:P07926:0.176 |
||||||||||||
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H:P07926:0.241 |
||||||||||||
6zg8 | 4 | P07926 | 100.0 | 3e-47 |
EM |
2020-09-09 | LEU | D:70 | K:70 | 92.0 | 0.541 | H | -64.9 | -50.8 | 59.0 | 0.347 | 0.194 |
K:P07926:0.194 |
|||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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F:P07926:0.053 |
||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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LEU | K:70 | R:70 | 98.0 | 0.576 | H | -58.2 | -47.6 | 80.0 | 0.471 | 0.105 |
J:P07926:0.106 |
||||||||||||
6zik | 4 | P07926 | 100.0 | 3e-47 |
EM |
2020-09-09 | LEU | D:70 | K:70 | 98.0 | 0.576 | H | -58.5 | -39.2 | 91.0 | 0.535 | 0.041 |
J:P07926:0.041 |
|||||
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D:P07926:0.188 |
||||||||||||
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||||||||||||
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F:P07926:0.1 |
||||||||||||
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K:P07926:0.212 |
||||||||||||
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H:P07926:0.253 |
||||||||||||
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I:P07926:0.135 |
||||||||||||
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G:P07926:0.212 |
||||||||||||
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EM |
2020-09-09 | LEU | I:70 | M:70 | 77.0 | 0.453 | H | -55.5 | -50.8 | 77.0 | 0.453 | 0.0 | ||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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EM |
2020-09-09 | LEU | I:70 | R:70 | 90.0 | 0.529 | H | -49.1 | -60.3 | 90.0 | 0.529 | 0.0 | ||||||
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||||||||||||
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B:P00847:0.376 J:P07926:0.153 |
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2020-09-09 | LEU | B:70 | K:70 | 112.0 | 0.659 | H | -61.5 | -30.2 | 96.0 | 0.565 | 0.094 |
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|||||
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B:F1RWF6:0.041 |
||||||||||||
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C:F1RWF6:0.041 |
||||||||||||
LEU | E:70 | N:70 | 96.0 | 0.565 | H | -56.5 | -53.0 | 96.0 | 0.565 | 0.0 | |||||||||||||
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E:F1RWF6:0.071 |
||||||||||||
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F:F1RWF6:0.076 |
||||||||||||
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||||||||||||
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J:Q35915:0.188 H:F1RWF6:0.206 |
||||||||||||
6zna | 2 | F1RWF6 | 100.0 | 3e-47 |
EM |
2020-09-09 | LEU | B:70 | AK:70 | 48.0 | NA | H | -57.2 | -58.8 | 48.0 | NA | NA | ||||||
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LEU | F:70 | AO:70 | 89.0 | 0.524 | H | -72.3 | -47.4 | 86.0 | 0.506 | 0.018 |
J:Q35915:0.018 |
||||||||||||
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LEU | S:70 | BK:70 | 56.0 | NA | H | -63.5 | -41.4 | 56.0 | NA | NA | |||||||||||||
LEU | T:70 | BL:70 | 55.0 | NA | I | -52.4 | -54.8 | 55.0 | NA | NA | |||||||||||||
LEU | U:70 | BM:70 | 48.0 | NA | H | -57.2 | -58.8 | 48.0 | NA | NA | |||||||||||||
LEU | V:70 | BN:70 | 57.0 | NA | H | -60.3 | -65.3 | 57.0 | NA | NA | |||||||||||||
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LEU | X:70 | BP:70 | 54.0 | NA | H | -40.4 | -41.8 | 54.0 | NA | NA | |||||||||||||
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LEU | JA:70 | CK:70 | 49.0 | NA | H | -57.2 | -58.9 | 49.0 | NA | NA | |||||||||||||
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LEU | ZA:70 | K:70 | 74.0 | NA | H | -54.5 | -27.1 | 74.0 | NA | NA | |||||||||||||
LEU | AB:70 | L:70 | 57.0 | NA | H | -63.7 | -41.4 | 57.0 | NA | NA | |||||||||||||
LEU | BB:70 | M:70 | 56.0 | NA | I | -52.5 | -54.7 | 56.0 | NA | NA | |||||||||||||
LEU | CB:70 | N:70 | 47.0 | NA | H | -57.2 | -59.0 | 47.0 | NA | NA | |||||||||||||
LEU | DB:70 | O:70 | 57.0 | NA | H | -60.2 | -65.5 | 57.0 | NA | NA | |||||||||||||
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LEU | GB:70 | R:70 | 55.0 | NA | H | -72.2 | -47.4 | 55.0 | NA | NA | |||||||||||||
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EM |
2020-09-09 | LEU | L:70 | K:70 | 115.0 | 0.676 | H | -65.9 | -48.4 | 98.0 | 0.576 | 0.1 |
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|||||
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M:P32876:0.147 |
||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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||||||||||||
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7aje | 8 | P07926 | 100.0 | 3e-47 |
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||||||||||||
LEU | CA:69 | R:70 | 122.0 | 0.718 | H | -80.5 | -47.1 | 95.0 | 0.559 | 0.159 |
BA:Q4VT52:0.159 |
||||||||||||
LEU | ZA:69 | AK:70 | 121.0 | 0.712 | H | -68.3 | -30.2 | 109.0 | 0.641 | 0.071 |
GB:Q4VT52:0.071 |
||||||||||||
LEU | AB:69 | AL:70 | 137.0 | 0.806 | H | -80.8 | -12.0 | 137.0 | 0.806 | 0.0 | |||||||||||||
LEU | BB:69 | AM:70 | 129.0 | 0.759 | H | -75.7 | -8.2 | 129.0 | 0.759 | 0.0 | |||||||||||||
LEU | CB:69 | AN:70 | 114.0 | 0.671 | H | -66.6 | -32.2 | 66.0 | 0.388 | 0.283 |
BB:Q4VT52:0.065 XA:Q35914:0.153 YA:Q35915:0.065 |
||||||||||||
LEU | DB:69 | AO:70 | 99.0 | 0.582 | H | -74.1 | -24.0 | 36.0 | 0.212 | 0.37 |
CB:Q4VT52:0.171 YA:Q35915:0.2 |
||||||||||||
LEU | EB:69 | AP:70 | 117.0 | 0.688 | H | -74.2 | -24.2 | 87.0 | 0.512 | 0.176 |
DB:Q4VT52:0.176 |
||||||||||||
LEU | FB:69 | AQ:70 | 124.0 | 0.729 | H | -72.7 | -32.9 | 122.0 | 0.718 | 0.011 |
EB:Q4VT52:0.012 |
||||||||||||
LEU | GB:69 | AR:70 | 123.0 | 0.724 | H | -80.5 | -47.2 | 95.0 | 0.559 | 0.165 |
FB:Q4VT52:0.165 |
||||||||||||
LEU | DC:69 | BK:70 | 120.0 | 0.706 | H | -68.3 | -30.2 | 107.0 | 0.629 | 0.077 |
KC:Q4VT52:0.076 |
||||||||||||
LEU | EC:69 | BL:70 | 135.0 | 0.794 | H | -80.7 | -12.1 | 135.0 | 0.794 | 0.0 | |||||||||||||
LEU | FC:69 | BM:70 | 130.0 | 0.765 | H | -75.8 | -8.0 | 130.0 | 0.765 | 0.0 | |||||||||||||
LEU | GC:69 | BN:70 | 113.0 | 0.665 | H | -66.6 | -32.3 | 85.0 | 0.5 | 0.165 |
FC:Q4VT52:0.065 BC:Q35914:0.1 |
||||||||||||
LEU | HC:69 | BO:70 | 118.0 | 0.694 | H | -74.1 | -24.1 | 50.0 | 0.294 | 0.4 |
CC:Q35915:0.229 GC:Q4VT52:0.171 |
||||||||||||
LEU | IC:69 | BP:70 | 115.0 | 0.676 | H | -74.3 | -24.1 | 86.0 | 0.506 | 0.17 |
HC:Q4VT52:0.171 |
||||||||||||
LEU | JC:69 | BQ:70 | 124.0 | 0.729 | H | -72.7 | -33.0 | 122.0 | 0.718 | 0.011 |
IC:Q4VT52:0.012 |
||||||||||||
LEU | KC:69 | BR:70 | 124.0 | 0.729 | H | -80.5 | -47.2 | 97.0 | 0.571 | 0.158 |
JC:Q4VT52:0.159 |
||||||||||||
LEU | HD:69 | CK:70 | 120.0 | 0.706 | H | -68.4 | -30.1 | 108.0 | 0.635 | 0.071 |
OD:Q4VT52:0.071 |
||||||||||||
LEU | ID:69 | CL:70 | 137.0 | 0.806 | H | -80.7 | -12.0 | 137.0 | 0.806 | 0.0 | |||||||||||||
LEU | JD:69 | CM:70 | 131.0 | 0.771 | H | -75.8 | -8.1 | 131.0 | 0.771 | 0.0 | |||||||||||||
LEU | KD:69 | CN:70 | 116.0 | 0.682 | H | -66.5 | -32.3 | 87.0 | 0.512 | 0.17 |
FD:Q35914:0.106 JD:Q4VT52:0.065 |
||||||||||||
LEU | LD:69 | CO:70 | 116.0 | 0.682 | H | -74.0 | -24.1 | 47.0 | 0.276 | 0.406 |
KD:Q4VT52:0.176 GD:Q35915:0.224 |
||||||||||||
LEU | MD:69 | CP:70 | 115.0 | 0.676 | H | -74.3 | -24.1 | 84.0 | 0.494 | 0.182 |
LD:Q4VT52:0.182 |
||||||||||||
LEU | ND:69 | CQ:70 | 122.0 | 0.718 | H | -72.8 | -32.9 | 120.0 | 0.706 | 0.012 |
MD:Q4VT52:0.012 |
||||||||||||
LEU | OD:69 | CR:70 | 123.0 | 0.724 | H | -80.5 | -47.3 | 95.0 | 0.559 | 0.165 |
ND:Q4VT52:0.165 |
AlphaFold DB
Entity | Residue | Monomer | View | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Entity | Uniprot | Identity | Evalue | Name | Label | Auth | ASA | rASA | SS | φ | ψ | |
af-q06055-f1 | 1 | Q06055 | 100.0 | 2e-96 | LEU | A:136 | A:136 | 87.0 | 0.512 | H | -61.8 | -40.7 |